Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489003
- Subject:
- XM_011250207.2
- Aligned Length:
- 1776
- Identities:
- 1386
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
|||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------------ATG 3
Query 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||.|||||||.||||..||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 4 GAGCTGGAGGAGGCCTTCCGCCTGGTCTGTCAGGGCAGGGACGAAGTGCTCATCATTCATGTTTTCCCAAGCAT 77
Query 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
|||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 78 CCCAGAGCAGCCGGGCATGCCTTGTCCTGGAGAAGACAAGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAGGA 151
Query 371 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 444
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 152 AGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCAGC 225
Query 445 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 518
||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 226 GAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGCCA 299
Query 519 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 592
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 300 CGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGACA 373
Query 593 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 666
|||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 374 AGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATGAT 447
Query 667 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
|..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 448 AATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGGCT 521
Query 741 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 814
.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 522 GGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTTGA 595
Query 815 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 888
||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 596 AGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACTGG 669
Query 889 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 962
||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 670 GTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTCCA 743
Query 963 GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 1036
|||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 817
Query 1037 GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG 1110
|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 818 GAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGAGG 891
Query 1111 GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA 1184
||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 892 GGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGACTA 965
Query 1185 CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC 1258
||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 966 CGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGCCC 1039
Query 1259 CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG 1332
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1040 CCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGATG 1113
Query 1333 ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT 1406
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1114 ATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAAGT 1187
Query 1407 GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA 1480
.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1188 TATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTTAA 1261
Query 1481 ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC 1554
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1262 ATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCTTC 1335
Query 1555 CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA 1628
||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1336 CGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGACTA 1409
Query 1629 CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA 1702
.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1410 TGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCATAA 1483
Query 1703 AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG 1776
||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1484 AGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCGTG 1557