Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489043
• Subject: XM_017017425.1
• Aligned Length: 3933
• Identities: 3486
• Gaps: 447

Alignment

Query    1  ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAGGGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAAGACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCCATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGGGAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC  370
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------ATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC  67

Query  371  GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT  141

Query  445  TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC  215

Query  519  TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC  289

Query  593  TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC  363

Query  667  CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG  437

Query  741  CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA  511

Query  815  TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG  585

Query  889  GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA  659

Query  963  CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC  733

Query 1037  TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG  807

Query 1111  CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA  881

Query 1185  GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG  955

Query 1259  AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG  1029

Query 1333  GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA  1103

Query 1407  GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG  1177

Query 1481  ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC  1251

Query 1555  ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGT  1325

Query 1629  GCAGA---------------------------------------------------------------------  1633
            |||||                                                                     
Sbjct 1326  GCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGACCAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGG  1399

Query 1634  --------------------------------------------------------------------------  1633
                                                                                      
Sbjct 1400  ACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGCCTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCAT  1473

Query 1634  -GCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGA  1706
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  CGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGA  1547

Query 1707  TGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGC  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  TGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGC  1621

Query 1781  AGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAG  1854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  AGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAG  1695

Query 1855  CAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCC  1928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696  CAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCC  1769

Query 1929  TCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAA  2002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770  TCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAA  1843

Query 2003  GGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCC  2076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844  GGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCC  1917

Query 2077  CCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAG  2150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918  CCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAG  1991

Query 2151  TGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGC  2224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992  TGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGC  2065

Query 2225  AGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACA  2298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066  AGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACA  2139

Query 2299  GCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAA  2372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140  GCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAA  2213

Query 2373  CCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACA  2446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214  CCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACA  2287

Query 2447  GCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAG  2520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288  GCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAG  2361

Query 2521  TCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCC  2594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362  TCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCC  2435

Query 2595  TCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTAC  2668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436  TCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCACTAC  2509

Query 2669  AGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTG  2742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510  AGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTG  2583

Query 2743  CTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAA  2816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584  CTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAA  2657

Query 2817  AAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACA  2890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658  AAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACA  2731

Query 2891  TGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCT  2964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732  TGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCT  2805

Query 2965  TATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGT  3038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806  TATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGT  2879

Query 3039  CTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGG  3112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880  CTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGG  2953

Query 3113  AGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGT  3186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954  AGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGT  3027

Query 3187  TGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCA  3260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028  TGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCA  3101

Query 3261  TGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCA  3334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102  TGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCA  3175

Query 3335  GAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGG  3408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176  GAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGG  3249

Query 3409  CTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCA  3482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250  CTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGATCCA  3323

Query 3483  GAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCT  3556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3324  GAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCT  3397

Query 3557  CTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAAT  3630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398  CTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAAT  3471

Query 3631  GAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTC  3704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472  GAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTC  3545

Query 3705  TTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGC  3778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3546  TTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGC  3619

Query 3779  AGGCAGGCGTG  3789
            |||||||||||
Sbjct 3620  AGGCAGGCGTG  3630