Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489018
• Subject: XM_017024757.2
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1068
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGAGCTCGCGGAAGCTGAGCGGGCCGAAAGGCAGGAGGCTCAGCATACACGTCGTGACTTGGAACGTGGCTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCAGCGCCCCCTCTAGATCTCAGTGACCTGCTTCAGCTGAACAACCGGAACCTCAATCTTGACATATATGTTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGGTTTGCAGGAATTGAACTCTGGGATCATAAGCCTCCTTTCCGATGCTGCCTTTAATGACTCGTGGAGCAGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTCCTCATGGATGTGCTTTCCCCTCTGAGCTTCATCAAGGTCTCCCATGTCCGTATGCAGGGGATCCTCTTACT  296
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGCAGGGGATCCTCTTACT  20

Query  297  GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   21  GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG  94

Query  371  GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC  168

Query  445  CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG  242

Query  519  TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG  316

Query  593  AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG  390

Query  667  CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA  464

Query  741  CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC  538

Query  815  TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539  TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT  612

Query  889  CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA  686

Query  963  GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA  760

Query 1037  TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG  834

Query 1111  CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA  908

Query 1185  GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC  982

Query 1259  GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA  1056

Query 1333  CAGCCACAGATC  1344
            ||||||||||||
Sbjct 1057  CAGCCACAGATC  1068