Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: NM_001353475.2
• Aligned Length: 1653
• Identities: 1636
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCTGATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCTGATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGG  74

Query   75  CCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTGCGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTGCGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCAC  148

Query  149  CTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACA  222

Query  223  AGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTT  296

Query  297  CGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATG  370

Query  371  TGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCA  444

Query  445  CACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAA  518

Query  519  GCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGT  592

Query  593  ATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATG  666

Query  667  AAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCG  740

Query  741  GGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCA  814

Query  815  TGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTG  888

Query  889  CACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAA-CTCAGCGT-----CAGGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCC  956
            ||||||||||||||||||.| ||| ||  .|||     .|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACAGCCAGCTGGAGGAGAG-GAAGCT--ACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCC  959

Query  957  GCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGG  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGG  1033

Query 1031  AGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTC  1107

Query 1105  CTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  CTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCA  1181

Query 1179  GATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGC  1255

Query 1253  GCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAG  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAG  1329

Query 1327  GACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCG  1400
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1330  GACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCG  1403

Query 1401  CGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGC  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGC  1477

Query 1475  ACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTC  1551

Query 1549  CGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGA  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGA  1625

Query 1623  GGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTTG  1647
            ||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1626  GGAGGAAGTGGCCTACACGGGT---  1647