Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489042
• Subject: XM_011516927.2
• Aligned Length: 1717
• Identities: 1527
• Gaps: 164

Alignment

Query    1  ATGTGCACCGTAG---TGGACCCTCGCATTGT-----CCGGAGATACCTACTCAGGCGGCAGCTCGGGC-----  61
            |||    ||..||   .||||     ||..||     |.|.|||.|||       |.|||||   ||||     
Sbjct    1  ATG----CCAGAGGCTGGGAC-----CAGGGTGGGGGCAGAAGAGACC-------GTGGCAG---GGGCTAGAT  55

Query   62  -----AGG-------GGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC  123
                 |||       .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  TCTGGAGGAATCTGAAGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC  129

Query  124  AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGA  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130  AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGA  203

Query  198  GTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGG  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  GTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGG  277

Query  272  TGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGC  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  TGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGC  351

Query  346  TCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCC  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCC  425

Query  420  GTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACC  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  GTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACC  499

Query  494  TCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTG  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  TCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTG  573

Query  568  CTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGG  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  CTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGG  647

Query  642  GAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTG  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  GAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTG  721

Query  716  AGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  AGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAG  795

Query  790  ACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGC  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  ACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGC  869

Query  864  CCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACG  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  CCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACG  943

Query  938  AGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGC  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  AGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGC  1017

Query 1012  CGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTC  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  CGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTC  1091

Query 1086  CCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCA  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCA  1165

Query 1160  GACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCC  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  GACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCC  1239

Query 1234  AGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGC  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  AGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGC  1313

Query 1308  GCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGG  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  GCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGG  1387

Query 1382  CTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAA  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  CTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAA  1461

Query 1456  CAGGT--------------------CCCTCCCCGGCTTCCTCCGGAGG----------------CCCGGCCCGG  1493
            |||||                    ||.||||| .|.||||||                     |||  |||.|
Sbjct 1462  CAGGTAAGCCCGGCCCAGTCTGCCCCCGTCCCC-TCATCCTCC-----TTTCCCCTTTCCCCTTCCC--CCCTG  1527

Query 1494  CCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTT--GCAGGGTGCCCAGGGGGGTG------------CCAGGGCTTT---  1550
            |       |.|||    ||||  ||||  .||.|.|.||||     .||            ||||    ||   
Sbjct 1528  C-------TTTTC----CCTC--CCTTCCCCATGCTTCCCA-----TTGCCCCTCCAATGTCCAG----TTCAA  1579

Query 1551  -GCT-TGGAGGCTACTCCCAA-GCCTACGGGACTGTCTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCC-CTGCTGGAG  1620
             .|| |.||||  || |.||| ||||             ||.|||  |||||   ||||  ||| |||.|    
Sbjct 1580  ATCTCTCGAGG--AC-CTCAAGGCCT-------------CCCCTC--CACTG---CACC--CCCTCTGAT----  1626

Query 1621  GGGCACC---ATGTG  1632
             |||.||   |||  
Sbjct 1627  -GGCCCCTTTATG--  1638