Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489121
• Subject: NM_001290374.1
• Aligned Length: 1103
• Identities: 873
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCAGAAGACATTAAGAAGATCTTCGAGTT  74

Query   75  CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG  148
            |||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct   75  CAAGGAGACCCTCGGAACTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACTGGGAAGCTCTTCG  148

Query  149  CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA  222
            |.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  CAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGATTGCCGTGCTTAGA  222

Query  223  AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA  296
            ||                                                                        
Sbjct  223  AA------------------------------------------------------------------------  224

Query  297  GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC  370
               .|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  225  ---TGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAGCACTC  295

Query  371  TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA  444
            |.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  296  TCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGCCGGAG  369

Query  445  AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG  518
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  370  AATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATGGAGGG  443

Query  519  CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  444  CAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAAACCGT  517

Query  593  ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT  666
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  518  ACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTTTTTAT  591

Query  667  GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  592  GATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGGGATGA  665

Query  741  CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  666  CATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTGTGAGC  739

Query  815  AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG  888
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  740  AGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTGCCCAG  813

Query  889  ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAGATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA  962
            ||||||||.||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|.
Sbjct  814  ATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATGCGGAG  887

Query  963  ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTC----------AGTTT----  1022
            .||.||.||.|||||||||||||||||||||||||        ||..|||.|.||          |||||    
Sbjct  888  GCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATG--------TCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTT  953

Query 1023  --------------GGCCAGCCAAAAAGACTGTGCGTATG-TAGCAAAACCAGAATCCCTCAGCTTG  1074
                          ||.| ||  |..||.|.|.||   || .||.|.|.||||  .|||.|..||. 
Sbjct  954  TCTTCTTCGTCGGGGGTC-GC--AGGAGTCGGAGC---TGAGAGGAGACCCAG--GCCCACCACTG-  1011