Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489043
- Subject:
- XM_011542724.2
- Aligned Length:
- 3933
- Identities:
- 3486
- Gaps:
- 447
Alignment
Query 1 ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAGGGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAAGACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCCATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGGGAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------ATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC 67
Query 371 GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT 141
Query 445 TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC 215
Query 519 TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC 289
Query 593 TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC 363
Query 667 CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG 437
Query 741 CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA 511
Query 815 TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG 585
Query 889 GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA 659
Query 963 CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC 733
Query 1037 TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG 807
Query 1111 CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA 881
Query 1185 GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG 955
Query 1259 AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG 1029
Query 1333 GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA 1103
Query 1407 GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG 1177
Query 1481 ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC 1251
Query 1555 ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGT 1325
Query 1629 GCAGA--------------------------------------------------------------------- 1633
|||||
Sbjct 1326 GCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGACCAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGG 1399
Query 1634 -------------------------------------------------------------------------- 1633
Sbjct 1400 ACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGCCTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCAT 1473
Query 1634 -GCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGA 1706
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 CGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGA 1547
Query 1707 TGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGC 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGC 1621
Query 1781 AGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAG 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 AGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAG 1695
Query 1855 CAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCC 1928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 CAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCC 1769
Query 1929 TCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAA 2002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 TCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAA 1843
Query 2003 GGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCC 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844 GGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCC 1917
Query 2077 CCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAG 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 CCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAG 1991
Query 2151 TGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGC 2224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992 TGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGC 2065
Query 2225 AGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACA 2298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 AGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACA 2139
Query 2299 GCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAA 2372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140 GCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAA 2213
Query 2373 CCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACA 2446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 CCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACA 2287
Query 2447 GCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAG 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 GCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAG 2361
Query 2521 TCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCC 2594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362 TCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCC 2435
Query 2595 TCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTAC 2668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 TCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTAC 2509
Query 2669 AGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTG 2742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 AGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTG 2583
Query 2743 CTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAA 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584 CTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAA 2657
Query 2817 AAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACA 2890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658 AAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACA 2731
Query 2891 TGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCT 2964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732 TGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCT 2805
Query 2965 TATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGT 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 TATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGT 2879
Query 3039 CTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGG 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 CTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGG 2953
Query 3113 AGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGT 3186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 AGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGT 3027
Query 3187 TGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCA 3260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 TGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCA 3101
Query 3261 TGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCA 3334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 TGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCA 3175
Query 3335 GAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGG 3408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 GAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGG 3249
Query 3409 CTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCA 3482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250 CTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCA 3323
Query 3483 GAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCT 3556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3324 GAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCT 3397
Query 3557 CTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAAT 3630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 CTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAAT 3471
Query 3631 GAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTC 3704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 GAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTC 3545
Query 3705 TTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGC 3778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3546 TTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGC 3619
Query 3779 AGGCAGGCGTG 3789
|||||||||||
Sbjct 3620 AGGCAGGCGTG 3630