Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489248
- Subject:
- NM_001354678.2
- Aligned Length:
- 2076
- Identities:
- 2025
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTT 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGGAAAGGCAGCGCCTGCCCGAGAGCCCCACTGCAGGCCCCACCATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTT 74
Query 27 CAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGG 148
Query 101 AGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACG 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACG 222
Query 175 TTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGA 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGA 296
Query 249 GGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACC 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACC 370
Query 323 TGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGC 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGC 444
Query 397 AGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCACTACATCAA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCACTACATCAA 518
Query 471 GAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCC 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCC 592
Query 545 TCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAGATCATCGGC 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAGATCATCGGC 666
Query 619 AGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGACATGCCGCA 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGACATGCCGCA 740
Query 693 CCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGA 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGA 814
Query 767 AGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGC 888
Query 841 GGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC 962
Query 915 CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACA 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACA 1036
Query 989 ACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTC 1110
Query 1063 CTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGC 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGC 1184
Query 1137 CCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTG 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTG 1258
Query 1211 CCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAG 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAG 1332
Query 1285 TTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTA 1358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTA 1406
Query 1359 TGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACA 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACA 1480
Query 1433 ATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAG 1506
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGTGCTGCTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAG 1554
Query 1507 AGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATT 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATT 1628
Query 1581 CTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATG 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATG 1702
Query 1655 ATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAG 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAG 1776
Query 1729 GACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACGGGAAACATCAAAATCCACCC 1802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACCGGAAACATCAAAATCCACCC 1850
Query 1803 CTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGT 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCTTTCAGGCCCAAAGTGAAGT 1924
Query 1877 CACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAAC 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAAC 1998
Query 1951 CTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGA 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGA 2072
Query 2025 AGAT 2028
||||
Sbjct 2073 AGAT 2076