Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489119
- Subject:
- NM_001294334.1
- Aligned Length:
- 2260
- Identities:
- 1924
- Gaps:
- 179
Alignment
Query 1 ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGT 74
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGATGGAAGAACTGCATAGCCTGGACCCACGAAGGCAGGAATTACTAGAGGCCAGGTTCACTGGAGTTGGTGT 74
Query 75 TAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAG 148
.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGTAAGGGGCCACTCAACAGTGAGTCTTCCAACCAGAGTCTGTGCAGCGTGGGGTCGTTGAGTGATAAAGAAG 148
Query 149 TAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATATGAAACTAGCCAA 222
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TAGAGACTCCTGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGGAAAGCCGAGCCATATGACACTAGCCAA 222
Query 223 GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAG 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 223 GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGGGCCAGGAACCAG 296
Query 297 CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGAG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGTCGAG 370
Query 371 TAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACC 444
.|||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 CAGAACAGCCTCTGTATGGTTTAGATGGCAGTGCAGCAAAGGAGGCCTCAGAAGAGCAGTCTGCTCTGCCCACC 444
Query 445 CTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAGGGGAGCTGGCCTCTGCTT 518
|||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTCATGTCAGTGATGTTAGCAAAACCGCGACTTGACACAGAGCAGTTAGCGCCACGGGGAGCTGGCCTCTGCTT 518
Query 519 CACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCC 592
||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 519 CACTTTCGTCTCTGCTCAACAAAACAGTCCTTCTTCTACGGGTTCTGGCAATACAGAACATTCTTGCAGCTCCC 592
Query 593 AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCTGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC 666
Query 667 AGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG 740
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTAAGAACTCTGACTTAGAGAAGAAGGAAGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG 740
Query 741 GCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGA 814
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 741 ACAGATAGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTCACCATGAGCAAGA 814
Query 815 AACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTG 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.
Sbjct 815 AGCTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGCAGAGATAAGAGCATGCAGGACCGATTGCGATTA 888
Query 889 GGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGCTTTTCAGAATCT 962
||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 GGCCACTTTACTACTGTCCGGCATGGAGCCTCGTTTACTGAGCAGTGGACAGATGGTTATGCTTTCCAAAACCT 962
Query 963 TATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGA 1036
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 CATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGAGAAGAGATAGAAAGGCAACGGAAAATGTTAGCAAAACGGA 1036
Query 1037 AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAATGGAGCT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAACGGAAAAGCAAGACTAATGGAGCT 1110
Query 1111 GAAAATGAAACGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTAA 1184
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAAATGAAACGTTAACGTTAGCCGAGTACCATGAACAAGAGGAAATCTTCAAACTTAGATTAGGTCATCTTAA 1184
Query 1185 AAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACATATCAGGGAACTAA 1258
.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1185 GAAAGAGGAAGCAGAAATCCAGGCAGAGCTGGAAAGGCTGGAAAGGGTTAGGAATCTACACATCAGGGAATTAA 1258
Query 1259 AAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACAT 1332
|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAGGATACATAATGAAGACAATTCGCAGTTTAAAGACCATCCAACACTAAATGACAGATATTTGTTGTTACAT 1332
Query 1333 CTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGATACGTAGCTGTGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 CTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACGGAGCAAAGATATGTAGCTGTGAA 1406
Query 1407 AATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407 AATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCGTGTAGGGAATACC 1480
Query 1481 GGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGATACTGACTCGTTT 1554
|||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 GGATTCACAAGGAGCTGGACCACCCCAGGATAGTGAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGACACTGACTCGTTT 1554
Query 1555 TGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAA 1628
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGTACAGTATTAGAATACTGTGAAGGGAATGACCTGGACTTCTACCTAAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAA 1628
Query 1629 AGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATAC 1702
|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAAGCCCGATCCATTATTATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATAC 1702
Query 1703 ACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTT 1776
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACTATGACCTCAAACCAGGTAATATCCTTTTAGTAAATGGTACAGCATGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTT 1776
Query 1777 GGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACATCACAAGGTGCTGG 1850
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1777 GGTCTTTCCAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTGACGTCACAAGGAGCTGG 1850
Query 1851 TACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATG 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 TACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAGCCACCAAAGATCTCAAATAAAGTCGATG 1924
Query 1925 TGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAACCAGTCTCAGCAA 1998
|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||| .|.||.||
Sbjct 1925 TTTGGTCAGTGGGTGTGATCTTCTACCAGTGTCTTTATGGGAGGAAG-------------------GTGAGGAA 1979
Query 1999 GACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCC----GCCAAAGCCAGTAGTAACAC 2068
| ||| |.||||.||...|| ||||.|.|| |.|||
Sbjct 1980 G---------AAG-----------------------GCAGTGGAGCAGCCTGGGGCCATACCC------ACCAC 2015
Query 2069 CTGAAGCAAAGGCGTTTATTC------GACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAGCAG 2136
|| ||..|| |.||.||| |...||..||||..|.|.|||||.|| ||.|.|..||.|
Sbjct 2016 CT----CACTGG-GATTCTTCTTTGCAGTTAATCATTGGAATCCTGAAAGTAG--------TGGTTTAAAGAA- 2075
Query 2137 CTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTAT 2210
.||.|..|||| ||||.
Sbjct 2076 ---------AATACAGACTT-----CTCAG-------------------------------------------- 2091
Query 2211 TGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT 2250
Sbjct 2092 ---------------------------------------- 2091