Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489112
• Subject: XM_011510489.2
• Aligned Length: 1278
• Identities: 862
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGGC  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74

Query    6  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148

Query   80  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222

Query  154  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296

Query  228  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370

Query  302  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444

Query  376  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518

Query  450  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592

Query  524  GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  597
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666

Query  598  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740

Query  672  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814

Query  746  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888

Query  820  AAGATGCTGTTTGTCCTGGTCGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCATGTGGAG  893
            ||||||||||..|.|          |||..|||||      ||||             ||||            
Sbjct  889  AAGATGCTGTCAGCC----------TGTGAGGCAT------GGCC-------------ACCG------------  921

Query  894  CGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTCATCTCCGGCATCTTCTTCT  967
                                                            |||||.|||||      |||| |.| 
Sbjct  922  ------------------------------------------------GCACGCCATCT------TCTT-TCC-  939

Query  968  ACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCCGAGAGACCTTCCAGGAGGCC  1041
                                                                                      
Sbjct  940  --------------------------------------------------------------------------  939

Query 1042  CTGTGCCTCGGGGCCTGCTGCCATCGCCTCAGACCCCGCCACAGCTCCCACAGCCTCAGCAGGATGACCACAGG  1115
                                                                                      
Sbjct  940  --------------------------------------------------------------------------  939

Query 1116  CAGCACCCTGTGTGATGTGGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCCACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAGAGGCGC  1189
                                                                                      
Sbjct  940  --------------------------------------------------------------------------  939

Query 1190  AGCAAGAGACCGATCCATCC  1209
                                
Sbjct  940  --------------------  939