Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489189
• Subject: XM_017007086.1
• Aligned Length: 2628
• Identities: 2340
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGGCCGCCTACTGCTACCTGCGGGTCGTGGGCAAGGGGAGCTATGGAGAGGTGACGCTTGTGAAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCTGGCCGCCTACTGCTACCTGCGGGTCGTGGGCAAGGGGAGCTATGGAGAGGTGACGCTTGTGAAGCA  74

Query   75  CCGGCGGGACGGCAAGCAGTATGTCATCAAAAAACTGAACCTCCGAAATGCCTCTAGCCGAGAGCGGCGAGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGCGGGACGGCAAGCAGTATGTCATCAAAAAACTGAACCTCCGAAATGCCTCTAGCCGAGAGCGGCGAGCTG  148

Query  149  CTGAACAGGAAGCCCAGCTCTTGTCTCAGTTGAAGCATCCCAACATTGTCACCTACAAGGAGTCATGGGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAACAGGAAGCCCAGCTCTTGTCTCAGTTGAAGCATCCCAACATTGTCACCTACAAGGAGTCATGGGAAGGA  222

Query  223  GGAGATGGTCTGCTCTACATTGTCATGGGCTTCTGTGAAGGAGGTGATTTGTACCGAAAGCTCAAGGAGCAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGATGGTCTGCTCTACATTGTCATGGGCTTCTGTGAAGGAGGTGATTTGTACCGAAAGCTCAAGGAGCAGAA  296

Query  297  AGGGCAGCTTCTGCCGGAGAATCAGGTGGTAGAGTGGTTTGTACAGATCGCCATGGCTTTGCAGTATTTACATG  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGGCAGCTTCTGCCTGAGAATCAGGTGGTAGAGTGGTTTGTACAGATCGCCATGGCTTTGCAGTATTTACATG  370

Query  371  AAAAACACATCCTTCATCGAGATCTGAAAACTCAAAATGTCTTCCTAACAAGAACAAACATCATCAAAGTAGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAACACATCCTTCATCGAGATCTGAAAACTCAAAATGTCTTCCTAACAAGAACAAACATCATCAAAGTAGGG  444

Query  445  GACCTAGGAATTGCCCGAGTGTTGGAGAACCACTGTGACATGGCTAGCACCCTCATTGGCACACCCTACTACAT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCTAGGAATTGCCCGAGTGTTAGAGAACCACTGTGACATGGCTAGCACCCTCATTGGCACACCCTACTACAT  518

Query  519  GAGCCCTGAATTGTTCTCAAACAAACCCTACAACTATAAGTCTGATGTTTGGGCTCTAGGATGCTGTGTCTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGCCCTGAATTGTTCTCAAACAAACCCTACAACTATAAGTCTGATGTTTGGGCTCTAGGATGCTGTGTCTATG  592

Query  593  AAATGGCCACCTTGAAGCATGCTTTCAATGCAAAAGATATGAATTCTTTAGTTTATCGGATTATTGAAGGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATGGCCACCTTGAAGCATGCTTTCAATGCAAAAGATATGAATTCTTTAGTTTATCGGATTATTGAAGGAAAG  666

Query  667  CTGCCAGCAATGCCAAGAGATTACAGCCCAGAGCTGGCAGAACTGATAAGAACAATGCTGAGCAAAAGGCCTGA  740
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCCACCAATGCCAAGAGATTACAGCCCAGAGCTGGCAGAACTGATAAGAACAATGCTGAGCAAAAGGCCTGA  740

Query  741  AGAAAGGCCGTCTGTGAGGAGCATCCTGAGGCAGCCTTATATAAAGCGGCAAATCTCCTTCTTTTTGGAGGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAAGGCCGTCTGTGAGGAGCATCCTGAGGCAGCCTTATATAAAGCGGCAAATCTCCTTCTTTTTGGAGGCCA  814

Query  815  CAAAGATAAAAACCTCCAAAAATAACATTAAAAATGGTGACTCTCAATCCAAGCCTTTTGCTACAGTGGTTTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAAGATAAAAACCTCCAAAAATAACATTAAAAATGGTGACTCTCAATCCAAGCCTTTTGCTACAGTGGTTTCT  888

Query  889  GGAGAGGCAGAATCAAATCATGAAGTAATCCACCCCCAACCACTCTCTTCTGAGGGCTCCCAGACATATATAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGAGGCAGAATCAAATCATGAAGTAATCCACCCCCAACCACTCTCTTCTGAGGGCTCCCAGACATATATAAT  962

Query  963  GGGTGAAGGCAAATGTTTGTCCCAGGAGAAACCCAGGGCCTCTGGTCTCTTGAAGTCACCTGCCAGTCTGAAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGTGAAGGCAAATGTTTGTCCCAGGAGAAACCCAGGGCCTCTGGTCTCTTGAAGTCACCTGCCAGTCTGAAAG  1036

Query 1037  CCCATACCTGCAAACAGGACTTGAGCAATACCACAGAACTAGCCACAATCAGTAGCGTAAATATTGACATCTTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCATACCTGCAAACAGGACTTGAGCAATACCACAGAACTAGCCACAATCAGTAGCGTAAATATTGACATCTTA  1110

Query 1111  CCTGCAAAAGGGAGGGATTCAGTGAGTGATGGCTTTGTTCAGGAGAATCAGCCAAGATATTTGGATGCCTCTAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGCAAAAGGGAGGGATTCAGTGAGTGATGGCTTTGTTCAGGAGAATCAGCCAAGATATTTGGATGCCTCTAA  1184

Query 1185  TGAGTTAGGAGGTATATGCAGTATTTCTCAAGTGGAAGAGGAGATGCTGCAGGACAACACTAAATCCAGTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGTTAGGAGGTATATGCAGTATTTCTCAAGTGGAAGAGGAGATGCTGCAGGACAACACTAAATCCAGTGCCC  1258

Query 1259  AGCCTGAAAACCTGATTCCCATGTGGTCCTCTGACATTGTCACTGGGGAAAAGAATGAACCAGTGAAGCCTCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCTGAAAACCTGATTCCCATGTGGTCCTCTGACATTGTCACTGGGGAAAAGAATGAACCAGTGAAGCCTCTG  1332

Query 1333  CAGCCCCTAATCAAAGAACAAAAGCCAAAGGACCAGAGTCTTGCCCTGTCGCCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1333  CAGCCCCTAATCAAAGAACAAAAGCCAAAGGA------------------------------------------  1364

Query 1407  AATCTTGGCTCACAGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCAGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA  1480
                                                                                      
Sbjct 1365  --------------------------------------------------------------------------  1364

Query 1481  TTACAGGCGTGTGCCACCACGCCCAGGATCAAGTTGCTGGTGAATGTATTATAGAAAAACAGGGCAGAATCCAC  1554
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365  ----------------------CCAGGATCAAGTTGCTGGTGAATGTATTATAGAAAAACAGGGCAGAATCCAC  1416

Query 1555  CCAGATTTACAGCCACACAACTCTGGGTCTGAACCTTCCCTGTCTCGACAGCGACGGCAAAAGAGGAGAGAACA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417  CCAGATTTACAGCCACACAACTCTGGGTCTGAACCTTCCCTGTCTCGACAGCGACGGCAAAAGAGGAGAGAACA  1490

Query 1629  GACTGAGCACAGAGGGGAAAAGAGACAGGTCCGCAGAGATCTCTTTGCTTTCCAAGAGTCGCCTCCTCGATTTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491  GACTGAGCACAGAGGGGAAAAGAGACAGGTCCGCAGAGATCTCTTTGCTTTCCAAGAGTCGCCTCCTCGATTTT  1564

Query 1703  TGCCTTCTCATCCCATTGTTGGGAAAGTGGATGTCACATCAACACAAAAAGAGGCTGAAAACCAACGTAGAGTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  TGCCTTCTCATCCCATTGTTGGGAAAGTGGATGTCACATCAACACAAAAAGAGGCTGAAAACCAACGTAGAGTG  1638

Query 1777  GTCACTGGGTCTGTGAGCAGTTCAAGGAGCAGTGAGATGTCATCATCAAAGGATCGACCATTATCAGCCAGAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639  GTCACTGGGTCTGTGAGCAGTTCAAGGAGCAGTGAGATGTCATCATCAAAGGATCGACCATTATCAGCCAGAGA  1712

Query 1851  GAGGAGGCGACTAAAGCAGTCACAGGAAGAAATGTCCTCTTCAGGCCCTTCAGTGAGGAAAGCGTCTCTGAGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713  GAGGAGGCGACTAAAGCAGTCACAGGAAGAAATGTCCTCTTCAGGCCCTTCAGTGAGGAAAGCGTCTCTGAGTG  1786

Query 1925  TAGCAGGGCCAGGAAAACCCCAGGAAGAAGACCAGCCCTTGCCTGCCCGACGGCTCTCCTCTGACTGCAGCGTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787  TAGCAGGGCCAGGAAAACCCCAGGAAGAAGACCAGCCCTTGCCTGCCCGACGGCTCTCCTCTGACTGCAGCGTC  1860

Query 1999  ACTCAGGAAAGGAAACAGATTCATTGTCTGTCTGAGGATGAGTTAAGTTCTTCTACAAGTTCAACTGATAAGTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861  ACTCAGGAAAGGAAACAGATTCATTGTCTGTCTGAGGATGAGTTAAGTTCTTCTACAAGTTCAACTGATAAGTC  1934

Query 2073  AGATGGGGATTACGGGGAAGGGAAAGGTCAGACAAATGAAATTAATGCCTTGGTACAATTGATGACTCAGACCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935  AGATGGGGATTACGGGGAAGGGAAAGGTCAGACAAATGAAATTAATGCCTTGGTACAATTGATGACTCAGACCC  2008

Query 2147  TGAAACTGGATTCTAAAGAGAGCTGTGAAGATGTCCCGGTAGCAAACCCAGTGTCAGAATTCAAACTTCATCGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009  TGAAACTGGATTCTAAAGAGAGCTGTGAAGATGTCCCGGTAGCAAACCCAGTGTCAGAATTCAAACTTCATCGG  2082

Query 2221  AAATATCGGGACACACTGATACTTCATGGGAAGGTTGCAGAAGAGGCAGAGGAAATCCATTTTAAAGAGCTACC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083  AAATATCGGGACACACTGATACTTCATGGGAAGGTTGCAGAAGAGGCAGAGGAAATCCATTTTAAAGAGCTACC  2156

Query 2295  TTCAGCTATTATGCCAGGTTCTGAAAAGATCAGGAGACTAGTTGAAGTCTTGAGAACTGATGTAATTCGTGGCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157  TTCAGCTATTATGCCAGGTTCTGAAAAGATCAGGAGACTAGTTGAAGTCTTGAGAACTGATGTAATTCGTGGCC  2230

Query 2369  TGGGAGTTCAGCTTTTAGAGCAGGTGTATGATCTTTTGGAGGAGGAGGATGAATTTGATAGAGAGGT-------  2435
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|       
Sbjct 2231  TGGGAGTTCAGCTTTTAGAGCAGGTGTATGATCTTTTGGAGGAGGAGGATGAATTTGATAGAGAGCTTCTCCCT  2304

Query 2436  --------ACGTTTG----------------CGGGAGCACATGGGTGAAAAGTATACAACTTACAGTGT---GA  2482
                    ||.||||                |.|||    .||..||..|  |.|.||.|.|.|||.||   ||
Sbjct 2305  GTGTTCACACCTTTGATGCATTCCCTGCCATCTGGA----TTGTTTGCTA--TCTTCACCCTGCAGAGTCCAGA  2372

Query 2483  AAGCTCGCCAGTTGAAATTTTTTGAAGAAAACATG-----AATTTT----------------------------  2523
            ...|||||            ||||.....||||||     |||..|                            
Sbjct 2373  GCTCTCGC------------TTTGTCTCCAACATGGAGATAATGCTCAGGTCAGGAAGACAGATTCCCAGAAAG  2434

Query 2524  --------------------------------------  2523
                                                  
Sbjct 2435  ACCAGGTTCCTGTAGTTCTCCTACATCACTTCCCTGTA  2472