Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489018
• Subject: XM_017024756.1
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1116
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  ATGAGCTCGCGGAAGCTGAGCGGGCCGAAAGGCAGGAGGCTCAGCATACACGTCGTGACTTGGAACGTGGCTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCAGCGCCCCCTCTAGATCTCAGTGACCTGCTTCAGCTGAACAACCGGAACCTCAATCTTGACATATATGTTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGGTTTGCAGGAATTGAACTCTGGGATCATAAGCCTCCTTTCCGATGCTGCCTTTAATGACTCGTGGAGCAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTCCTCATGGATGTGCTTTCCCCTCTGAGCTTCATCAAGGTCTCCCATGTCCGTATGCAGGGGATCCTCTTACT  296
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGGATGTGCTTTCCCCTCTGAGCTTCATCAAGGTCTCCCATGTCCGTATGCAGGGGATCCTCTTACT  68

Query  297  GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG  142

Query  371  GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC  216

Query  445  CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG  290

Query  519  TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG  364

Query  593  AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG  438

Query  667  CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA  512

Query  741  CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC  586

Query  815  TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT  660

Query  889  CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA  734

Query  963  GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA  808

Query 1037  TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG  882

Query 1111  CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA  956

Query 1185  GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC  1030

Query 1259  GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA  1104

Query 1333  CAGCCACAGATC  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1105  CAGCCACAGATC  1116