Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489226
- Subject:
- NM_001143834.1
- Aligned Length:
- 3656
- Identities:
- 3155
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 ATGGTCCTTCTGTTGATCCTGTCAGTCTTACTTTTGAAAGAAGATGTCCGTGGGAGTGCACAGTCCAGTGAGAG 74
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCCTTCTGTTGATTCTGTCAGTCCTACTTCTGAAAGAAGATGTACGAGGAAGTGCACAGTCCAGTGAGAG 74
Query 75 GAGGGTGGTGGCTCACATGCCGGGTGACATCATTATTGGAGCTCTCTTTTCTGTTCATCACCAGCCTACTGTGG 148
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 75 GAGGGTGGTGGCTCACATGCCAGGTGACATTATTATTGGAGCTCTCTTCTCGGTCCACCACCAACCAACTGTGG 148
Query 149 ACAAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCGGTCCGTGAACAGTATGGCATTCAGAGAGTGGAGGCCATGCTGCAT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ACAAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCAGTCCGTGAGCAGTATGGCATTCAGAGAGTGGAAGCCATGCTGCAT 222
Query 223 ACCCTGGAAAGGATCAATTCAGACCCCACACTCTTGCCCAACATCACACTGGGCTGTGAGATAAGGGACTCCTG 296
|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 ACCTTGGAAAGGATCAATTCAGATCCCACACTCTTGCCCAACATCACACTAGGCTGTGAGATAAGAGATTCCTG 296
Query 297 CTGGCATTCGGCTGTGGCCCTAGAGCAGAGCATTGAGTTCATAAGAGATTCCCTCATTTCTTCAGAAGAGGAAG 370
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 CTGGCATTCTGCTGTGGCCCTAGAGCAAAGCATTGAGTTTATAAGGGATTCCCTCATCTCTTCGGAAGAGGAAG 370
Query 371 AAGGCTTGGTACGCTGTGTGGATGGCTCCTCCTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAGCCCATAGTAGGGGTCATTGGG 444
|||||||||||||||||||.||||| |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 AAGGCTTGGTACGCTGTGTAGATGG---CTCTTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAACCCATAGTGGGAGTCATTGGG 441
Query 445 CCTGGCTCCAGTTCTGTAGCCATTCAGGTCCAGAATTTGCTCCAGCTTTTCAACATACCTCAGATTGCTTACTC 518
||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 CCTGGCTCGAGTTCTGTGGCCATTCAAGTTCAGAACTTGCTCCAGCTTTTCAACATACCTCAGATTGCTTACTC 515
Query 519 AGCAACCAGCATGGATCTGAGTGACAAGACTCTGTTCAAATATTTCATGAGGGTTGTGCCTTCAGATGCTCAGC 592
.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 516 TGCAACTAGCATGGATTTGAGTGACAAGACTCTATTCAAGTACTTCATGAGGGTTGTACCTTCGGATGCCCAGC 589
Query 593 AGGCAAGGGCCATGGTGGACATAGTGAAGAGGTACAACTGGACCTATGTATCAGCCGTGCACACAGAAGGCAAC 666
|.||..|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 590 AAGCCCGAGCCATGGTAGACATAGTGAAGAGATACAACTGGACTTATGTCTCAGCTGTGCACACAGAAGGCAAC 663
Query 667 TATGGAGAAAGTGGGATGGAAGCCTTCAAAGATATGTCAGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAA 740
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 TATGGAGAAAGTGGGATGGAGGCTTTCAAAGATATGTCAGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAA 737
Query 741 AATCTACAGTAATGCAGGGGAGCAGAGCTTTGATAAGCTGCTGAAGAAGCTCACAAGTCACTTGCCCAAGGCCC 814
|||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||.||||||.||.||.||.||||
Sbjct 738 AATCTACAGCAATGCTGGGGAACAGAGCTTTGACAAGCTGTTGAAAAAGCTCAGAAGTCATTTACCTAAAGCCC 811
Query 815 GGGTGGTGGCCTGCTTCTGTGAGGGCATGACGGTGAGAGGTCTGCTGATGGCCATGAGGCGCCTGGGTCTAGCG 888
|||||||.||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.
Sbjct 812 GGGTGGTAGCCTGCTTCTGTGAAGGCATGACAGTTCGAGGTCTGCTCATGGCCATGAGACGCTTGGGTCTAGCA 885
Query 889 GGAGAATTTCTGCTTCTGGGCAGTGATGGCTGGGCTGACAGGTATGATGTGACAGATGGATATCAGCGAGAAGC 962
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 886 GGGGAATTTCTACTTCTGGGCAGTGATGGCTGGGCTGACAGGTATGACGTGACAGATGGGTATCAGCGAGAAGC 959
Query 963 TGTTGGTGGCATCACAATCAAGCTCCAATCTCCCGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTCCGGC 1036
|||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TGTCGGTGGGATTACAATCAAGCTCCAGTCTCCTGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTCCGGC 1033
Query 1037 CAGAAACAAACCACCGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCATCGTTTTCAGTGCCGACTGGAAGGGTTT 1110
||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1034 CAGAAACAAACCTCAGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCATCGTTTTCAGTGCCGGCTAGAAGGGTTT 1107
Query 1111 CCACAGGAGAACAGCAAATACAACAAGACTTGCAATAGTTCTCTGACTCTGAAAACACATCATGTTCAGGATTC 1184
.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1108 GCACAGGAGAACAGCAAGTACAACAAGACTTGCAACAGTTCTCTAACTCTGAGAACGCATCATGTTCAAGATTC 1181
Query 1185 CAAAATGGGATTTGTGATCAACGCCATCTATTCGATGGCCTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTCTGCC 1258
|||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1182 CAAAATGGGATTTGTGATCAATGCAATCTATTCTATGGCTTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTGTGTC 1255
Query 1259 CAGGCTATGCAGGACTCTGTGATGCCATGAAGCCAATTGATGGACGGAAACTTTTGGAGTCCCTGATGAAAACC 1332
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1256 CAGGCTATGCAGGCCTCTGTGATGCAATGAAGCCAATTGATGGGCGGAAACTTTTGGACTCCCTGATGAAAACC 1329
Query 1333 AATTTTACTGGGGTTTCTGGAGATACGATCCTATTCGATGAGAATGGAGACTCTCCAGGAAGGTATGAAATAAT 1406
||.||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 AACTTTACTGGAGTTTCCGGAGATATGATTCTATTTGATGAAAATGGAGACTCTCCAGGAAGGTATGAAATAAT 1403
Query 1407 GAATTTCAAGGAAATGGGAAAAGATTACTTTGATTATATCAACGTTGGAAGTTGGGACAATGGAGAATTAAAAA 1480
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 GAATTTCAAGGAAATGGGAAAAGATTATTTTGATTACATCAATGTTGGAAGTTGGGACAATGGGGAATTAAAAA 1477
Query 1481 TGGATGATGATGAAGTATGGTCCAAGAAAAGCAACATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCATGTGAGAAAGGC 1554
||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1478 TGGATGATGATGAAGTGTGGTCCAAGAAAAATAACATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCGTGTGAGAAAGGA 1551
Query 1555 CAGATCAAGGTGATCCGAAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGTACACCTTGTAAGGAGAATGAGTATGT 1628
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 CAGATAAAGGTGATCCGGAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGCACACCTTGTAAGGAGAATGAGTATGT 1625
Query 1629 CTTTGATGAGTACACATGCAAGGCATGCCAACTGGGGTCTTGGCCCACTGATGATCTCACAGGTTGTGACTTGA 1702
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 1626 TTTTGATGAGTACACCTGCAAGGCGTGCCAACTGGGGTCCTGGCCCACTGACGACTTGACAGGTTGTGATTTGA 1699
Query 1703 TCCCAGTACAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAACCCATTGCAGCTGTGGTGTTTGCCTGCCTTGGCCTCCTG 1776
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1700 TCCCAGTCCAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAGCCCATTGCAGCTGTGGTGTTTGCCTGCCTCGGTCTGCTA 1773
Query 1777 GCCACCCTGTTTGTTACTGTAGTCTTCATCATTTACCGTGATACACCAGTAGTCAAGTCCTCAAGCAGGGAACT 1850
||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1774 GCCACCCTCTTCGTTACTGTAATCTTCATCATTTATCGGGACACTCCAGTGGTCAAGTCTTCCAGCAGGGAACT 1847
Query 1851 CTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGCTACTTATGTACCTTCTGCCTCATTGCGAAGCCCAAACAGA 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848 CTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGTTACTTGTGTACCTTCTGCCTCATTGCAAAGCCCAAACAGA 1921
Query 1925 TTTACTGCTACCTTCAGAGAATTGGCATTGGTCTCTCCCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACAAAGACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1922 TTTACTGCTACCTTCAGAGAATTGGCATCGGTCTCTCTCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACGAAGACC 1995
Query 1999 AACCGTATTGCAAGGATCCTGGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACCAAAAAGCCCAGATTCATGAGTGCCTG 2072
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1996 AACCGTATTGCAAGGATTCTAGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACCAAAAAGCCCAGATTCATGAGCGCCTG 2069
Query 2073 TGCCCAGCTAGTGATTGCTTTCATTCTCATATGCATCCAGTTGGGCATCATCGTTGCCCTCTTTATAATGGAGC 2146
|||.|||.|||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2070 TGCTCAGTTAGTGATCGCTTTCATTCTCATCTGTATACAGTTGGGTATTATTGTGGCCCTCTTTATCATGGAGC 2143
Query 2147 CTCCTGACATAATGCATGACTACCCAAGCATTCGAGAAGTCTACCTGATCTGTAACACCACCAACCTAGGAGTT 2220
||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2144 CTCCGGATATAATGCATGACTATCCAAGCATCCGAGAAGTCTACTTGATTTGTAACACCACCAACCTAGGGGTT 2217
Query 2221 GTCACTCCACTTGGATACAATGGATTGTTGATTTTGAGCTGCACCTTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCC 2294
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GTCACTCCTCTTGGATACAATGGATTATTGATTTTGAGTTGCACATTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCC 2291
Query 2295 AGCTAACTTCAACGAGGCCAAGTATATCGCCTTCACAATGTACACGACCTGCATTATATGGCTAGCTTTTGTGC 2368
|||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2292 AGCCAACTTTAACGAGGCCAAATATATTGCTTTCACCATGTACACAACCTGCATCATATGGCTGGCCTTTGTGC 2365
Query 2369 CAATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAATCATCACCATGTGTTTCTCGGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTA 2442
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2366 CTATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAATCATCACCATGTGTTTCTCAGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTG 2439
Query 2443 GGCTGCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTGGCCAAACCAGAGAGAAACGTGCGCAGCGCCTTCACCAC 2516
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2440 GGTTGCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTAGCCAAACCGGAGAGAAATGTGCGCAGCGCCTTCACAAC 2513
Query 2517 ATCTACCGTGGTGCGCATGCATGTAGGGGATGGCAAGTCATCCTCCGCAGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCA 2590
.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTCTACAGTGGTGCGCATGCACGTAGGAGATGGCAAGTCATCATCCGCTGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCA 2587
Query 2591 ACCTGTGGAAGAGAAGGGGCTCCTCTGGGGAAACCTTA------------------------------------ 2628
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 2588 ACCTGTGGAAGAGGAGGGGCTCGTCTGGGGAAACCCTAAGGTACAAAGACAGGAGACTGGCCCAGCACAAGTCG 2661
Query 2629 ------------------------------------------------------------AGTTCCAATGGAAA 2642
||.|||||||||||
Sbjct 2662 GAAATAGAGTGTTTCACCCCCAAAGGGAGTATGGGGAATGGTGGGAGAGCAACAATGAGCAGCTCCAATGGAAA 2735
Query 2643 ATCCGTCACGTGGGCCCAGAATGAGAAGAGCAGCCGGGGGCAGCACCTGTGGCAGCGCCTGTCCATCCACATCA 2716
||||||.||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.||||
Sbjct 2736 ATCCGTGACTTGGGCCCAGAATGAGAAGAGCACCCGGGGGCAGCACCTGTGGCAGCGACTGTCTGTCCATATCA 2809
Query 2717 ACAAGAAAGAAAACCCCAACCAAACGGCCGTCATCAAGCCCTTCCCCAAGAGCACGGAGAGCCGTGGCCTGGGC 2790
|||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|.|
Sbjct 2810 ACAAGAAGGAGAACCCCAACCAGACAGCAGTCATCAAACCCTTCCCCAAGAGCACAGAGAGCCGCGGGCAG--- 2880
Query 2791 GCTGGCGCTGGCGCAGGCGGGAGCGCTGGGGGCGTGGGGGCCACGG-GC----GGTGCGGGCTGCGCAG---GC 2856
||.||.||.|||||.||..||.|| ||||.||| || |||||.||..|||||| ||
Sbjct 2881 ---GGTGCAGGGGCAGGTGGTGGCTCT-----------GGCCCCGGTGCAGCTGGTGCTGGTAGCGCAGGATGC 2940
Query 2857 GCCGGCCCAGGCGGGCCCGAGTCCCCAGACGCCGGCCCCAAGGCGCTGTATGATGTGGCCGAGGCTGAGGAGCA 2930
.|.|...|||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||.
Sbjct 2941 ACAGCGACAGGCGGCCCAGAGCCACCAGACGCCGGCCCCAAGGCGCTTTATGATGTCGCAGAGGCAGAGGAGCG 3014
Query 2931 CTTCCCGGCGCCCGCGCGGCCGCGCTCACCGTCGCCCATCAGCACGCTGAGCCACCGCGCGGGCTCGGCCAGCC 3004
||||||.|||.|.||..||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||..||.||||||||..|||
Sbjct 3015 CTTCCCAGCGGCTGCCAGGCCGCGCTCGCCATCGCCCATCAGTACGCTGAGCCACCTGGCAGGCTCGGCGGGCC 3088
Query 3005 GCACGGACGACGATGTGCCGTCGCTGCACTCGGAGCCTGTGGCGCGCAGCAGCTCCTCGCAGGGCTCCCTCATG 3078
||||.||||||||.|.|||||||||||||||||||.|.|..||.|||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 3089 GCACAGACGACGACGCGCCGTCGCTGCACTCGGAGACCGCTGCACGCAGCAGCTCATCCCAGGGCTCGCTCATG 3162
Query 3079 GAGCAGATCAGCAGTGTGGTCACCCGCTTCACGGCCAACATCAGCGAGCTCAACTCCATGATGCTGTCCACCGC 3152
||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 3163 GAGCAGATTAGCAGCGTGGTGACGCGCTTCACCGCCAACATCACCGAGCTCAACTCCATGATGTTGTCCACCGC 3236
Query 3153 GGCCCCCAGCCCCGGCGTC----GGCGCCCCGCTCTGCTCGTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGTTGCCC 3222
|| |.||.||||.|.| ||..||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3237 GG----CTGCGCCGGGGCCCCCTGGTACCCCTATCTGCTCTTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGCTGCCC 3306
Query 3223 ACGACCATGACGACCTTTGCCGAAATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAAGTCACGGGCGGCGCGCAGCCCGCGGC 3296
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||.|
Sbjct 3307 ACGACCATGACGACCTTCGCAGAGATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAGGTGACCGGAGGAGCTCAGCCGGCGAC 3380
Query 3297 AGGGGC-GCAGGCGGCTGGGGACGCGGCCCGGGAGAGCCCCGCGGCCGGTCCCGAGGCTGCGGCCGCC------ 3363
||||.| .|| .|.||||..||||..|||||.| || ||||..||||||
Sbjct 3381 AGGGCCATCA-------------CCTGCCCAAGAGACGCCCGCAG--------GA-GCTGAAGCCGCCCCAGGA 3432
Query 3364 AAGCCAGACCTGGAGGAGCTGGTGGCTCTCACCCCGCCGTCCCCCTTCAGAGACTCGGTGGACTCGGGGAGCAC 3437
||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 AAACCGGATCTGGAGGAGCTGGTGGCCCTCACTCCACCATCGCCCTTCAGGGACTCGGTGGACTCGGGGAGCAC 3506
Query 3438 AACCCCCAACTCGCCAGTGTCCGAGTCGGCCCTCTGTATCCCGTCGTCTCCCAAATATGACACTCTTATCATAA 3511
.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 3507 CACCCCAAACTCTCCAGTCTCCGAATCGGCCCTCTGCATCCCATCCTCTCCCAAATATGACACTCTCATCATCA 3580
Query 3512 GAGATTACACTCAGAGCTCCTCGTCGTTGG 3541
||||||||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 3581 GAGATTACACGCAGAGTTCTTCATCGTTG- 3609