Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: NM_001353478.2
• Aligned Length: 1660
• Identities: 1567
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ATG-GCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCTGATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAG  73
            ||| ||.||.||||             .|||.|.|||                    ||         ||.|||
Sbjct    1  ATGAGCAGCCCCCC-------------AGCTTACCCT--------------------GG---------CATCAG  32

Query   74  GCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCG----CGTGCGAG--GACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTC  141
            |....||||.||            |||    |.|| |||  ||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  GATCTCAGGGTG------------CCGGGCCCTTG-GAGCAGAAGGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTC  93

Query  142  CTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  CTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCT  167

Query  216  GCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAG  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  GCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAG  241

Query  290  AGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCC  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  AGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCC  315

Query  364  CTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  CTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACA  389

Query  438  GGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  GGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGA  463

Query  512  AGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAA  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  AGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAA  537

Query  586  ACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  ACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCT  611

Query  660  GGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGC  685

Query  734  GCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  GCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAG  759

Query  808  CCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  CCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCA  833

Query  882  GCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAA-CTCAGCGT-----CAGGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGT  949
            |||||||||||||||||||||||||.| ||| ||  .|||     .|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  GCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGAG-GAAGCT--ACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGT  904

Query  950  GCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGG  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  GCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGG  978

Query 1024  GACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCT  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  GACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCT  1052

Query 1098  CTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGG  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  CTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGG  1126

Query 1172  GGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAA  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  GGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAA  1200

Query 1246  GACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCT  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201  GACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCT  1274

Query 1320  GCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGG  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1275  GCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGG  1348

Query 1394  CAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATG  1467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  CAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATG  1422

Query 1468  GGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGA  1541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  GGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGA  1496

Query 1542  CCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCA  1615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  CCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCA  1570

Query 1616  GTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTTG  1647
            |||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1571  GTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGT---  1599