Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489121
• Subject: NM_177343.4
• Aligned Length: 1166
• Identities: 957
• Gaps: 103

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCAGAAGACATTAAGAAGATCTTCGAGTT  74

Query   75  CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG  148
            |||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct   75  CAAGGAGACCCTCGGAACTGGGGCCTTTTCTGAAGTTGTTTTAGCCGAGGAGAAAGCTACTGGGAAGCTCTTCG  148

Query  149  CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA  222
            |.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  CAGTGAAGTGCATCCCGAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAGAGCAGCATCGAGAACGAGATTGCCGTGCTTAGA  222

Query  223  AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA  296
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct  223  AAGATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTCATGCA  296

Query  297  GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC  370
            .||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  ACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAGCACTC  370

Query  371  TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA  444
            |.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  371  TCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGCCGGAG  444

Query  445  AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG  518
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  AATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATGGAGGG  518

Query  519  CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  CAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAAACCGT  592

Query  593  ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT  666
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTTTTTAT  666

Query  667  GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  667  GATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGGGATGA  740

Query  741  CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  CATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTGTGAGC  814

Query  815  AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG  888
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  815  AGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTGCCCAG  888

Query  889  ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAGATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA  962
            ||||||||.||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|.
Sbjct  889  ATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATGCGGAG  962

Query  963  ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  1036
            .||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  1036

Query 1037  ACTGT--------------GCGTATGTAGCAAAACCAGAATCCC--TCAGCTTG--------------------  1074
            |.|||              || |.|||||          .|.||  ||..|||.                    
Sbjct 1037  ATTGTCTGGCACCTTCCACGC-TCTGTAG----------TTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCG  1099

Query 1075  --------------------------------------------------------  1074
                                                                    
Sbjct 1100  GAGCTGAGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG  1155