Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489177
- Subject:
- XM_006505300.2
- Aligned Length:
- 2785
- Identities:
- 2499
- Gaps:
- 47
Alignment
Query 1 ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCCCTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCT 74
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCCAGCTGGGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGACTTTGATGAAGTTCCCCTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCT 74
Query 75 GTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCGGCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCA 148
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTGCGTGCTGGCGGCGGCGGCGCGCGGCCAGGAGATGTACGCCCCGCACTCGATCCGGATCGAGGGGGACGTCA 148
Query 149 CCCTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTGCGGCGACATCAAGAGGGAAAAC 222
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 CCCTTGGGGGGCTGTTCCCAGTGCACGCCAAGGGTCCCAGCGGAGTGCCCTGCGGCGACATCAAGAGGGAGAAT 222
Query 223 GGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCTACGCCCTGGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGT 296
||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GGGATCCACAGGCTGGAAGCTATGCTTTATGCTCTCGACCAGATCAACAGCGATCCCAACCTGCTGCCCAACGT 296
Query 297 GACGCTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTACGCGCTCGAACAGTCGCTTACTTTCGTCC 370
.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AACGTTAGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCAGGGACACTTATGCGCTCGAACAGTCGCTCACTTTCGTCC 370
Query 371 AGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACGTGCGCTGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAG 444
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 AGGCGCTTATCCAGAAGGACACCTCCGACGTGCGTTGCACCAACGGAGAGCCCCCGGTTTTCGTCAAGCCAGAG 444
Query 445 AAAGTAGTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTCGGTCTCCATCATGGTAGCCAACATCCTGAGGCTCTTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 445 AAAGTAGTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGCTCCGTCTCCATCATGGTAGCCAACATCTTGAGGCTTTTCCA 518
Query 519 GATCCCCCAGATTAGTTATGCATCAACGGCACCCGAGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGCG 592
|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATACCTCAGATTAGTTATGCATCCACGGCTCCTGAACTCAGTGATGACCGTCGCTATGACTTCTTCTCTCGCG 592
Query 593 TGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATGGTAGACATTGTAAAGGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCT 666
||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TGGTCCCACCTGATTCCTTCCAAGCCCAAGCTATGGTAGACATTGTAAAGGCATTGGGCTGGAATTATGTATCT 666
Query 667 ACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATGGAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAGGTGG 740
||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 667 ACTCTTGCATCTGAAGGAAGCTATGGAGAGAAAGGTGTGGAGTCCTTCACACAAATTTCCAAAGAAGCAGGTGG 740
Query 741 ACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGGAACGCAAAGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCA 814
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATTCCCCAAGAACGCAAAGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCA 814
Query 815 AACAGCTCCTGGACACCCCCAACTCCAGGGCCGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGCAGATCCTT 888
||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACAGCTCTTGGACACCCCCAACTCCAGGGCTGTCGTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGCAGATCCTT 888
Query 889 GCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTTTCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAA 962
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 GCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTAGGACATTTTCTCTGGGTTGGGTCAGACAGCTGGGGTTCCAAAATCAA 962
Query 963 CCCACTGCACCAGCATGAAGATATCGCAGAAGGGGCCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCCACGGTGGAAGGGT 1036
|||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|
Sbjct 963 CCCACTGCATCAGCATGAAGATATTGCAGAAGGAGCCATCACCATCCAACCTAAGAGAGCGACTGTGGAAGGAT 1036
Query 1037 TTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACTTGAAAACAACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAA 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 TTGATGCTTACTTCACATCCCGGACACTTGAAAACAACAGGAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAAGAA 1110
Query 1111 AACTTCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAAAAAAGAAGACACAGATCGCAAATGCACAGGACAGGAGAG 1184
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1111 AACTTCAACTGCAAGTTGACAATTAGTGGATCCAAAAAAGAAGACACGGATCGCAAATGCACAGGACAGGAGCG 1184
Query 1185 AATTGGAAAAGATTCCAACTATGAGCAGGAGGGTAAAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGGCTC 1258
||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1185 AATTGGAAAAGACTCTAATTATGAGCAGGAGGGTAAAGTACAGTTTGTGATCGATGCTGTCTATGCCATGGCAC 1258
Query 1259 ACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCTGACTACCGGGGTGTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGA 1332
|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1259 ATGCCCTTCATCACATGAATAAGGATCTGTGTGCTGACTACCGGGGAGTGTGCCCAGAAATGGAGCAAGCAGGG 1332
Query 1333 GGCAAGAAGTTGCTGAAGTATATACGCAATGTTAATTTCAATGGTAGTGCTGGCACTCCAGTGATGTTTAACAA 1406
||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCAAGAAGTTGTTGAAGTATATCCGCAATGTTAACTTCAATGGTAGTGCTGGAACCCCAGTGATGTTTAACAA 1406
Query 1407 GAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTCAGTACCAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTC 1480
.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|.|||.||.|||||.||||
Sbjct 1407 AAATGGTGATGCTCCAGGACGATATGACATCTTCCAGTACCAGACAACAAACACTACCAATCCTGGTTATCGTC 1480
Query 1481 TGATCGGGCAGTGGACAGACGAACTTCAGCTCAATATAGAAGACATGCAGTGGGGTAAAGGAGTCCGAGAGATA 1554
|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481 TCATTGGGCAGTGGACAGATGAACTGCAGCTCAATATAGAGGACATGCAGTGGGGCAAAGGAGTCCGGGAGATC 1554
Query 1555 CCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCAGGACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTG 1628
||..||||.|||||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1555 CCACCCTCTGTGTGCACATTGCCATGCAAGCCTGGGCAGAGGAAGAAGACACAGAAGGGAACCCCTTGCTGCTG 1628
Query 1629 GACCTGTGAGCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGTTTGATGAGATGACATGCCAGCATTGCCCCTATGACCAGA 1702
|||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629 GACTTGTGAGCCCTGTGATGGATACCAGTATCAATTTGATGAGATGACATGTCAGCATTGTCCCTATGACCAGA 1702
Query 1703 GGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATTCCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTG 1776
||||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703 GGCCCAATGAGAACCGAACTGGCTGTCAGAACATCCCAATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTA 1776
Query 1777 ATTCCTGTCTTCCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCATCCGCTACAATGA 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTCCTGTCTTCCTGGCAATGTTGGGGATCATTGCCACCATCTTTGTCATGGCAACCTTCATCCGCTACAATGA 1850
Query 1851 CACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGCTATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCA 1924
.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1851 TACACCCATCGTCAGGGCATCTGGGCGGGAACTCAGCTATGTTTTATTGACAGGCATCTTTCTCTGCTATATCA 1924
Query 1925 TCACTTTCCTGATGATTGCCAAACCAGATGTGGCAGTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGGGCTTGGGTATG 1998
||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925 TCACCTTCCTAATGATTGCCAAGCCAGATGTGGCAGTGTGTTCCTTCCGACGTGTCTTCTTGGGGTTGGGTATG 1998
Query 1999 TGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAATCGGATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGT 2072
||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1999 TGTATTAGTTATGCAGCCCTTTTAACAAAAACCAATCGGATTTATCGCATATTCGAGCAGGGCAAGAAATCGGT 2072
Query 2073 AACAGCTCCCAGACTCATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTCAGCTTCTAG 2146
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 2073 GACAGCTCCCAGACTCATAAGCCCAACATCACAACTGGCAATTACCTCCAGTTTAATATCGGTGCAACTTCTAG 2146
Query 2147 GGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAACATCATCATAGACTATGATGAACACAAGACAATGAACCCT 2220
|.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 2147 GTGTCTTTATTTGGTTTGGGGTTGACCCACCCAACATCATCATAGACTACGATGAGCATAAGACAATGAACCCA 2220
Query 2221 GAGCAAGCCAGAGGGGTTCTCAAGTGTGACATTACAGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATAGCATTCT 2294
||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAACAAGCCAGGGGAGTTCTCAAATGTGACATCACAGACCTTCAGATCATTTGTTCTTTGGGATATAGCATTCT 2294
Query 2295 TCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGTGTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 TCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGACTCGGGGTGTACCAGAGAATTTTAATGAAGCCAAGCCCA 2368
Query 2369 TTGGATTCACTATGTACACGACATGTATAGTATGGCTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTCAATCA 2442
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 2369 TTGGATTCACTATGTACACGACTTGTATCGTATGGCTTGCCTTCATCCCAATATTTTTTGGCACAGCGCAATCA 2442
Query 2443 GCGGAAAAGCTCTACATACAAACTACCACGCTTACAATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGAT 2516
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCAGAAAAGCTCTACATACAAACCACCACGCTTACAATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGAT 2516
Query 2517 GCTATACATGCCGAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGAAGCGAAGCTTCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCTATACATGCCGAAAGTGTACATCATCATTTTCCACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGAAGCGAAGCTTCA 2590
Query 2591 AGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTGTCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCA 2664
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 2591 AGGCCGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGGCTGTCACACAAACCCAGTGACAGGCCCAATGGTGAGGCA 2664
Query 2665 AAGACCGAGCTCTGTGAAAACGTAGACCCAAACAACTGTATACCA------------------CCAGTAAGAAA 2720
|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||..|| ||| |||.|.|
Sbjct 2665 AAGACAGAACTTTGTGAAAATGTAGACCCAAACACTTG----CCATCTGGTGCATGACCGCTTCCACTCA---- 2730
Query 2721 GAGTGTACAAAAGTCTGTTACTTGGTACACTAT-CCCACCAACAGTA 2766
|.||| ||| .|||||.| |.||.|.|||
Sbjct 2731 ---TCTAC------------CTT--CACACTGTGCACATCGACA--- 2757