Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489112
• Subject: XM_011510488.2
• Aligned Length: 1334
• Identities: 964
• Gaps: 331

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGGC  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74

Query    6  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148

Query   80  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222

Query  154  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296

Query  228  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370

Query  302  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444

Query  376  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518

Query  450  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592

Query  524  GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  597
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666

Query  598  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740

Query  672  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814

Query  746  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888

Query  820  AAGATGCTGTTTGTCCTGGT------CGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCAT  887
            ||||||||||...|||.|||      ||    |.||    |||       |||..||||           ||| 
Sbjct  889  AAGATGCTGTACTTCCAGGTTCTAGACG----GCTT----TCT-------CCCAATCCA-----------TCA-  935

Query  888  GTGGAGCGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTC-------ATCTCC  954
                                         ||||        |||...|||   |.|||.||       ||| ||
Sbjct  936  -----------------------------GCCT--------CCTCTGAGC---TTCACTTCTTTTCTGATC-CC  968

Query  955  GGCATC--TTCTTCTACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCC-GAGA  1025
            ..||||  |||.||||||                         |||    ||| || |||||  .|||| |||.
Sbjct  969  ACCATCAGTTCATCTACC-------------------------CTA----CTC-TG-CCAGC--GTTCCTGAGG  1009

Query 1026  GACCTTCCAGGAG-GCCCTG------TGCCTCGGGGCCTGCTGCCATCGCCTCAGA--------------CCCC  1078
            |        .||| .|.|||      |.|.||    |||          .||||||              ||..
Sbjct 1010  G--------TGAGTACACTGGAATAATTCTTC----CCT----------TCTCAGAAAAAGGCTTAATTTCCTT  1061

Query 1079  G------------CCACAGCTCCCACAGCCTCAGCAGGATGACCACAG--GCA---GC--ACCCTGTGTGATGT  1133
            |            ||| ||.|    .||.||||.||  |..|.||.||  |||   ||  |||||...|..|||
Sbjct 1062  GAAAATTGAAAGTCCA-AGAT----TAGTCTCATCA--ACAAACAAAGCTGCATATGCCTACCCTTCCTTCTGT  1128

Query 1134  GGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCCACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAGAGGCGCAGCAAGAGACCGATCCAT  1207
                                                                                      
Sbjct 1129  --------------------------------------------------------------------------  1128

Query 1208  CC  1209
              
Sbjct 1129  --  1128