Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489164
• Subject: XR_001754303.2
• Aligned Length: 1885
• Identities: 1619
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT  74

Query   31  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG  148

Query  105  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC  222

Query  179  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG  296

Query  253  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC  370

Query  327  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT  444

Query  401  CCTTCTACA------------------------AGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC  450
            |||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTCTACAAGCTGCTCCACAGCCTCCCCCACCAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC  518

Query  451  AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG  592

Query  525  GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG  666

Query  599  CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC  740

Query  673  TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT  814

Query  747  CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC  888

Query  821  TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC  962

Query  895  CAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGCGTCAG-----------------------GGCTGCGCTGGCCTCGGCACAC  945
            |||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGCGTCAGCAGAGGAAGCTACGTTGGGATATGGCTGCGCTGGCCTCGGCACAC  1036

Query  946  CAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCAT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 1037  CAGTGCCACCCGCTGCCCCGGACGCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCG--------------------------  1084

Query 1020  CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085  CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCGACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACG  1158

Query 1094  CGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTAT  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  CGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAGGACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTAT  1232

Query 1168  GCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTG  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  GCGGGGAAGCAGATCACCGGTGTGTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTG  1306

Query 1242  CAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGA  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  CAAAGACGTGCGCATCGGCACCATCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGA  1380

Query 1316  GGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATG  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1381  GGCTGCCCAAGGACATCAGCGATGACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATG  1454

Query 1390  ATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGA  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455  ATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGACCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGA  1528

Query 1464  GATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCA  1537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529  GATGGGCGTGCACTCAGTGGCCTATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCA  1602

Query 1538  ATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGAT  1611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603  ATGACCTTTTCCGCATCATCCCAGGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGAT  1676

Query 1612  GGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTTG--------------------------------------  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                                      
Sbjct 1677  GGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGCCTACACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCC  1750

Query 1648  --------------------------------------------------------------------------  1647
                                                                                      
Sbjct 1751  TGCCTCCTGACCCAGGACTGCTGAATACAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGC  1824

Query 1648  -----------------------------------  1647
                                               
Sbjct 1825  ATTTTATAAAATAAATAAAGCTTTAGAAAAATGAA  1859