Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: XM_006723806.3
• Aligned Length: 1677
• Identities: 1635
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCTGATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCTGATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGG  74

Query   75  CCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTGCGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTGCGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCAC  148

Query  149  CTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGCGGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACA  222

Query  223  AGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGGCCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTT  296

Query  297  CGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTCTGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATG  370

Query  371  TGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACA------------------------AGGTGCTGACT  420
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        |||||||||||
Sbjct  371  TGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACTCCTTCTACAAGCTGCTCCACAGCCTCCCCCACCAGGTGCTGACT  444

Query  421  GAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCAT  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAACAACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCAT  518

Query  495  CATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCC  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGGGAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCC  592

Query  569  GGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTGCAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAG  666

Query  643  ACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCG  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATCTTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCG  740

Query  717  CCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCT  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACATCGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCT  814

Query  791  TCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCCTGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCC  888

Query  865  ATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGC-GTGAACTCAGCGT-----CAGGGCTGCGCT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|.|..|..|||     .|.|||||||||
Sbjct  889  ATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGCCAGCTGGAGGAGCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCT  962

Query  933  GGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCA  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCA  1036

Query 1007  TGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTG  1110

Query 1081  CTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGC  1184

Query 1155  GGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGC  1258

Query 1229  TGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAG  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAG  1332

Query 1303  CTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGG  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGG  1406

Query 1377  CGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGC  1450
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGC  1480

Query 1451  TGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTG  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTG  1554

Query 1525  GACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGA  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGA  1628

Query 1599  CGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTTG  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1629  CGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGT---  1674