Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489043
• Subject: NM_001281749.3
• Aligned Length: 4107
• Identities: 3465
• Gaps: 642

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGAGCGGAGCTGGCGGGGCTGCCGGGGCCGGGACTGGGGGAGCCGGGCCCGCGGGCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCTGCCTCCGCCCGCGCCGGGGTCCCCAGCCGCCCCCGCTGCCGTGTCCCCTGCGGCCGGCCAGCCGCGTC  148

Query    1  --------------------------ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  48
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCAGCCCCGGCCTCCCGCGGACCCATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  222

Query   49  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  296

Query  123  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  370

Query  197  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  444

Query  271  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  518

Query  345  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  592

Query  419  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  666

Query  493  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  740

Query  567  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  814

Query  641  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  888

Query  715  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  962

Query  789  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  1036

Query  863  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGAT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1037  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTG------------------  1092

Query  937  GCCTATGATCACTATAGTGCAATCTACAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGG  1010
                                                                                      
Sbjct 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092

Query 1011  AGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCCTGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1084
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  ----------------------------------------------------CAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1114

Query 1085  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1188

Query 1159  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1262

Query 1233  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1336

Query 1307  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1410

Query 1381  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1484

Query 1455  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1558

Query 1529  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1632

Query 1603  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGA-------------------------------------------  1633
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1633  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGAC  1706

Query 1634  --------------------------------------------------------------------------  1633
                                                                                      
Sbjct 1707  CAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGGACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGC  1780

Query 1634  ---------------------------GCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT  1680
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  CTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCATCGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT  1854

Query 1681  TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG  1928

Query 1755  CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG  2002

Query 1829  AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA  2076

Query 1903  CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT  1976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT  2150

Query 1977  CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT  2050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151  CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT  2224

Query 2051  TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225  TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC  2298

Query 2125  CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT  2198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2299  CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT  2372

Query 2199  GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG  2272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373  GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG  2446

Query 2273  ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT  2346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447  ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT  2520

Query 2347  CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT  2420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521  CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT  2594

Query 2421  GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATT  2494
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct 2595  GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCA--------------------------------------------------  2618

Query 2495  TACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTC  2568
                                                                                      
Sbjct 2619  --------------------------------------------------------------------------  2618

Query 2569  TCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCC  2642
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 2619  --------------------------------------------------------CAGTGCACATCAGCAGCC  2636

Query 2643  GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC  2716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637  GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC  2710

Query 2717  AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC  2790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711  AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC  2784

Query 2791  CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA  2864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785  CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA  2858

Query 2865  AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA  2938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859  AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA  2932

Query 2939  GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG  3012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933  GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG  3006

Query 3013  CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC  3086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3007  CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC  3080

Query 3087  GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA  3160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081  GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA  3154

Query 3161  AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCT  3234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3155  AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCT  3228

Query 3235  GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC  3308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229  GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC  3302

Query 3309  ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG  3382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3303  ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG  3376

Query 3383  CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG  3456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3377  CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG  3450

Query 3457  GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG  3530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451  GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG  3524

Query 3531  TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCA  3604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3525  TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCA  3598

Query 3605  GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT  3678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599  GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT  3672

Query 3679  GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA  3752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3673  GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA  3746

Query 3753  CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG  3789
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3747  CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG  3783