Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489119
• Subject: XM_024450552.1
• Aligned Length: 2337
• Identities: 2250
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ---------------------ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAGCCTGTGGAGCAGAAATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC  74

Query   54  CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG  148

Query  128  GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT  222

Query  202  GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG  296

Query  276  GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT  370

Query  350  CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG  444

Query  424  GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA  518

Query  498  AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA  592

Query  572  CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA  666

Query  646  AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG  740

Query  720  AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA  814

Query  794  GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC  888

Query  868  ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA  962

Query  942  TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC  1036

Query 1016  GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG  1110

Query 1090  AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAAC------------------------------------------  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1111  AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGC  1184

Query 1122  ------------------------GTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT  1171
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTAGGAGCCCACAGTTTACTTAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT  1258

Query 1172  TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT  1332

Query 1246  ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA  1406

Query 1320  TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT  1480

Query 1394  ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA  1467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA  1554

Query 1468  TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA  1541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA  1628

Query 1542  TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT  1615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT  1702

Query 1616  TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA  1776

Query 1690  CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA  1763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA  1850

Query 1764  AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT  1837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT  1924

Query 1838  CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA  1911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA  1998

Query 1912  AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA  1985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA  2072

Query 1986  CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG  2059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG  2146

Query 2060  TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG  2133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG  2220

Query 2134  CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC  2207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC  2294

Query 2208  TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2250
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2337