Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489127
• Subject: XM_006500105.1
• Aligned Length: 2654
• Identities: 2235
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGAATTCTAATTTACCTGCAGAGAACTTAACCAT  35
                                                   |||.|||||.||||..|.|||.||||||.|||..|
Sbjct    1  ATGATAAGAGGCCAGTTTGGAAGTGGAGGGAGAGAGAAAATGGATTCTTATTTCTCAGCAAAGAACTCAACGCT  74

Query   36  TGCAGTCAATATGACCAAGACTT----TGCCTACAGCAGTAACGCATGGATTTAATTCCACTAATGACCCACCT  105
            |||.|...||||||....|||||    |||||          |.||||||||||||.||||....||.||||||
Sbjct   75  TGCTGGTGATATGAATGCGACTTGGCCTGCCT----------CTCATGGATTTAATGCCACCGGCGATCCACCT  138

Query  106  TCAATGTCAATTACAAGGCTTTTTCCAGCCTTACTGGAATGCTTTGGCATTGTCCTTTGTGGCTACATAGCAGG  179
            ||.|||||.||.||..||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  TCGATGTCGATAACCCGGCTCTTCCCGGCCTTACTGGAGTGCTTTGGCATAGTCCTTTGTGGCTACATAGCAGG  212

Query  180  AAGGGCCAATGTCATAACATCAACCCAGGCCAAAGGACTAGGAAATTTTGTCTCCAGATTTGCACTTCCAGCTT  253
            ||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  213  AAGGGCCAATATCATAACCTCAACACAGGCCAAAGGACTGGGGAATTTCGTCTCCAGATTTGCCCTTCCAGCCT  286

Query  254  TATTATTCAAAAACATGGTTGTACTTAATTTTTCCAATGTGGACTGGTCCTTCCTATATAGTATCTTAATTGCC  327
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.||.||..|||||||||.|
Sbjct  287  TATTATTCAAAAACATGGTTGTGCTTAATTTTTCCAACGTGGACTGGGCTTTTCTCTACAGCGTCTTAATTGGC  360

Query  328  AAAGCTTCTGTATTTTTCATTGTATGTGTATTAACCTTATTGGTTGCCAGTCCTGATAGTCGATTTAGCAAAGC  401
            |||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  361  AAAGCCTCCGTGTTTTTCATTGTGTGTGTATTAACCTTATTGGTGGCCAGTCCTGAGAGCCGGTTTAGCAAAGC  434

Query  402  TGGACTATTCCCTATTTTTGCTACACAAAGTAATGACTTTGCATTGGGATACCCTATAGTTGAAGCTTTATATC  475
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|
Sbjct  435  TGGACTATTCCCTATTTTTGCTACACAGAGTAATGACTTTGCTTTGGGATACCCTATAGTTGAAGCTCTGTACC  508

Query  476  AAACTACATACCCAGAATATCTCCAGTACATTTATTTGGTGGCACCAATATCTCTTATGATGTTAAACCCTATA  549
            ||.|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  509  AATCTACATATCCAGAGTATCTGCAGTACATTTATTTGGTGGCACCAATATCTCTTATGATGCTAAACCCCATA  582

Query  550  GGGTTTATTTTCTGTGAAATCCAAAAGTGGAAAGACACTCAAAATGCTTCTCAAAATAAAATAAAAATTGTGGG  623
            ||||||||.||||||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct  583  GGGTTTATCTTCTGTGAAATCCAGAAGTCAAAAGACACTCAAAATGCTTCTCAAAATAAAGCAAAAATTGTGGG  656

Query  624  ACTCGGACTCCTGCGTGTATTACAGAACCCAATAGTATTTATGGTCTTCATTGGCATCGCCTTCAATTTTATTC  697
            |||.|||.|.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  657  ACTTGGATTTCTACGCGTGTTACAGAACCCGATAGTATTTATGGTCTTTGTTGGCATTGCCTTCAATTTTATTC  730

Query  698  TTGATCGAAAGGTACCTGTATATGTCGAAAATTTTCTTGATGGACTTGGAAATTCTTTTTCTGGATCAGCCCTA  771
            |||||..||||.|.||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||.||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  731  TTGATAAAAAGATCCCAGTATATATGGAAAACTTTCTGGATGGGCTTGCAAATTCCTTCTCTGGATCAGCCCTG  804

Query  772  TTTTATCTTGGTCTCACGATGGTGGGAAAAATAAAGAGACTGAAGAAGTCGGCATTTGTAGTACTAATTCTTCT  845
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||.||.||.|.||||||
Sbjct  805  TTTTATCTTGGTCTGACCATGGTAGGAAAAATCAGGCGACTGAAGAAGTCGGCGTTTGTGGTTCTTACTCTTCT  878

Query  846  CATCACAGCTAAACTTCTGGTGCTGCCACTTCTGTGCAGAGAAATGGTGGAACTCTTGGACAAGGGCGACAGTG  919
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|
Sbjct  879  CATCACAGCCAAACTCCTGGTGCTGCCCCTCCTGTGCAGAGAAATGGTGGAACTCCTGGACAAGGGGGACAGCG  952

Query  920  TGGTGAACCATACAAGTTTATCAAATTATGCATTTCTGTATGGTGTATTTCCTGTAGCACCAGGAGTGGCTATC  993
            |.||||||||||||||..|.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  953  TAGTGAACCATACAAGCCTGTCCAACTATGCGTTTCTATATGGTGTCTTCCCTGTGGCTCCAGGAGTGGCTATC  1026

Query  994  TTTGCAACACAATTCAACATGGAAGTAGAAATTATAACCTCAGGGATGGTGATAAGCACATTTGTGTCTGCTCC  1067
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1027  TTTGCAACACAGTTCAACATGGAAGTGGAGATTATAACCTCAGGCATGGTAATAAGTACATTTGTGTCTGCTCC  1100

Query 1068  CATCATGTACGTTTCTGCCTGGTTACTGACCTTTCCCACTATGGACCCTAAGCCATTGGCATATGCCATCCAGA  1141
            .||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||..|.||||||.||||.||||||||.||||
Sbjct 1101  AATCATGTATGTTTCTGCCTGGTTATTAACCTTTCCTACCATGGATGCCAAGCCACTGGCGTATGCCATTCAGA  1174

Query 1142  ATGTTAGTTTTGATATAAGTATTGTCAGCCTGATCTCCTTGATCTGGTCTCTGGCTATTCTTCTTTTGAGTAAG  1215
            |||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1175  ATGTTAGCTTTGATATAAGTATTATCAGCCTGGTCTCCTTGATCTGGTCCCTGTCTATTCTTCTCTTGAGTAAG  1248

Query 1216  AAATATAAACAGCTTCCTCATATGCTTACAACTAATTTACTCATTGCTCAGTCTATTGTCTGTGCTGGAATGAT  1289
            ||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 1249  AAATATAAGCAGCTCCCACATATGCTCACAGCGAACTTACTCATCGCTCAGACTATTGTTTGTGCTGGAATGAT  1322

Query 1290  GATATGGAATTTTGTTAAAGAAAAAAATTTTGTTGGACAAATTTTGGTGTTTGTTCTATTGTACAGCTCCCTCT  1363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1323  GATATGGAATTTTGTTAAAGAAAAAAATTTTGTTGGACAAATTTTGGTGTTTGTTTTATTGTACAGCTCCCTGT  1396

Query 1364  ATAGCACCTACCTGTGGACAGGCCTTCTAGCAATTTCTTTGTTTCTTTTGAAAAAGCGAGAGAGGGTACAAATT  1437
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||..|.
Sbjct 1397  ACAGCACCTATCTGTGGACAGGCCTTCTAGCAGTTTCTTTGTTTCTTTTAAAGAAGCGCGAGAGCGTTCAGCTC  1470

Query 1438  CCTGTTGGAATAATCATAATATCTGGCTGGGGAATTCCTGCTCTCCTTGTTGGTGTTCTTTTGATAACTGGAAA  1511
            ||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1471  CCGGTGGGAATCATCATCATCTCTGGCTGGGGGATCCCTGCTCTCCTTGTGGGCGTGCTTCTGATAACTGGAAA  1544

Query 1512  ACACAATGGAGATAGCATTGACTCAGCCTTCTTTTATGGAAAAGAACAGATGATCACCACAGCAGTCACCCTGT  1585
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1545  ACACAACGGAGACAGCATTGACTCAGCCTTCTTTTATGGAAAAGAGCAGATGATCACCACGGCAGTCACCCTGT  1618

Query 1586  TCTGCAGCATCCTGATAGCTGGCATATCCCTCATGTGCATGAACCAGACTGCCCAAGCAGGAAGCTATGAAGGT  1659
            ||||||||||.||.||||||||..|.||.||||||||||||||||..||..|||||||.||...|||.||||||
Sbjct 1619  TCTGCAGCATTCTCATAGCTGGGGTGTCACTCATGTGCATGAACCGCACCACCCAAGCTGGTCACTACGAAGGT  1692

Query 1660  TTCGATCAGTCTCAGAGCCACAAAGTGGTGGAGCCTGGAAATACTGCTTTTGAGGAGAGTCCAGCACCAGTAAA  1733
            ||||..||||||||||.|||||||...||.||||||||||..|||||.||||||||||..|||||||||..|||
Sbjct 1693  TTCGGCCAGTCTCAGAACCACAAACCAGTAGAGCCTGGAAGCACTGCGTTTGAGGAGAACCCAGCACCAACAAA  1766

Query 1734  TGAACCAGAACTTTTTACAAGCTCTATTCCAGAAACAAGTTGCTGCTCCTGCTCCATGGGAAATGGTGAATTAC  1807
            ||||||||||||.||..||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1767  TGAACCAGAACTCTTCCCAAGTTCTATCCCAGAAACAAGTTGCTGTTCTTGCTCCTTGGGAAATGGTGAATTAC  1840

Query 1808  ACTGCCCATCAATAGAGCCAATAGCAAACACAAGCACCAGTGAGCCTGTGATTCCTTCGTTTGAGAAAAACAAT  1881
            .|||||||||.|||||||||.||.|.|||.||||..|.||||.||||.||..|.||||.||||||||||.|.|.
Sbjct 1841  GCTGCCCATCCATAGAGCCAGTAACGAACTCAAGTGCTAGTGGGCCTATGCCTTCTTCCTTTGAGAAAACCGAC  1914

Query 1882  CATTGTGTGAGTCGCTGTAACTCCCAGAGCTGCATATTAGCCCAGGAAGAAGAACAGTATCTACAGAGTGGAGA  1955
            ||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1915  CACTGTGTGAGCCGTTGTGACTCCCAGAGCTGCATCCTCGCCCAGGAAGAAGAGCAGTACCTGCAGAGCGGAGA  1988

Query 1956  CCAGCAACTGACCCGACATGTGTTGCTGTGTTTACTTCTCATCATTGGCCTGTTCGCTAATCTTTCCAGTTGTT  2029
            ||..||.||||||||.||.||..||.||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||..
Sbjct 1989  CCCACAGCTGACCCGGCACGTCCTGTTGTGCTTGCTGCTTATCATCGGCCTCTTTGCTAATCTCTCCAGCTGCC  2062

Query 2030  TATGGTGGCTATTCAACCAAGAGCCTGGAAGACTTTATGTTGAGTTACAGTTTTTCTGTGCCGTGTTTAACTTT  2103
            |.||||||.|.||||||||.|||.|.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  TGTGGTGGTTGTTCAACCACGAGACGGGACGGCTCTATGTTGAATTACAGTTTTTCTGTGCCGTGTTTAACTTT  2136

Query 2104  GGTCAGGGATTTATTTCCTTTGGAATCTTTGGATTAGATAAACATTTAATCATCCTGCCTTTCAAAAGAAGACT  2177
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2137  GGCCAGGGATTTATTTCCTTTGGAATCTTTGGGCTGGACAAACATCTAATCATCCTACCTTTCAAAAGAAGGCT  2210

Query 2178  TGAATTCCTATGGAACAATAAAGACACAGCAGAAAACAGGGATTCTCCTGTTTCAGAGGAAATAAAAATGACCT  2251
            |||||||||.||||||||.|||||..||||||.|.||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2211  TGAATTCCTGTGGAACAACAAAGAAGCAGCAGCAGACAGAGAATCCCCCGTTTCCGAGGAAATAAAAATGACCT  2284

Query 2252  GTCAACAATTTATCCATTATCACCGTGACCTCTGTATCCGAAACATTGTCAAAGAAAGAAGGTGTGGTGCAAAG  2325
            |||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2285  GTCAACAGTTTGTGCATTATCACCGCGACCTGTGCATCCGAAACATCGTCAGAGAAAGGAGGTGTGGTGCCAAG  2358

Query 2326  ACTTCTGCTGGAACTTTCTGTGGCTGTGACCTGGTGAGCTGGCTAATTGAAGTCGGCCTTGCCTCCGACCGTGG  2399
            ||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2359  ACTTCTGCCGGGACCTTCTGTGGCTGTGACCTGGTGAACTGGCTCATCGAAGTCGGCCTTGCTTCTGACCGCGG  2432

Query 2400  TGAAGCTGTGATATACGGAGACAGGCTGGTACAAGGGGGAGTCATCCAACATATTACCAATGAGTATGAATTCC  2473
            .|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 2433  CGAAGCTGTGATCTACGGAGACAGACTGGTGCAAGGGGGGGTCATCCAACACATCACCAATGAATACGAGTTCC  2506

Query 2474  GGGATGAGTACTTGTTTTACAGATTTCTTCAAAAGAGTCCTGAACAGAGTCCTCCTGCTATTAATGCAA-ACAC  2546
            ||||.|||||..|.||||||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||...||.|..|| |.||
Sbjct 2507  GGGACGAGTATCTCTTTTACCGATTCCTTCAGAAGAGTCCTGAGCAGAGTCCTCCTGCCCGTACTCTAAGAGAC  2580

Query 2547  TCTCCAACAGGAAAGATATAAAGAAATTGAGCATTCATCCCCACCCTCACATTCCCCTAAGACC  2610
             |.|||..|||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||||||...|||||||||||.
Sbjct 2581  -CACCAGGAGGAAAGCTATAAAGAAATCGGTCACTCATCTCCACCCTCAGTCTCCCCTAAGACT  2643