Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: NR_148439.2
• Aligned Length: 1858
• Identities: 1642
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  74

Query   31  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  148

Query  105  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  178
            ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAGGACC---GCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  219

Query  179  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  293

Query  253  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  367

Query  327  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  441

Query  401  CCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGAT  474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  CCTTCTACAAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGAT  515

Query  475  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTA  589

Query  549  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCA  663

Query  623  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATC  737

Query  697  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  CGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAA  811

Query  771  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  CAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAG  885

Query  845  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGC  959

Query  919  GTCAG--------------------GGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  972
            |||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GTCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTG  1033

Query  973  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGA  1107

Query 1047  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACT  1181

Query 1121  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCC  1255

Query 1195  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCT  1329

Query 1269  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  CATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACC  1403

Query 1343  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1416
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  ACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCAC  1477

Query 1417  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  GACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGC  1551

Query 1491  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  ATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCA  1625

Query 1565  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTAC  1699

Query 1639  ACGGGTTTG-----------------------------------------------------------------  1647
            |||||||.|                                                                 
Sbjct 1700  ACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCCTGCCTCCTGACCCAGGACTGCTGAATA  1773

Query 1648  --------------------------------------------------------------------------  1647
                                                                                      
Sbjct 1774  CAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGCATTTTATAAAATAAATAAAGCTTTAGA  1847

Query 1648  --------  1647
                    
Sbjct 1848  AAAATGAA  1855