Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489060
- Subject:
- XM_017017427.1
- Aligned Length:
- 3942
- Identities:
- 2160
- Gaps:
- 1779
Alignment
Query 1 ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAGGGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAAGACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCCATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGGGAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGTCACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATGCCAATCTGAATATCAAAATAGCAGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGGTGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTGGAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGCGGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCATATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGACGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAA 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGAATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAG 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 GACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGATGCCTATGATCACTATAGTGCAATCTA 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGGAGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCC 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 TGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTGCTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTG 1110
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1111 CAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTGAATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGA 1184
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1185 GCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACACAGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGG 1258
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1259 AAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCAACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTG 1332
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1333 GCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTGCAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAA 1406
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1407 GGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAATGGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAG 1480
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1481 ATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCCCACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACC 1554
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1555 ATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCAGACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGT 1628
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1629 GCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGACCAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGG 1702
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1703 ACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGCCTCCTCACCTGGTACCTGATCAG-CA 1775
|| | ||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------AT--GTCA 6
Query 1776 --TCGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTC 1847
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 TTTCTCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGTTTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTC 80
Query 1848 AGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGC 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 AGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGGCAACAACAGCAGCATCAAACAGC 154
Query 1922 TGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAG 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 TGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATGAAAGAACCCTGGAGAAGACCCAG 228
Query 1996 CAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCC 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 CAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAACAAATTCAAGACTCTATCTGTCC 302
Query 2070 TCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGT 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCTCCTTACCCATCAGCTCCAGAGGT 376
Query 2144 TAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCT 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 TAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCTTCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCT 450
Query 2218 CCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCG 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 CCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCCCAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCG 524
Query 2292 CAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGC 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 CAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGTGGCACTAACCTGCTTGGGTATGC 598
Query 2366 AGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGC 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 AGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTGACATGCTCAGCAACATGCCAGGC 672
Query 2440 ACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTAC 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 ACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGTCAGATGCAGATGCAGCACCGTAC 746
Query 2514 CAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 CAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCTGAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTC 820
Query 2588 ACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGAC 2661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 ACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATTTACACCCCCATCTGTTTTCGGAC 894
Query 2662 CAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGT 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTCTCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGT 968
Query 2736 CCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCAC 2809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 CCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCCGCCACACTATACCACGTCGGCAC 1042
Query 2810 TACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGA 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 TACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGCAGGTACCCCACATCCTTCAAGGA 1116
Query 2884 CTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCAT 2957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 CTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCCCCAACAGAGTTTGCACAGCTCAT 1190
Query 2958 TAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGC 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 TAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAAGAATACCAGGAACTGTTCAGGC 1264
Query 3032 ACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTA 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 ACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGAGCATGACAGAGCGCCAGGCTTTA 1338
Query 3106 TCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATG 3179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 TCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTGCTACAAATCAGGGCACAAGAATG 1412
Query 3180 TGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCA 3253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 TGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCCGGCACTGATGCATTCAGAGAGCA 1486
Query 3254 TGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAA 3327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 TGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTAAGAGTTCAAGTACATTGACCAAA 1560
Query 3328 GGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCGTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAG 3401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCTGAATCTTTGCTAGGAACTGTGAG 1634
Query 3402 TCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCA 3475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 TCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGCATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCA 1708
Query 3476 GCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAAT 3549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 GCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAGCAGTGGAGCTGCCGGATCACAAT 1782
Query 3550 GGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGAT 3623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 GGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGGGCCCTCCAGAGACACCACACGAT 1856
Query 3624 CCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTA 3697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 CCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAGTCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTA 1930
Query 3698 GCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAATCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAA 3771
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 GCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCAGCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAA 2004
Query 3772 AATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTC 3845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 AATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGTGATGGCAGCCAGCATTTAAACTC 2078
Query 3846 CTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGG 3919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 CTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCACCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGG 2152
Query 3920 AGCAGGCAGGCGTGTAAGCT 3939
||||||||||||||
Sbjct 2153 AGCAGGCAGGCGTG------ 2166
