Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489226
• Subject: NM_001081414.2
• Aligned Length: 3560
• Identities: 3155
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGTCCTTCTGTTGATCCTGTCAGTCTTACTTTTGAAAGAAGATGTCCGTGGGAGTGCACAGTCCAGTGAGAG  74
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCCTTCTGTTGATTCTGTCAGTCCTACTTCTGAAAGAAGATGTACGAGGAAGTGCACAGTCCAGTGAGAG  74

Query   75  GAGGGTGGTGGCTCACATGCCGGGTGACATCATTATTGGAGCTCTCTTTTCTGTTCATCACCAGCCTACTGTGG  148
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct   75  GAGGGTGGTGGCTCACATGCCAGGTGACATTATTATTGGAGCTCTCTTCTCGGTCCACCACCAACCAACTGTGG  148

Query  149  ACAAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCGGTCCGTGAACAGTATGGCATTCAGAGAGTGGAGGCCATGCTGCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ACAAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCAGTCCGTGAGCAGTATGGCATTCAGAGAGTGGAAGCCATGCTGCAT  222

Query  223  ACCCTGGAAAGGATCAATTCAGACCCCACACTCTTGCCCAACATCACACTGGGCTGTGAGATAAGGGACTCCTG  296
            |||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  ACCTTGGAAAGGATCAATTCAGATCCCACACTCTTGCCCAACATCACACTAGGCTGTGAGATAAGAGATTCCTG  296

Query  297  CTGGCATTCGGCTGTGGCCCTAGAGCAGAGCATTGAGTTCATAAGAGATTCCCTCATTTCTTCAGAAGAGGAAG  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CTGGCATTCTGCTGTGGCCCTAGAGCAAAGCATTGAGTTTATAAGGGATTCCCTCATCTCTTCGGAAGAGGAAG  370

Query  371  AAGGCTTGGTACGCTGTGTGGATGGCTCCTCCTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAGCCCATAGTAGGGGTCATTGGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||   |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAGGCTTGGTACGCTGTGTAGATGG---CTCTTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAACCCATAGTGGGAGTCATTGGG  441

Query  445  CCTGGCTCCAGTTCTGTAGCCATTCAGGTCCAGAATTTGCTCCAGCTTTTCAACATACCTCAGATTGCTTACTC  518
            ||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  CCTGGCTCGAGTTCTGTGGCCATTCAAGTTCAGAACTTGCTCCAGCTTTTCAACATACCTCAGATTGCTTACTC  515

Query  519  AGCAACCAGCATGGATCTGAGTGACAAGACTCTGTTCAAATATTTCATGAGGGTTGTGCCTTCAGATGCTCAGC  592
            .|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  516  TGCAACTAGCATGGATTTGAGTGACAAGACTCTATTCAAGTACTTCATGAGGGTTGTACCTTCGGATGCCCAGC  589

Query  593  AGGCAAGGGCCATGGTGGACATAGTGAAGAGGTACAACTGGACCTATGTATCAGCCGTGCACACAGAAGGCAAC  666
            |.||..|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGCCCGAGCCATGGTAGACATAGTGAAGAGATACAACTGGACTTATGTCTCAGCTGTGCACACAGAAGGCAAC  663

Query  667  TATGGAGAAAGTGGGATGGAAGCCTTCAAAGATATGTCAGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TATGGAGAAAGTGGGATGGAGGCTTTCAAAGATATGTCAGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAA  737

Query  741  AATCTACAGTAATGCAGGGGAGCAGAGCTTTGATAAGCTGCTGAAGAAGCTCACAAGTCACTTGCCCAAGGCCC  814
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||.||||||.||.||.||.||||
Sbjct  738  AATCTACAGCAATGCTGGGGAACAGAGCTTTGACAAGCTGTTGAAAAAGCTCAGAAGTCATTTACCTAAAGCCC  811

Query  815  GGGTGGTGGCCTGCTTCTGTGAGGGCATGACGGTGAGAGGTCTGCTGATGGCCATGAGGCGCCTGGGTCTAGCG  888
            |||||||.||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.
Sbjct  812  GGGTGGTAGCCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTTCGAGGTCTGCTCATGGCCATGAGACGCTTGGGTCTAGCA  885

Query  889  GGAGAATTTCTGCTTCTGGGCAGTGATGGCTGGGCTGACAGGTATGATGTGACAGATGGATATCAGCGAGAAGC  962
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  886  GGGGAATTTCTACTTCTGGGCAGTGATGGCTGGGCTGACAGGTATGACGTGACAGATGGGTATCAGCGAGAAGC  959

Query  963  TGTTGGTGGCATCACAATCAAGCTCCAATCTCCCGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTCCGGC  1036
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TGTCGGTGGGATTACAATCAAGCTCCAGTCTCCTGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTCCGGC  1033

Query 1037  CAGAAACAAACCACCGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCATCGTTTTCAGTGCCGACTGGAAGGGTTT  1110
            ||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1034  CAGAAACAAACCTCAGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCATCGTTTTCAGTGCCGGCTAGAAGGGTTT  1107

Query 1111  CCACAGGAGAACAGCAAATACAACAAGACTTGCAATAGTTCTCTGACTCTGAAAACACATCATGTTCAGGATTC  1184
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1108  GCACAGGAGAACAGCAAGTACAACAAGACTTGCAACAGTTCTCTAACTCTGAGAACGCATCATGTTCAAGATTC  1181

Query 1185  CAAAATGGGATTTGTGATCAACGCCATCTATTCGATGGCCTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTCTGCC  1258
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1182  CAAAATGGGATTTGTGATCAATGCAATCTATTCTATGGCTTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTGTGTC  1255

Query 1259  CAGGCTATGCAGGACTCTGTGATGCCATGAAGCCAATTGATGGACGGAAACTTTTGGAGTCCCTGATGAAAACC  1332
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1256  CAGGCTATGCAGGCCTCTGTGATGCAATGAAGCCAATTGATGGGCGGAAACTTTTGGACTCCCTGATGAAAACC  1329

Query 1333  AATTTTACTGGGGTTTCTGGAGATACGATCCTATTCGATGAGAATGGAGACTCTCCAGGAAGGTATGAAATAAT  1406
            ||.||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  AACTTTACTGGAGTTTCCGGAGATATGATTCTATTTGATGAAAATGGAGACTCTCCAGGAAGGTATGAAATAAT  1403

Query 1407  GAATTTCAAGGAAATGGGAAAAGATTACTTTGATTATATCAACGTTGGAAGTTGGGACAATGGAGAATTAAAAA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404  GAATTTCAAGGAAATGGGAAAAGATTATTTTGATTACATCAATGTTGGAAGTTGGGACAATGGGGAATTAAAAA  1477

Query 1481  TGGATGATGATGAAGTATGGTCCAAGAAAAGCAACATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCATGTGAGAAAGGC  1554
            ||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1478  TGGATGATGATGAAGTGTGGTCCAAGAAAAATAACATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCGTGTGAGAAAGGA  1551

Query 1555  CAGATCAAGGTGATCCGAAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGTACACCTTGTAAGGAGAATGAGTATGT  1628
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CAGATAAAGGTGATCCGGAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGCACACCTTGTAAGGAGAATGAGTATGT  1625

Query 1629  CTTTGATGAGTACACATGCAAGGCATGCCAACTGGGGTCTTGGCCCACTGATGATCTCACAGGTTGTGACTTGA  1702
            .||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 1626  TTTTGATGAGTACACCTGCAAGGCGTGCCAACTGGGGTCCTGGCCCACTGACGACTTGACAGGTTGTGATTTGA  1699

Query 1703  TCCCAGTACAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAACCCATTGCAGCTGTGGTGTTTGCCTGCCTTGGCCTCCTG  1776
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1700  TCCCAGTCCAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAGCCCATTGCAGCTGTGGTGTTTGCCTGCCTCGGTCTGCTA  1773

Query 1777  GCCACCCTGTTTGTTACTGTAGTCTTCATCATTTACCGTGATACACCAGTAGTCAAGTCCTCAAGCAGGGAACT  1850
            ||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1774  GCCACCCTCTTCGTTACTGTAATCTTCATCATTTATCGGGACACTCCAGTGGTCAAGTCTTCCAGCAGGGAACT  1847

Query 1851  CTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGCTACTTATGTACCTTCTGCCTCATTGCGAAGCCCAAACAGA  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848  CTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGTTACTTGTGTACCTTCTGCCTCATTGCAAAGCCCAAACAGA  1921

Query 1925  TTTACTGCTACCTTCAGAGAATTGGCATTGGTCTCTCCCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACAAAGACC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1922  TTTACTGCTACCTTCAGAGAATTGGCATCGGTCTCTCTCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACGAAGACC  1995

Query 1999  AACCGTATTGCAAGGATCCTGGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACCAAAAAGCCCAGATTCATGAGTGCCTG  2072
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1996  AACCGTATTGCAAGGATTCTAGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACCAAAAAGCCCAGATTCATGAGCGCCTG  2069

Query 2073  TGCCCAGCTAGTGATTGCTTTCATTCTCATATGCATCCAGTTGGGCATCATCGTTGCCCTCTTTATAATGGAGC  2146
            |||.|||.|||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2070  TGCTCAGTTAGTGATCGCTTTCATTCTCATCTGTATACAGTTGGGTATTATTGTGGCCCTCTTTATCATGGAGC  2143

Query 2147  CTCCTGACATAATGCATGACTACCCAAGCATTCGAGAAGTCTACCTGATCTGTAACACCACCAACCTAGGAGTT  2220
            ||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2144  CTCCGGATATAATGCATGACTATCCAAGCATCCGAGAAGTCTACTTGATTTGTAACACCACCAACCTAGGGGTT  2217

Query 2221  GTCACTCCACTTGGATACAATGGATTGTTGATTTTGAGCTGCACCTTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCC  2294
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  GTCACTCCTCTTGGATACAATGGATTATTGATTTTGAGTTGCACATTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCC  2291

Query 2295  AGCTAACTTCAACGAGGCCAAGTATATCGCCTTCACAATGTACACGACCTGCATTATATGGCTAGCTTTTGTGC  2368
            |||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2292  AGCCAACTTTAACGAGGCCAAATATATTGCTTTCACCATGTACACAACCTGCATCATATGGCTGGCCTTTGTGC  2365

Query 2369  CAATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAATCATCACCATGTGTTTCTCGGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTA  2442
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2366  CTATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAATCATCACCATGTGTTTCTCAGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTG  2439

Query 2443  GGCTGCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTGGCCAAACCAGAGAGAAACGTGCGCAGCGCCTTCACCAC  2516
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2440  GGTTGCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTAGCCAAACCGGAGAGAAATGTGCGCAGCGCCTTCACAAC  2513

Query 2517  ATCTACCGTGGTGCGCATGCATGTAGGGGATGGCAAGTCATCCTCCGCAGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCA  2590
            .|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  CTCTACAGTGGTGCGCATGCACGTAGGAGATGGCAAGTCATCATCCGCTGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCA  2587

Query 2591  ACCTGTGGAAGAGAAGGGGCTCCTCTGGGGAAACCTTAAGTTCCAATGGAAAATCCGTCACGTGGGCCCAGAAT  2664
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2588  ACCTGTGGAAGAGGAGGGGCTCGTCTGGGGAAACCCTAAGCTCCAATGGAAAATCCGTGACTTGGGCCCAGAAT  2661

Query 2665  GAGAAGAGCAGCCGGGGGCAGCACCTGTGGCAGCGCCTGTCCATCCACATCAACAAGAAAGAAAACCCCAACCA  2738
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2662  GAGAAGAGCACCCGGGGGCAGCACCTGTGGCAGCGACTGTCTGTCCATATCAACAAGAAGGAGAACCCCAACCA  2735

Query 2739  AACGGCCGTCATCAAGCCCTTCCCCAAGAGCACGGAGAGCCGTGGCCTGGGCGCTGGCGCTGGCGCAGGCGGGA  2812
            .||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|.|      ||.||.||.|||||.||..
Sbjct 2736  GACAGCAGTCATCAAACCCTTCCCCAAGAGCACAGAGAGCCGCGGGCAG------GGTGCAGGGGCAGGTGGTG  2803

Query 2813  GCGCTGGGGGCGTGGGGGCCACGG-GC----GGTGCGGGCTGCGCAG---GCGCCGGCCCAGGCGGGCCCGAGT  2878
            ||.||           ||||.||| ||    |||||.||..||||||   ||.|.|...|||||||.||.|||.
Sbjct 2804  GCTCT-----------GGCCCCGGTGCAGCTGGTGCTGGTAGCGCAGGATGCACAGCGACAGGCGGCCCAGAGC  2866

Query 2879  CCCCAGACGCCGGCCCCAAGGCGCTGTATGATGTGGCCGAGGCTGAGGAGCACTTCCCGGCGCCCGCGCGGCCG  2952
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||.||||||.|||.|.||..|||||
Sbjct 2867  CACCAGACGCCGGCCCCAAGGCGCTTTATGATGTCGCAGAGGCAGAGGAGCGCTTCCCAGCGGCTGCCAGGCCG  2940

Query 2953  CGCTCACCGTCGCCCATCAGCACGCTGAGCCACCGCGCGGGCTCGGCCAGCCGCACGGACGACGATGTGCCGTC  3026
            |||||.||.|||||||||||.|||||||||||||..||.||||||||..|||||||.||||||||.|.||||||
Sbjct 2941  CGCTCGCCATCGCCCATCAGTACGCTGAGCCACCTGGCAGGCTCGGCGGGCCGCACAGACGACGACGCGCCGTC  3014

Query 3027  GCTGCACTCGGAGCCTGTGGCGCGCAGCAGCTCCTCGCAGGGCTCCCTCATGGAGCAGATCAGCAGTGTGGTCA  3100
            |||||||||||||.|.|..||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 3015  GCTGCACTCGGAGACCGCTGCACGCAGCAGCTCATCCCAGGGCTCGCTCATGGAGCAGATTAGCAGCGTGGTGA  3088

Query 3101  CCCGCTTCACGGCCAACATCAGCGAGCTCAACTCCATGATGCTGTCCACCGCGGCCCCCAGCCCCGGCGTC---  3171
            |.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||    |.||.||||.|.|   
Sbjct 3089  CGCGCTTCACCGCCAACATCACCGAGCTCAACTCCATGATGTTGTCCACCGCGG----CTGCGCCGGGGCCCCC  3158

Query 3172  -GGCGCCCCGCTCTGCTCGTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGTTGCCCACGACCATGACGACCTTTGCCG  3244
             ||..||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3159  TGGTACCCCTATCTGCTCTTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGCTGCCCACGACCATGACGACCTTCGCAG  3232

Query 3245  AAATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAAGTCACGGGCGGCGCGCAGCCCGCGGCAGGGGC-GCAGGCGGCTGGGGA  3317
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||.|||||.| .||            
Sbjct 3233  AGATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAGGTGACCGGAGGAGCTCAGCCGGCGACAGGGCCATCA------------  3294

Query 3318  CGCGGCCCGGGAGAGCCCCGCGGCCGGTCCCGAGGCTGCGGCCGCC------AAGCCAGACCTGGAGGAGCTGG  3385
             .|.||||..||||..|||||.|        || ||||..||||||      ||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 3295  -CCTGCCCAAGAGACGCCCGCAG--------GA-GCTGAAGCCGCCCCAGGAAAACCGGATCTGGAGGAGCTGG  3358

Query 3386  TGGCTCTCACCCCGCCGTCCCCCTTCAGAGACTCGGTGGACTCGGGGAGCACAACCCCCAACTCGCCAGTGTCC  3459
            ||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 3359  TGGCCCTCACTCCACCATCGCCCTTCAGGGACTCGGTGGACTCGGGGAGCACCACCCCAAACTCTCCAGTCTCC  3432

Query 3460  GAGTCGGCCCTCTGTATCCCGTCGTCTCCCAAATATGACACTCTTATCATAAGAGATTACACTCAGAGCTCCTC  3533
            ||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 3433  GAATCGGCCCTCTGCATCCCATCCTCTCCCAAATATGACACTCTCATCATCAGAGATTACACGCAGAGTTCTTC  3506

Query 3534  GTCGTTGG  3541
            .|||||| 
Sbjct 3507  ATCGTTG-  3513