Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489043
• Subject: XM_017017424.1
• Aligned Length: 3963
• Identities: 3465
• Gaps: 498

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGAGCGGAGCTGGCGGGGCTGCCGGGGCCGGGACTGGGGGAGCCGGGCCCGCGGGCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCTGCCTCCGCCCGCGCCGGGGTCCCCAGCCGCCCCCGCTGCCGTGTCCCCTGCGGCCGGCCAGCCGCGTC  148

Query    1  --------------------------ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  48
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCAGCCCCGGCCTCCCGCGGACCCATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  222

Query   49  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  296

Query  123  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  370

Query  197  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  444

Query  271  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  518

Query  345  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  592

Query  419  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  666

Query  493  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  740

Query  567  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  814

Query  641  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  888

Query  715  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  962

Query  789  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  1036

Query  863  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGAT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1037  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTG------------------  1092

Query  937  GCCTATGATCACTATAGTGCAATCTACAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGG  1010
                                                                                      
Sbjct 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092

Query 1011  AGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCCTGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1084
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  ----------------------------------------------------CAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1114

Query 1085  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1188

Query 1159  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1262

Query 1233  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1336

Query 1307  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1410

Query 1381  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1484

Query 1455  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1558

Query 1529  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1632

Query 1603  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGA  1676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGA  1706

Query 1677  GCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAA  1750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  GCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAA  1780

Query 1751  TGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATT  1824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  TGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATT  1854

Query 1825  GATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCA  1898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  GATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCA  1928

Query 1899  GCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAG  1972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  GCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAG  2002

Query 1973  CCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCAT  2046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  CCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCAT  2076

Query 2047  CTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTC  2120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  CTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTC  2150

Query 2121  TTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCA  2194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151  TTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCA  2224

Query 2195  ACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCT  2268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225  ACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCT  2298

Query 2269  GTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGC  2342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2299  GTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGC  2372

Query 2343  TGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGC  2416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373  TGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGC  2446

Query 2417  AGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCG  2490
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 2447  AGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCA----------------------------------------------  2474

Query 2491  CATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGG  2564
                                                                                      
Sbjct 2475  --------------------------------------------------------------------------  2474

Query 2565  GTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGC  2638
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct 2475  ------------------------------------------------------------CAGTGCACATCAGC  2488

Query 2639  AGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACAC  2712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489  AGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACAC  2562

Query 2713  CAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCT  2786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563  CAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCT  2636

Query 2787  GCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAAC  2860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637  GCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAAC  2710

Query 2861  AGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGA  2934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711  AGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGA  2784

Query 2935  CAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCA  3008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785  CAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCA  2858

Query 3009  TCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACC  3082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859  TCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACC  2932

Query 3083  AGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGAC  3156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933  AGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGAC  3006

Query 3157  AGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGA  3230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3007  AGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGA  3080

Query 3231  CCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTG  3304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081  CCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTG  3154

Query 3305  CTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGA  3378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3155  CTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGA  3228

Query 3379  CAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCC  3452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229  CAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCC  3302

Query 3453  CCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAA  3526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3303  CCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAA  3376

Query 3527  TGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATG  3600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3377  TGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATG  3450

Query 3601  GGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCT  3674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451  GGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCT  3524

Query 3675  GAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACA  3748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3525  GAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACA  3598

Query 3749  AGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG  3789
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599  AGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG  3639