Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489105
• Subject: XM_017013841.1
• Aligned Length: 1998
• Identities: 1796
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGCTATGACTTGGATTGTCTTCTCTCTTTGGCCCTTGACTGTGTTCATGGGGCATATAGGTGGGCACAGTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTTTCTTGTGAACCTATTACCTTGAGGATGTGCCAAGATTTGCCTTATAATACTACCTTCATGCCTAATCTTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGAATCATTATGACCAACAGACAGCAGCTTTGGCAATGGAGCCATTCCACCCTATGGTGAATCTGGATTGTTCT  222
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGGTGAATCTGGATTGTTCT  21

Query  223  CGGGATTTCCGGCCTTTTCTTTGTGCACTCTACGCTCCTATTTGTATGGAATATGGACGTGTCACACTTCCCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  CGGGATTTCCGGCCTTTTCTTTGTGCACTCTACGCTCCTATTTGTATGGAATATGGACGTGTCACACTTCCCTG  95

Query  297  TCGTAGGCTGTGTCAGCGGGCTTACAGTGAGTGTTCGAAGCTCATGGAGATGTTTGGTGTTCCTTGGCCTGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  TCGTAGGCTGTGTCAGCGGGCTTACAGTGAGTGTTCGAAGCTCATGGAGATGTTTGGTGTTCCTTGGCCTGAAG  169

Query  371  ATATGGAATGCAGTAGGTTCCCAGATTGTGATGAGCCATATCCTCGACTTGTGGATCTGAATTTGGCTGGAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  170  ATATGGAATGCAGTAGGTTCCCAGATTGTGATGAGCCATATCCTCGACTTGTGGATCTGAATTTAGCTGGAGAA  243

Query  445  CCAACTGAAGGAGCCCCAGTGGCAGTGCAGAGAGACTATGGTTTTTGGTGTCCCCGAGAGTTAAAAATTGATCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  CCAACTGAAGGAGCCCCAGTGGCAGTGCAGAGAGACTATGGTTTTTGGTGTCCCCGAGAGTTAAAAATTGATCC  317

Query  519  TGATCTGGGTTATTCTTTTCTGCATGTGCGTGATTGTTCACCTCCTTGTCCAAATATGTACTTCAGAAGAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  TGATCTGGGTTATTCTTTTCTGCATGTGCGTGATTGTTCACCTCCTTGTCCAAATATGTACTTCAGAAGAGAAG  391

Query  593  AACTGTCATTTGCTCGCTATTTCATAGGATTGATTTCAATCATTTGCCTCTCGGCCACATTGTTTACTTTTTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  AACTGTCATTTGCTCGCTATTTCATAGGATTGATTTCAATCATTTGCCTCTCGGCCACATTGTTTACTTTTTTA  465

Query  667  ACTTTTTTGATTGATGTCACAAGATTCCGTTATCCTGAAAGGCCTATTATATTTTATGCAGTCTGCTACATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  ACTTTTTTGATTGATGTCACAAGATTCCGTTATCCTGAAAGGCCTATTATATTTTATGCAGTCTGCTACATGAT  539

Query  741  GGTATCCTTAATTTTCTTCATTGGATTTTTGCTTGAAGATCGAGTAGCCTGCAATGCATCCATCCCTGCACAAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GGTATCCTTAATTTTCTTCATTGGATTTTTGCTTGAAGATCGAGTAGCCTGCAATGCATCCATCCCTGCACAAT  613

Query  815  ATAAGGCTTCCACAGTGACACAAGGATCTCATAATAAAGCCTGTACCATGCTTTTTATGATACTCTATTTTTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  ATAAGGCTTCCACAGTGACACAAGGATCTCATAATAAAGCCTGTACCATGCTTTTTATGATACTCTATTTTTTT  687

Query  889  ACTATGGCTGGCAGTGTATGGTGGGTAATTCTTACCATCACATGGTTTTTAGCAGCTGTGCCAAAGTGGGGTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  ACTATGGCTGGCAGTGTATGGTGGGTAATTCTTACCATCACATGGTTTTTAGCAGCTGTGCCAAAGTGGGGTAG  761

Query  963  TGAAGCTATTGAGAAGAAAGCATTGCTGTTTCACGCCAGTGCATGGGGCATCCCCGGAACTCTAACCATCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  TGAAGCTATTGAGAAGAAAGCATTGCTGTTTCACGCCAGTGCATGGGGCATCCCCGGAACTCTAACCATCATCC  835

Query 1037  TTTTAGCGATGAATAAAATTGAAGGTGACAATATTAGTGGCGTGTGTTTTGTTGGCCTCTACGATGTTGATGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  TTTTAGCGATGAATAAAATTGAAGGTGACAATATTAGTGGCGTGTGTTTTGTTGGCCTCTACGATGTTGATGCA  909

Query 1111  TTGAGATATTTTGTTCTTGCTCCCCTCTGCCTGTATGTGGTAGTTGGGGTTTCTCTCCTCTTAGCTGGCATTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  TTGAGATATTTTGTTCTTGCTCCCCTCTGCCTGTATGTGGTAGTTGGGGTTTCTCTCCTCTTAGCTGGCATTAT  983

Query 1185  ATCCCTAAACAGAGTTCGAATTGAGATTCCATTAGAAAAGGAGAACCAAGATAAATTAGTGAAGTTTATGATCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  ATCCCTAAACAGAGTTCGAATTGAGATTCCATTAGAAAAGGAGAACCAAGATAAATTAGTGAAGTTTATGATCC  1057

Query 1259  GGATCGGTGTTTTCAGCATTCTTTATCTCGTACCACTCTTGGTTGTAATTGGATGCTACTTTTATGAGCAAGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  GGATCGGTGTTTTCAGCATTCTTTATCTCGTACCACTCTTGGTTGTAATTGGATGCTACTTTTATGAGCAAGCT  1131

Query 1333  TACCGGGGCATCTGGGAAACAACGTGGATACAAGAACGCTGCAGAGAATATCACATTCCATGTCCATATCAGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  TACCGGGGCATCTGGGAAACAACGTGGATACAAGAACGCTGCAGAGAATATCACATTCCATGTCCATATCAGGT  1205

Query 1407  TACTCAAATGAGTCGTCCAGACTTGATTCTCTTTCTGATGAAATACCTGATGGCTCTCATAGTTGGCATTCCCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  TACTCAAATGAGTCGTCCAGACTTGATTCTCTTTCTGATGAAATACCTGATGGCTCTCATAGTTGGCATTCCCT  1279

Query 1481  CTGTATTTTGGGTTGGAAGCAAAAAGACATGCTTTGAATGGGCCAGTTTTTTTCATGGTCGTAGGAAAAAAGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280  CTGTATTTTGGGTTGGAAGCAAAAAGACATGCTTTGAATGGGCCAGTTTTTTTCATGGTCGTAGGAAAAAAGAG  1353

Query 1555  ATAGTGAATGAGAGCCGACAGGTACTCCAGGAACCTGATTTTGCTCAGTCTCTCCTGAGGGATCCAAATACTCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354  ATAGTGAATGAGAGCCGACAGGTACTCCAGGAACCTGATTTTGCTCAGTCTCTCCTGAGGGATCCAAATACTCC  1427

Query 1629  TATCATAAGAAAGTCAAGGGGAACTTCCACTCAAGGAACATCCACCCATGCTTCTTCAACTCAGCTGGCTATGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428  TATCATAAGAAAGTCAAGGGGAACTTCCACTCAAGGAACATCCACCCATGCTTCTTCAACTCAGCTGGCTATGG  1501

Query 1703  TGGATGATCAAAGAAGCAAAGCAGGAAGCATCCACAGCAAAGTGAGCAGCTACCACGGCAGCCTCCACAGATCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502  TGGATGATCAAAGAAGCAAAGCAGGAAGCATCCACAGCAAAGTGAGCAGCTACCACGGCAGCCTCCACAGATCA  1575

Query 1777  CGTGATGGCAGGTACACGCCCTGCAGTTACAGAGGAATGGAGGAGAGACTACCTCATGGCAGCATGTCACGACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576  CGTGATGGCAGGTACACGCCCTGCAGTTACAGAGGAATGGAGGAGAGACTACCTCATGGCAGCATGTCACGACT  1649

Query 1851  AACAGATCACTCCAGGCATAGTAGTTCTCATCGGCTCAATGAACAGTCACGACATAGCAGCATCAGAGATCTCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1650  AACAGATCACTCCAGGCATAGTAGTTCTCATCGGCTCAATGAACAGTCACGACATAGCAGCATCAGAGATCTCA  1723

Query 1925  GTAATAATCCCATGACTCATATCACACATGGCACCAGCATGAATCGGGTTATTGAAGAAGATGGAACCAGTGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724  GTAATAATCCCATGACTCATATCACACATGGCACCAGCATGAATCGGGTTATTGAAGAAGATGGAACCAGTGCT  1797