Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: NR_148437.2
• Aligned Length: 1858
• Identities: 1581
• Gaps: 275

Alignment

Query    1  --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  74

Query   31  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  148

Query  105  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  178
            ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAGGACC---GCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  219

Query  179  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  293

Query  253  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  367

Query  327  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  441

Query  401  CCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGAT  474
            |||||||||                                                             ||||
Sbjct  442  CCTTCTACA-------------------------------------------------------------AGAT  454

Query  475  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  528

Query  549  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  602

Query  623  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  676

Query  697  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  750

Query  771  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  824

Query  845  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  898

Query  919  GTCAG--------------------GGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  972
            |||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  GTCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  972

Query  973  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1046

Query 1047  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1120

Query 1121  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1194

Query 1195  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1268

Query 1269  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1342

Query 1343  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1416
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1416

Query 1417  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1490

Query 1491  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1564

Query 1565  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1638

Query 1639  ACGGGTTTG-----------------------------------------------------------------  1647
            |||||||.|                                                                 
Sbjct 1639  ACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCCTGCCTCCTGACCCAGGACTGCTGAATA  1712

Query 1648  --------------------------------------------------------------------------  1647
                                                                                      
Sbjct 1713  CAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGCATTTTATAAAATAAATAAAGCTTTAGA  1786

Query 1648  --------  1647
                    
Sbjct 1787  AAAATGAA  1794