Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489121
• Subject: XM_006497471.3
• Aligned Length: 1166
• Identities: 843
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCAGAAGACATTAAGAAGATCTTCGAGTT  74

Query   75  CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG  148
            |||.||||||||||||||                                                        
Sbjct   75  CAAGGAGACCCTCGGAAC--------------------------------------------------------  92

Query  149  CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA  222
                                                                                      
Sbjct   93  --------------------------------------------------------------------------  92

Query  223  AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA  296
              |||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct   93  --GATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTCATGCA  164

Query  297  GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC  370
            .||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  165  ACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAGCACTC  238

Query  371  TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA  444
            |.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  239  TCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGCCGGAG  312

Query  445  AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG  518
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  313  AATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATGGAGGG  386

Query  519  CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  387  CAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAAACCGT  460

Query  593  ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT  666
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  461  ACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTTTTTAT  534

Query  667  GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  535  GATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGGGATGA  608

Query  741  CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  609  CATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTGTGAGC  682

Query  815  AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG  888
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  683  AGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTGCCCAG  756

Query  889  ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAGATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA  962
            ||||||||.||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|.
Sbjct  757  ATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATGCGGAG  830

Query  963  ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  1036
            .||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  GCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  904

Query 1037  ACTGT--------------GCGTATGTAGCAAAACCAGAATCCC--TCAGCTTG--------------------  1074
            |.|||              || |.|||||          .|.||  ||..|||.                    
Sbjct  905  ATTGTCTGGCACCTTCCACGC-TCTGTAG----------TTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCG  967

Query 1075  --------------------------------------------------------  1074
                                                                    
Sbjct  968  GAGCTGAGAGGAGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG  1023