Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000489162
Subject:
NM_177407.4
Aligned Length:
1434
Identities:
1335
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACCATCACCTGCACCCGATTCACAGAAGAGTACCAGCTCTTTGAGGAACTGGGAAAGGGAGCCTTCTC  74

Query   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGGTGCGCAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGTCAGGAGTATGCTGCCAAGATTATCAACACCAAGAAGCTTT  148

Query  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGCGTGAGGCCCGCATCTGCCGCTTGTTGAAGCACCCCAATATCGTCCGA  222

Query  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCATGACAGCATCTCCGAGGAGGGGCACCACTACCTTATCTTCGATCTGGTTACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296

Query  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  AGACATTGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAAGCTGATGCCAGCCACTGTATCCAGCAGATCTTGGAGGCTGTGC  370

Query  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TACACTGTCACCAGATGGGGGTGGTGCATCGTGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCGAAGCTCAAG  444

Query  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGCTGCTGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518

Query  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592
            .||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CGCAGGGACACCTGGATACCTCTCCCCAGAAGTGCTGAGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCCGTGGACCTGTGGG  592

Query  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666
            |.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCTGTGGCGTCATCCTGTATATCTTGCTGGTTGGGTATCCCCCGTTCTGGGATGAAGACCAGCATCGCCTGTAC  666

Query  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATCT  740
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGATCAAAGCTGGTGCCTATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACCGTCACCCCAGAAGCCAAGGATCT  740

Query  741  GATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCCTTAAGCACCCCTGGATCT  814
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  GATCAATAAGATGCTGACCATCAACCCGTCCAAACGCATCACGGCCGCTGAGGCTCTCAAGCACCCATGGATCT  814

Query  815  CGCACCGCTCCACCGTGGCATCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAGG  888
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCACCGCTCCACCGTGGCCTCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAGG  888

Query  889  AGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAAA  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  AGGAAACTGAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGCGGAGGAAA  962

Query  963  CAAGAAGAGCGATGGTGTGAAGGAATCCTCAGAGAGCACCAACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTGC  1036
            ||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGAAGAACGATGGTGTGAAGGAATCTTCTGAGAGCACCAACACCACCATTGAGGACGAAGACACCAAAGTGC  1036

Query 1037  GGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAAGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACACG  1110
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAAACAGGAAATTATCAAAGTGACAGAGCAGCTGATCGAAGCCATAAGCAATGGAGACTTTGAGTCCTACACG  1110

Query 1111  AAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGCCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCCA  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  AAGATGTGCGACCCTGGAATGACAGCCTTTGAACCAGAGGCCCTGGGGAACCTGGTGGAGGGCCTGGACTTTCA  1184

Query 1185  TCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATCC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  TCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAACCCTCACATCC  1258

Query 1259  ACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGCATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCCA  1332
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 1259  ACCTGATGGGTGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTATATCCGCATCACTCAGTACCTGGATGCAGGCGGCATACCC  1332

Query 1333  CGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAG  1406
            |||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCACGGCCCAGTCAGAGGAGACCCGCGTCTGGCACCGCAGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAG  1406

Query 1407  ATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC  1434
            ||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1407  ATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCGCAT  1434