Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489062
- Subject:
- NM_001024698.3
- Aligned Length:
- 1258
- Identities:
- 1076
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGATCCTGTTTTTTGGTGCCCTTTTTGGGCATATCTACTGTCTAGAAACATTTGTGGGAGACCAAGT 74
||||||||||.||.|||.||.|.||||||.||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGAGGTTGACCCCGTTATTGGTTGCCCTATTTGGGTATATCTACTGTCAAGAAACATTTGTGGGAGATCAAGT 74
Query 75 TCTTGAGATTGTACCAAGCAATGAAGAACAAATTAAAAATCTGCTACAATTGGAGGCTCAAGAACATCTCCAGC 148
|||||||.|..|.||.|...|||||||.||||||||.|.||||||.|||.|||||||..||||.||.||..|||
Sbjct 75 TCTTGAGGTGATCCCGAATGATGAAGAGCAAATTAAGACTCTGCTGCAACTGGAGGCCGAAGAGCACCTTGAGC 148
Query 149 TTGATTTTTGGAAATCACCCA-CCACCCCAGGGGAGACAGCCCACGTCCGAGTTCCCTTCGTCAACGTCCAGGC 221
||||||||||||||||.|||| |..||||| ||.||||||.|||.|||||||||||.||.|.||.|.||||||.
Sbjct 149 TTGATTTTTGGAAATCCCCCAGCGTCCCCA-GGCAGACAGTCCATGTCCGAGTTCCTTTTGCCAGCATCCAGGA 221
Query 222 AGTCAAAGTGTTCTTGGGGTCCCAGGGAATTGCCTATTCCATCATGATTGAAGACGTGCAGGTCCTGTTGGACA 295
.||||||||.|||.|||.|||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||..
Sbjct 222 CGTCAAAGTTTTCCTGGAGTCCCAGGGGATTACTTATTCCATCATGATCGAAGATGTTCAAGTTCTGTTGGATC 295
Query 296 AAGAGAATGAAGAAATGCTTTTTAA-TAGGAGAAGAGAACGGAGTGG---TAACTTCAATTTTGGGGCCTACCA 365
|||||..||||||.|||||.||.|| .||.| |||||| |.|||| |||||||||.||||||||||||||
Sbjct 296 AAGAGCGTGAAGAGATGCTGTTCAACCAGCA-AAGAGA---GCGTGGCACTAACTTCAACTTTGGGGCCTACCA 365
Query 366 TACCCTGGAAGAGATTTCCCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGCACCCTGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATA 439
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TACCCTGGAAGAGATTTACCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGAACCCTGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATA 439
Query 440 TTGGCTCTTCTTTTGAGAACCGGCCTATGAACGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCTATCTGG 513
|.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 440 TCGGTTCATCTTTTGAAAATCGGCCCATGAATGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCCATCTGG 513
Query 514 CTGGATGCTGGGATCCATGCTCGAGAGTGGGTTACACAAGCTACGGCACTTTGGACAGCAAATAAGATTGTTTC 587
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||..||
Sbjct 514 CTTGATGCGGGGATCCACGCTCGAGAGTGGGTTACGCAAGCTACTGCACTGTGGACAGCAAATAAGATTGCGTC 587
Query 588 TGATTATGGAAAGGACCCATCCATCACTTCCATTCTGGACGCCCTGGATATCTTCCTCCTGCCAGTCACAAACC 661
|||||||||.|..||.|||.||||||||||..||||..|..|.||||||.|||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 588 TGATTATGGGACTGATCCAGCCATCACTTCTCTTCTCAATACTCTGGATGTCTTCCTGCTGCCTGTCACGAACC 661
Query 662 CTGATGGATACGTGTTCTCTCAAACCAAAAATCGTATGTGGCGGAAGACCCGGTCCAA--GGTATCTGGAAGCC 733
||||||||||.||||||||.||||||...||||||||||||||.|||||||||||.|| || ||.||||||.
Sbjct 662 CTGATGGATATGTGTTCTCCCAAACCTCCAATCGTATGTGGCGAAAGACCCGGTCTAAACGG--TCGGGAAGCT 733
Query 734 TCTGTGTTGGTGTGGATCCTAACCGGAACTGGGATGCAGGTTTTGGAGGACCTGGAGCCAGCAGCAACCCTTGC 807
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||..|||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 734 TCTGTGTTGGTGTGGATCCTAATCGGAACTGGGACGCAAATTTCGGAGGACCTGGAGCCAGTAGCAACCCTTGC 807
Query 808 TCTGATTCATACCACGGACCCAGTGCCAACTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGTCA 881
||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 808 TCTGATTCATACCATGGACCCAGTCCCAATTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGCCA 881
Query 882 TGGAAAAGTCAAGGCCTTCATTACCCTCCACAGCTATTCCCAGCTGCTGATGTTCCCCTATGGGTACAAATGTA 955
.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct 882 CGGGAAAGTCAAAGCGTTCATTACCCTTCACAGCTATTCCCAACTGCTCATGTTCCCCTATGGCTATAAATGTG 955
Query 956 CCAAGTTAGATGACTTTGATGAGCTGAGTGAAGTGGCCCAAAAGGCTGCCCAATCTCTGAGAAGCCTGCATGGC 1029
|||||..||||||||||.||||||||..||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|||.||.||.|||
Sbjct 956 CCAAGCCAGATGACTTTAATGAGCTGGATGAAGTGGCCCAAAGGGCTGCCCAGTCTTTGAAAAGACTCCACGGC 1029
Query 1030 ACCAAGTACAAAGTGGGACCAATCTGCTCTGTCATCTACCAAGCCAGTGGAGGAAGCATTGACTGGTCCTATGA 1103
||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1030 ACCAGTTACAAAGTGGGACCCATCTGTTCTGTCATCTACCAGGCCAGTGGCGGAAGCATCGACTGGGCTTATGA 1103
Query 1104 TTATGGCATCAAGTACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGGCGCTACGGCTTCCTCTTGCCAGCCCGTC 1177
...|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||...|
Sbjct 1104 CCTTGGCATCAAATACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGCTACTATGGCTTCCTCCTGCCAGCCAAGC 1177
Query 1178 AGATCCTGCCCACAGCCGAGGAGACCTGGCTTGGCTTGAAGGCAATCATGGAGCATGTGCGAGACCACCCCTAT 1251
|||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1178 AGATCTTGCCCACAGCAGAAGAGACCTGGCTTGGCCTGAAGACCATCATGGAGCACGTACGAGACCACCCCTAC 1251