Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489248
• Subject: NM_001354680.2
• Aligned Length: 2028
• Identities: 2025
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCA  74

Query   75  GCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGA  148

Query  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATG  222

Query  223  CGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296

Query  297  TGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGG  370

Query  371  ACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATC  444

Query  445  AAACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTC  518

Query  519  TGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACA  592

Query  593  AGAAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAA  666

Query  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740

Query  741  CGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAAT  814

Query  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAG  888

Query  889  AGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGG  962

Query  963  AGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACA  1036

Query 1037  TCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGC  1110

Query 1111  AGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCAT  1184

Query 1185  GGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCA  1258

Query 1259  AGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGC  1332

Query 1333  TTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCAT  1406

Query 1407  CATTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGCTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGA  1480

Query 1481  TGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAG  1554

Query 1555  ATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCAT  1628

Query 1629  TGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATC  1702

Query 1703  CCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGA  1776

Query 1777  GTGACGGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGA  1850
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGACCGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGA  1850

Query 1851  GCCACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGG  1924
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCACCTTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGG  1924

Query 1925  CGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTG  1998

Query 1999  AACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGAT  2028
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGAT  2028