Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489242
• Subject: NM_003618.4
• Aligned Length: 2682
• Identities: 2681
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATTATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110

Query 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT  1184

Query 1185  TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG  1258

Query 1259  ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA  1332

Query 1333  CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC  1406

Query 1407  AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG  1480

Query 1481  GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA  1554

Query 1555  AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA  1628

Query 1629  TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC  1702

Query 1703  CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT  1776

Query 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT  1850

Query 1851  ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT  1924

Query 1925  TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC  1998

Query 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC  2072

Query 2073  ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT  2146

Query 2147  TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT  2220

Query 2221  GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG  2294

Query 2295  GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT  2368

Query 2369  GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442

Query 2443  ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA  2516

Query 2517  AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT  2590

Query 2591  CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG  2664

Query 2665  GGTCATGAAAACAGTTAC  2682
            ||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGTCATGAAAACAGTTAC  2682