Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489164
- Subject:
- XR_430301.3
- Aligned Length:
- 1862
- Identities:
- 1602
- Gaps:
- 258
Alignment
Query 1 --------------------------------------------ATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT 30
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGCGCCGCCCGGCCAGGCCCGCAAAGAGGCCTCCGAGCGCCATGGCTGCGCCCCCGGCCCGCGCGGACGCT 74
Query 31 GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG 104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATCCTTCGCCCACGTCGCCACCTACGGCCCGAGACACACCAGGCCGGCAGGCTGAGAAAAGCGAGACCGCGTG 148
Query 105 CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGAGGACCGCAGCAATGCAGAGTCCCTGGACAGGCTCCTGCCACCTGTGGGCACTGGGCGCTCTCCCCGGAAGC 222
Query 179 GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGACCACCAGCCAGTGCAAGTCAGAGCCTCCCCTGCTGCGTACAAGCAAGCGTACCATCTACACCGCCGGGCGG 296
Query 253 CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGCCCTGGTACAATGAACACGGCACGCAATCCAAAGAGGCCTTCGCCATCGGCTTGGGAGGCGGCAGTGCCTC 370
Query 327 TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGGAAGACCACTGTGGCCAGAATGATCATCGAGGCCCTGGATGTGCCCTGGGTGGTCTTGCTGTCCATGGACT 444
Query 401 CCTTCTACA------------------------AGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC 450
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTTCTACAAGCTGCTCCACAGCCTCCCCCACCAGGTGCTGACTGAGCAGCAGCAGGAACAGGCCGCACACAAC 518
Query 451 AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACTTCAACTTCGACCACCCAGATGCCTTTGACTTCGACCTCATCATTTCCACCCTCAAGAAGCTGAAGCAGGG 592
Query 525 GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAGAGTGTCAAGGTGCCCATTTATGACTTCACCACGCACAGCCGGAAGAAGGACTGGAAAACACTGTATGGTG 666
Query 599 CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAACGTCATCATCTTTGAGGGCATCATGGCCTTTGCTGACAAGACACTGTTGGAGCTCCTGGACATGAAGATC 740
Query 673 TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGTGGACACAGACTCCGACATCCGCCTGGTACGGCGGCTGCGCCGGGACATCAGTGAGCGCGGCCGGGACAT 814
Query 747 CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGAGGGTGTCATCAAGCAGTACAACAAGTTTGTCAAGCCCTCCTTCGACCAGTACATCCAGCCCACCATGCGCC 888
Query 821 TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGGCAGACATCGTGGTCCCCAGAGGGAGCGGCAACACGGTGGCCATCGACCTGATTGTGCAGCACGTGCACAGC 962
Query 895 CAGCTGGAGGAGCGTGAACTCAGCGTCAGGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGAC 968
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGCTGGAGG-----------------AGGGCTGCGCTGGCCTCGGCACACCAGTGCCACCCGCTGCCCCGGAC 1019
Query 969 GCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCGCAGGTACGGGGCATGCACACCATCATCAGGGACAAGGAGACCAGTCGCG 1042
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GCTGAGCGTCCTGAAGAGCACGCCG--------------------------CAGGGACAAGGAGACCAGTCGCG 1067
Query 1043 ACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAG 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 ACGAGTTCATCTTCTACTCCAAGAGACTGATGCGGCTGCTCATCGAGCACGCGCTCTCCTTCCTGCCCTTTCAG 1141
Query 1117 GACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGT 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 GACTGCGTCGTACAGACCCCGCAGGGGCAGGACTATGCGGGCAAGTGCTATGCGGGGAAGCAGATCACCGGTGT 1215
Query 1191 GTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 GTCCATTCTGCGCGCCGGTGAAACCATGGAGCCCGCGCTGCGCGCTGTGTGCAAAGACGTGCGCATCGGCACCA 1289
Query 1265 TCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGAT 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 TCCTCATCCAGACCAACCAGCTTACCGGGGAGCCCGAGCTCCACTACCTGAGGCTGCCCAAGGACATCAGCGAT 1363
Query 1339 GACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCAATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGA 1412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 GACCACGTGATCCTCATGGACTGCACCGTGTCCACGGGCGCGGCGGCCATGATGGCAGTGCGCGTGCTCCTGGA 1437
Query 1413 CCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCT 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CCACGACGTGCCTGAGGACAAGATCTTTTTGCTGTCGCTGCTCATGGCAGAGATGGGCGTGCACTCAGTGGCCT 1511
Query 1487 ATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 ATGCATTTCCGCGAGTGAGAATCATCACCACGGCGGTGGACAAGCGGGTCAATGACCTTTTCCGCATCATCCCA 1585
Query 1561 GGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGC 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 GGCATTGGGAACTTTGGCGACCGCTACTTTGGGACAGACGCGGTCCCCGATGGCAGTGACGAGGAGGAAGTGGC 1659
Query 1635 CTACACGGGTTTG------------------------------------------------------------- 1647
|||||||||||.|
Sbjct 1660 CTACACGGGTTAGCTGCCCAGTGAGCCATCCCGTCCCCACCACCCTCCTCCTGCCTCCTGACCCAGGACTGCTG 1733
Query 1648 -------------------------------------------------------------------------- 1647
Sbjct 1734 AATACAAAGATGTTAATTTTTAAAATGTTACTAGTATAATTTATTCTATGCATTTTATAAAATAAATAAAGCTT 1807
Query 1648 ------------ 1647
Sbjct 1808 TAGAAAAATGAA 1819