Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489242
• Subject: XM_006524198.2
• Aligned Length: 2682
• Identities: 2279
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  371  TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  741  TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110
            ||||.||||||||.||||||                                                      
Sbjct 1037  CAGAGCCACATCACGAACTT------------------------------------------------------  1056

Query 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT  1184
                     |||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1057  ---------GATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAGTCT  1121

Query 1185  TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG  1258
            |||.||||||||||||||.|||||.||||||||                                         
Sbjct 1122  TCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCG-----------------------------------------  1154

Query 1259  ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA  1332
                         .|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1155  -------------TTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATA  1215

Query 1333  CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC  1406
            ||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||
Sbjct 1216  CCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGC  1289

Query 1407  AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||
Sbjct 1290  AAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATG  1363

Query 1481  GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA  1554
            ||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 1364  GAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACA  1437

Query 1555  AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA  1628
            ||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1438  AACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCA  1511

Query 1629  TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC  1702
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 1512  TATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACC  1585

Query 1703  CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT  1776
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1586  CAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCAT  1659

Query 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT  1850
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1660  GAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGT  1733

Query 1851  ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT  1924
            .||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1734  CTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGC  1807

Query 1925  TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC  1998
            |.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 1808  TTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATT  1881

Query 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1882  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGC  1955

Query 2073  ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT  2146
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1956  GCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGT  2029

Query 2147  TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT  2220
            |||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||
Sbjct 2030  TTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTT  2103

Query 2221  GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG  2294
            ||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2104  GGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTG  2177

Query 2295  GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT  2368
            |||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2178  GTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGT  2251

Query 2369  GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252  GCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2325

Query 2443  ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA  2516
            |||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2326  ACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCA  2399

Query 2517  AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT  2590
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2400  AGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGAT  2473

Query 2591  CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG  2664
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 2474  CTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCG  2547

Query 2665  GGTCATGAAAACAGTTAC  2682
            |||||.||||||||.|||
Sbjct 2548  GGTCACGAAAACAGCTAC  2565