Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489197
- Subject:
- NM_001278066.1
- Aligned Length:
- 3598
- Identities:
- 2696
- Gaps:
- 895
Alignment
Query 1 ATGGTCGGGCTCCTTTTGTTTTTTTTCCCAGCGATCTTTTTGGAGGTGTCCCTTCTCCCCAGAAGCCCCGGCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCGGGCTCCTTTTGTTTTTTTTCCCAGCGATCTTTTTGGAGGTGTCCCTTCTCCCCAGAAGCCCCGGCAG 74
Query 75 GAAAGTGTTGCTGGCAGGAGCGTCGTCTCAGCGCTCGGTGGCCAGAATGGACGGAGATGTCATCATTGGAGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAAGTGTTGCTGGCAGGAGCGTCGTCTCAGCGCTCGGTGGCCAGAATGGACGGAGATGTCATCATTGGAGCCC 148
Query 149 TCTTCTCAGTCCATCACCAGCCTCCGGCCGAGAAAGTGCCCGAGAGGAAGTGTGGGGAGATCAGGGAGCAGTAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTTCTCAGTCCATCACCAGCCTCCGGCCGAGAAAGTGCCCGAGAGGAAGTGTGGGGAGATCAGGGAGCAGTAT 222
Query 223 GGCATCCAGAGGGTGGAGGCCATGTTCCACACGTTGGATAAGATCAACGCGGACCCGGTCCTCCTGCCCAACAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCATCCAGAGGGTGGAGGCCATGTTCCACACGTTGGATAAGATCAACGCGGACCCGGTCCTCCTGCCCAACAT 296
Query 297 CACCCTGGGCAGTGAGATCCGGGACTCCTGCTGGCACTCTTCCGTGGCTCTGGAACAGAGCATTGAGTTCATTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACCCTGGGCAGTGAGATCCGGGACTCCTGCTGGCACTCTTCCGTGGCTCTGGAACAGAGCATTGAGTTCATTA 370
Query 371 GGGACTCTCTGATTTCCATTCGAGATGAGAAGGATGGGATCAACCGGTGTCTGCCTGACGGCCAGTCCCTCCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACTCTCTGATTTCCATTCGAGATGAGAAGGATGGGATCAACCGGTGTCTGCCTGACGGCCAGTCCCTCCCC 444
Query 445 CCAGGCAGGACTAAGAAGCCCATTGCGGGAGTGATCGGTCCCGGCTCCAGCTCTGTAGCCATTCAAGTGCAGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAGGCAGGACTAAGAAGCCCATTGCGGGAGTGATCGGTCCCGGCTCCAGCTCTGTAGCCATTCAAGTGCAGAA 518
Query 519 CCTGCTCCAGCTCTTCGACATCCCCCAGATCGCTTATTCAGCCACAAGCATCGACCTGAGTGACAAAACTTTGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGCTCCAGCTCTTCGACATCCCCCAGATCGCTTATTCAGCCACAAGCATCGACCTGAGTGACAAAACTTTGT 592
Query 593 ACAAATACTTCCTGAGGGTTGTCCCTTCTGACACTTTGCAGGCAAGGGCCATGCTTGACATAGTCAAACGTTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAATACTTCCTGAGGGTTGTCCCTTCTGACACTTTGCAGGCAAGGGCCATGCTTGACATAGTCAAACGTTAC 666
Query 667 AATTGGACCTATGTCTCTGCAGTCCACACGGAAGGGAATTATGGGGAGAGCGGAATGGACGCTTTCAAAGAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATTGGACCTATGTCTCTGCAGTCCACACGGAAGGGAATTATGGGGAGAGCGGAATGGACGCTTTCAAAGAGCT 740
Query 741 GGCTGCCCAGGAAGGCCTCTGTATCGCCCATTCTGACAAAATCTACAGCAACGCTGGGGAGAAGAGCTTTGACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCTGCCCAGGAAGGCCTCTGTATCGCCCATTCTGACAAAATCTACAGCAACGCTGGGGAGAAGAGCTTTGACC 814
Query 815 GACTCTTGCGCAAACTCCGAGAGAGGCTTCCCAAGGCTAGAGTGGTGGTCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACTCTTGCGCAAACTCCGAGAGAGGCTTCCCAAGGCTAGAGTGGTGGTCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTG 888
Query 889 CGAGGACTCCTGAGCGCCATGCGGCGCCTTGGCGTCGTGGGCGAGTTCTCACTCATTGGAAGTGATGGATGGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGAGGACTCCTGAGCGCCATGCGGCGCCTTGGCGTCGTGGGCGAGTTCTCACTCATTGGAAGTGATGGATGGGC 962
Query 963 AGACAGAGATGAAGTCATTGAAGGTTATGAGGTGGAAGCCAACGGGGGAATCACGATAAAGCTGCAGTCTCCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGACAGAGATGAAGTCATTGAAGGTTATGAGGTGGAAGCCAACGGGGGAATCACGATAAAGCTGCAGTCTCCAG 1036
Query 1037 AGGTCAGGTCATTTGATGATTATTTCCTGAAACTGAGGCTGGACACTAACACGAGGAATCCCTGGTTCCCTGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTCAGGTCATTTGATGATTATTTCCTGAAACTGAGGCTGGACACTAACACGAGGAATCCCTGGTTCCCTGAG 1110
Query 1111 TTCTGGCAACATCGGTTCCAGTGCCGCCTTCCAGGACACCTTCTGGAAAATCCCAACTTTAAACGAATCTGCAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCTGGCAACATCGGTTCCAGTGCCGCCTTCCAGGACACCTTCTGGAAAATCCCAACTTTAAACGAATCTGCAC 1184
Query 1185 AGGCAATGAAAGCTTAGAAGAAAACTATGTCCAGGACAGTAAGATGGGGTTTGTCATCAATGCCATCTATGCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGCAATGAAAGCTTAGAAGAAAACTATGTCCAGGACAGTAAGATGGGGTTTGTCATCAATGCCATCTATGCCA 1258
Query 1259 TGGCACATGGGCTGCAGAACATGCACCATGCCCTCTGCCCTGGCCACGTGGGCCTCTGCGATGCCATGAAGCCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGCACATGGGCTGCAGAACATGCACCATGCCCTCTGCCCTGGCCACGTGGGCCTCTGCGATGCCATGAAGCCC 1332
Query 1333 ATCGACGGCAGCAAGCTGCTGGACTTCCTCATCAAGTCCTCATTCATTGGAGTATCTGGAGAGGAGGTGTGGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCGACGGCAGCAAGCTGCTGGACTTCCTCATCAAGTCCTCATTCATTGGAGTATCTGGAGAGGAGGTGTGGTT 1406
Query 1407 TGATGAGAAAGGAGACGCTCCTGGAAGGTATGATATCATGAATCTGCAGTACACTGAAGCTAATCGCTATGACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGATGAGAAAGGAGACGCTCCTGGAAGGTATGATATCATGAATCTGCAGTACACTGAAGCTAATCGCTATGACT 1480
Query 1481 ATGTGCACGTTGGAACCTGGCATGAAGGAGTGCTGAACATTGATGATTACAAAATCCAGATGAACAAGAGTGGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGTGCACGTTGGAACCTGGCATGAAGGAGTGCTGAACATTGATGATTACAAAATCCAGATGAACAAGAGTGGA 1554
Query 1555 GTGGTGCGGTCTGTGTGCAGTGAGCCTTGCTTAAAGGGCCAGATTAAGGTTATACGGAAAGGAGAAGTGAGCTG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGGTGCGGTCTGTGTGCAGTGAGCCTTGCTTAAAGGGCCAGATTAAGGTTATACGGAAAGGAGAAGTGAGCTG 1628
Query 1629 CTGCTGGATTTGCACGGCCTGCAAAGAGAATGAATATGTGCAAGATGAGTTCACCTGCAAAGCTTGTGACTTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTGCTGGATTTGCACGGCCTGCAAAGAGAATGAATATGTGCAAGATGAGTTCACCTGCAAAGCTTGTGACTTGG 1702
Query 1703 GATGGTGGCCCAATGCAGATCTAACAGGCTGTGAGCCCATTCCTGTGCGCTATCTTGAGTGGAGCAACATCGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GATGGTGGCCCAATGCAGATCTAACAGGCTGTGAGCCCATTCCTGTGCGCTATCTTGAGTGGAGCAACATCGAA 1776
Query 1777 TCCATTATAGCCATCGCCTTTTCATGCCTGGGAATCCTTGTTACCTTGTTTGTCACCCTAATCTTTGTACTGTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCATTATAGCCATCGCCTTTTCATGCCTGGGAATCCTTGTTACCTTGTTTGTCACCCTAATCTTTGTACTGTA 1850
Query 1851 CCGGGACACACCAGTGGTCAAATCCTCCAGTCGGGAGCTCTGCTACATCATCCTAGCTGGCATCTTCCTTGGTT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCGGGACACACCAGTGGTCAAATCCTCCAGTCGGGAGCTCTGCTACATCATCCTAGCTGGCATCTTCCTTGGTT 1924
Query 1925 ATGTGTGCCCATTCACTCTCATTGCCAAACCTACTACCACCTCCTGCTACCTCCAGCGCCTCTTGGTTGGCCTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGTGTGCCCATTCACTCTCATTGCCAAACCTACTACCACCTCCTGCTACCTCCAGCGCCTCTTGGTTGGCCTC 1998
Query 1999 TCCTCTGCGATGTGCTACTCTGCTTTAGTGACTAAAACCAATCGTATTGCACGCATCCTGGCTGGCAGCAAGAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCCTCTGCGATGTGCTACTCTGCTTTAGTGACTAAAACCAATCGTATTGCACGCATCCTGGCTGGCAGCAAGAA 2072
Query 2073 GAAGATCTGCACCCGGAAGCCCAGGTTCATGAGTGCCTGGGCTCAGGTGATCATTGCCTCAATTCTGATTAGTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAAGATCTGCACCCGGAAGCCCAGGTTCATGAGTGCCTGGGCTCAGGTGATCATTGCCTCAATTCTGATTAGTG 2146
Query 2147 TGCAACTAACCCTGGTGGTAACCCTGATCATCATGGAACCCCCTATGCCCATTCTGTCCTACCCAAGTATCAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGCAACTAACCCTGGTGGTAACCCTGATCATCATGGAACCCCCTATGCCCATTCTGTCCTACCCAAGTATCAAG 2220
Query 2221 GAAGTCTACCTTATCTGCAATACCAGCAACCTGGGTGTGGTGGCCCCTTTGGGCTACAATGGACTCCTCATCAT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAAGTCTACCTTATCTGCAATACCAGCAACCTGGGTGTGGTGGCCCCTTTGGGCTACAATGGACTCCTCATCAT 2294
Query 2295 GAGCTGTACCTACTATGCCTTCAAGACCCGCAACGTGCCCGCCAACTTCAACGAGGCCAAATATATCGCGTTCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GAGCTGTACCTACTATGCCTTCAAGACCCGCAACGTGCCCGCCAACTTCAACGAGGCCAAATATATCGCGTTCA 2368
Query 2369 CCATGTACACCACCTGTATCATCTGGCTAGCTTTTGTGCCCATTTACTTTGGGAGCAACTACAAGATCATCACA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCATGTACACCACCTGTATCATCTGGCTAGCTTTTGTGCCCATTTACTTTGGGAGCAACTACAAGATCATCACA 2442
Query 2443 ACTTGCTTTGCAGTGAGTCTCAGTGTAACAGTGGCTCTGGGGTGCATGTTCACTCCCAAGATGTACATCATTAT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTTGCTTTGCAGTGAGTCTCAGTGTAACAGTGGCTCTGGGGTGCATGTTCACTCCCAAGATGTACATCATTAT 2516
Query 2517 TGCCAAGCCTGAGAGGAATGTCCGCAGTGCCTTCACCACCTCTGATGTTGTCCGCATGCATGTTGGCGATGGCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGCCAAGCCTGAGAGGAATGTCCGCAGTGCCTTCACCACCTCTGATGTTGTCCGCATGCATGTTGGCGATGGCA 2590
Query 2591 AGCTGCCCTGCCGCTCCAACACTTTCCTCAACATCTTCCGAAGAAAGAAGGCAGGGGCAGGGAATGCCAATTCT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGCTGCCCTGCCGCTCCAACACTTTCCTCAACATCTTCCGAAGAAAGAAGGCAGGGGCAGGGAATGCCAA---- 2660
Query 2665 AATGGCAAGTCTGTGTCATGGTCTGAACCAGGTGGAGGACAG---------GTGCCCAAGGGACAGCATATGT- 2728
||| |||| ||| ..||||| .||||..||||
Sbjct 2661 ------------------------GAA-------GAGG-CAGCCAGAATTCTCGCCCA----CCAGCCAATGTC 2698
Query 2729 ----GGCACCGCCTCTCTGTGCA-CGTGAAGACCAATGAGACGGCCTGCAACCAAACAGCCGTCATCAAGCCCC 2797
||||| .|||||| |.|
Sbjct 2699 CGTCGGCAC-------ATGTGCAGCTT----------------------------------------------- 2718
Query 2798 TCACTAAAAGTTACCAAGGCTCTGGCAAGAGCCTGACCTTTTCAGATACCAGCACCAAGACCCTTTACAACGTA 2871
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2872 GAGGAGGAGGAGGATGCCCAGCCGATTCGCTTTAGCCCGCCTGGTAGCCCTTCCATGGTGGTGCACAGGCGCGT 2945
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2946 GCCAAGCGCGGCGACCACTCCGCCTCTGCCGTCCCACCTGACCGCAGAGGAGACCCCCCTCTTCCTGGCCGAAC 3019
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3020 CAGCCCTCCCCAAGGGCTTGCCCCCTCCTCTCCAGCAGCAGCAGCAACCCCCTCCACAGCAGAAATCGCTGATG 3093
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3094 GACCAGCTCCAGGGAGTGGTCAGCAACTTCAGTACCGCGATCCCGGATTTTCACGCGGTGCTGGCAGGCCCCGG 3167
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3168 GGGTCCCGGGAACGGGCTGCGGTCCCTGTACCCGCCCCCGCCACCTCCGCAGCACCTGCAGATGCTGCCGCTGC 3241
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3242 AGCTGAGCACCTTTGGGGAGGAGCTGGTCTCCCCGCCCGCGGACGACGACGACGACAGCGAGAGGTTTAAGCTC 3315
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3316 CTCCAGGAGTACGTGTATGAGCACGAGCGGGAAGGGAACACGGAAGAAGACGAACTGGAAGAGGAGGAGGAGGA 3389
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3390 CCTGCAGGCGGCCAGCAAACTGACCCCGGATGATTCGCCTGCGCTGACGCCTCCGTCGCCTTTCCGCGACTCGG 3463
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3464 TGGCCTCGGGCAGCTCGGTGCCCAGCTCCCCCGTGTCCGAGTCGGTGCTCTGCACCCCTCCCAACGTATCCTAC 3537
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3538 GCCTCTGTCATTCTGCGGGACTACAAGCAAAGCTCTTCCACCCTGG 3583
Sbjct 2719 ---------------------------------------------- 2718