Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: XR_001754302.2
• Aligned Length: 1885
• Identities: 1645
• Gaps: 238

Alignment

Query    1  --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  74

Query   31  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  148

Query  105  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  222

Query  179  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  296

Query  253  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  370

Query  327  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  444

Query  401  CCTTCTACA------------------------AGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC  450
            |||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTCTACAAGCTGCTCCACAGCCTCCCCCACCAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC  518

Query  451  AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG  592

Query  525  GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG  666

Query  599  CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC  740

Query  673  TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT  814

Query  747  CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC  888

Query  821  TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC  962

Query  895  CAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGCGTCAG-----------------------GGCTGCGCTGGCCTCGGCACAC  945
            |||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGCGTCAGCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACAC  1036

Query  946  CAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCAT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCAT  1110

Query 1020  CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACG  1184

Query 1094  CGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTAT  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTAT  1258

Query 1168  GCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTG  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTG  1332

Query 1242  CAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGA  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGA  1406

Query 1316  GGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATG  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1407  GGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATG  1480

Query 1390  ATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGA  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGA  1554

Query 1464  GATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCA  1537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCA  1628

Query 1538  ATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGAT  1611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGAT  1702

Query 1612  GGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTTG--------------------------------------  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                                      
Sbjct 1703  GGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCC  1776

Query 1648  --------------------------------------------------------------------------  1647
                                                                                      
Sbjct 1777  TGCCTCCTGACCCAGGACTGCTGAATACAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGC  1850

Query 1648  -----------------------------------  1647
                                               
Sbjct 1851  ATTTTATAAAATAAATAAAGCTTTAGAAAAATGAA  1885