Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: NR_148435.2
• Aligned Length: 1858
• Identities: 1619
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  74

Query   31  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  148

Query  105  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  222

Query  179  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  296

Query  253  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  370

Query  327  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  444

Query  401  CCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGAT  474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGAT  518

Query  475  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  592

Query  549  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  666

Query  623  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  740

Query  697  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  814

Query  771  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  888

Query  845  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  962

Query  919  GTCAG--------------------GGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  972
            |||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  1036

Query  973  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1046
            |||||||||||||||||||||                          |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCG--------------------------CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1084

Query 1047  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1158

Query 1121  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1232

Query 1195  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1306

Query 1269  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1380

Query 1343  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1416
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1454

Query 1417  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1528

Query 1491  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1602

Query 1565  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1676

Query 1639  ACGGGTTTG-----------------------------------------------------------------  1647
            |||||||.|                                                                 
Sbjct 1677  ACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCCTGCCTCCTGACCCAGGACTGCTGAATA  1750

Query 1648  --------------------------------------------------------------------------  1647
                                                                                      
Sbjct 1751  CAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGCATTTTATAAAATAAATAAAGCTTTAGA  1824

Query 1648  --------  1647
                    
Sbjct 1825  AAAATGAA  1832