Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489043
- Subject:
- XM_017017427.1
- Aligned Length:
- 3795
- Identities:
- 2159
- Gaps:
- 1635
Alignment
Query 1 ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAGGGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAAGACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCCATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGGGAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG 1110
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1111 CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA 1184
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1185 GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG 1258
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1259 AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG 1332
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1333 GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA 1406
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1407 GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG 1480
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1481 ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC 1554
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1555 ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAG---- 1624
|.|
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------ATGTCAT 7
Query 1625 --CTGTGCAGAGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCC 1696
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 TTCT--------CTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCC 73
Query 1697 GGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATC 1770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATC 147
Query 1771 AAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAA 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 AAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAA 221
Query 1845 GACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTA 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTA 295
Query 1919 TCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTC 1992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 TCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTC 369
Query 1993 CAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAA 2066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAA 443
Query 2067 TAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTAC 2140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTAC 517
Query 2141 CTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTG 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTG 591
Query 2215 GGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACAT 2288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACAT 665
Query 2289 GCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGC 2362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGC 739
Query 2363 ACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCA 2436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCA 813
Query 2437 GAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTT 2510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTT 887
Query 2511 TTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCC 2584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 TTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCC 961
Query 2585 TGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACG 2658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACG 1035
Query 2659 TCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCT 2732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCT 1109
Query 2733 TCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCAC 2806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCAC 1183
Query 2807 AGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTG 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTG 1257
Query 2881 TTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCA 2954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCA 1331
Query 2955 GGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCAC 3028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 GGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCAC 1405
Query 3029 AAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCA 3102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 AAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCA 1479
Query 3103 GAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATT 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATT 1553
Query 3177 GACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAA 3250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAA 1627
Query 3251 CTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAG 3324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 CTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAG 1701
Query 3325 GTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGA 3398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGA 1775
Query 3399 TCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACC 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACC 1849
Query 3473 ACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAA 3546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 ACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAA 1923
Query 3547 GCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGA 3620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGA 1997
Query 3621 TGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATT 3694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 TGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATT 2071
Query 3695 TAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTC 3768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 TAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTC 2145
Query 3769 AGCATGGAGCAGGCAGGCGTG 3789
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 AGCATGGAGCAGGCAGGCGTG 2166
