Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489251
• Subject: NM_013881.4
• Aligned Length: 3112
• Identities: 2332
• Gaps: 527

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGTGGGCGACTTCGAGTACTGCAAGCGGGACCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCTGTGGTCTTCCG  74

Query   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTGGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148

Query  149  AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAATTCTGCTTGGAAAGGAAATAAAAATCTTAAAGGAGCTTCAGCATGAAAACATCGTAGCGCTCTATGATGTT  222

Query  223  CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGC  296
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAATTGCCCAACTCTGTCTTTCTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTGGCAGATTATTTGCAAGC  296

Query  297  GAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACA  370
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGGAACTCTGAGTGAAGATACTATCAGAGTGTTTCTCCATCAGATTGCGGCAGCCATGCGAATCCTGCACA  370

Query  371  GCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGT  444
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.||.||.|.|
Sbjct  371  GCAAAGGGATAATCCACAGGGATCTCAAACCACAGAATATCCTGTTGTCTTATGCCAATCGAAGGAAGTCGAAT  444

Query  445  GTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAAC  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||
Sbjct  445  GTCAGTGGTATTCGTATTAAAATAGCTGATTTTGGTTTCGCACGGTACCTACATAGTAACACAATGGCAGCGAC  518

Query  519  ACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGT  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  ACTGTGTGGATCCCCAATGTACATGGCTCCCGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCAGATTTAT  592

Query  593  GGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCA----------------------  644
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  593  GGAGCATAGGAACAGTGATCTATCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCTAATAGTCCTCAGGACCTA  666

Query  645  --------------------------------------------------------------------------  644
                                                                                      
Sbjct  667  AGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTACTTGGCTAATCT  740

Query  645  ----------------------------------------------GAAGCGTTTTTTAGCCATCCTTTTCTTG  672
                                                          |||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAATCAAAAGGATAGAATGGACTTTGAAGCATTTTTCAGCCATCCTTTCCTTG  814

Query  673  AGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGT  746
            ||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..|||||.|||||||||||||.
Sbjct  815  AGCAAGTTCCAGTTAAAAAATCTTGCCCAGTCCCAGTGCCTGTGTATTCTGGCCCTGTCCCTGGAAGCTCCTGC  888

Query  747  GGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCA--------------------------------------  782
            .|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||                                      
Sbjct  889  AGCAGCTCACCATCTTGTCGCTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTT  962

Query  783  --------------------------------------------------------------------------  782
                                                                                      
Sbjct  963  ATCCTCCCCACCGTTGGGTCCTCCCAACTATCTACAGGTGTCCAAAGACTCTGCGAGTAATAGTAGCAAGAACT  1036

Query  783  ------------------------------------------------------------GTGATATGCCAATG  796
                                                                        .|||.|||||||||
Sbjct 1037  CTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTTCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATATGACATGCCAATG  1110

Query  797  GGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCA  870
            ||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGACTACGGCCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTTATGTGTGGAGGGCAGTGTCAACCTACTGTGTCACCTCA  1184

Query  871  CAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTA  944
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct 1185  CAGCGAAACAGCCCCAATTCCAGTTCCTACTCAAGTAAGGAATTATCAGCGCATAGAACAGAATCTTATATCCA  1258

Query  945  CTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATG  1018
            ||||||||||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  CTGCCAGCTCTGGCACAAACCCACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTAGTACGAAGGTCTAATACCAGCCCCATG  1332

Query 1019  GGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCAC  1092
            ||||||||||||...||.||.||||||||.|||||||.||||||||..|||||||..||||||||.|||||.||
Sbjct 1333  GGCTTCCTCCGGGTTGGGTCCTGCTCCCCTGTACCAGGAGACACAGTGCAGACAGGAGGACGAAGACTCTCTAC  1406

Query 1093  TGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTG  1166
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCTCTTCCAGGCCTTACTCACCATCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAACAGTTTAGTCAGTGCTGCTGTG  1480

Query 1167  GGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAG  1240
            |.|||||||||||||||||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|.||||||
Sbjct 1481  GACATCCTCAGGGCCATGAAGCCAGGAGTAGGCACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAGACCCAGGCACCACAG  1554

Query 1241  TCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAG  1314
            ||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCACTCTTACTGGGTGCTAGACTGCAGAGTGCACCCACCCTCACCGATATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAG  1628

Query 1315  AAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGC  1388
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629  AAAGCAGCACTCTGACCCTGTGTGTCCGTCCCATGCTGGAGCTGGGTATAGTTACTCACCTCAGCCTAGTCGGC  1702

Query 1389  CTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACT  1462
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGCAGCCTTGGGACCTCTCCCACCAAGCACACGGGGTCCTCTCCACGGAATTCTGACTGGTTCTTTAAAACT  1776

Query 1463  CCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTC  1536
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  CCTTTACCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACTACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACACAAGCATCTTC  1850

Query 1537  CAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAAT  1610
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1851  TAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAAGCCAGTCCAAAGATGGGAATGACCCTCGTGAGT  1924

Query 1611  GTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCG---AGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGC  1681
            ||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||..|.|   ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTTCCCACTGCCTCTCAGTACAAGGAAGCGAGAGGCATCGATCTGAGCAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGC  1998

Query 1682  AGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGA  1755
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||.|.|||.||.||.||||.|||||||||||.||
Sbjct 1999  AGATCTGTCAGTACTGGGAAGTTATCAGAACAACAAGTAAAGGCACCTTTAGGTGGACACCAGGGCAGCACGGA  2072

Query 1756  CAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAG  1829
            .||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|.||||||...||.||||
Sbjct 2073  TAGTTTAAACACAGAACGACCAATGGATGTAGCTCCTGCAGGAGCCTGTGGTGTTATGCTGGCATTGCCAGCAG  2146

Query 1830  GTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCAGCAGCCCCCACTTGT  1903
            |.|||||||||||..|||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 2147  GAACAGCAGCAAGCGCCAGAGCTGTCCTCTTCACCGTGGGGTCTCCTCCACACAGTGCCACAGCCCCCACTTGT  2220

Query 1904  ACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTC------------------------------------------  1935
            ||.||.|||.||||||||||||||||.|||||                                          
Sbjct 2221  ACTCATATGGTCCTTCGAACAAGAACCACCTCAGTGGGGTCCAGCAGCTCAGGAGGTTCCTTGTGTTCTGCAAG  2294

Query 1936  --------------------------------------------------------------------------  1935
                                                                                      
Sbjct 2295  TGGCCGAGTATGTGTGGGCTCCCCTCCTGGACCAGGGTTGGGCTCTTCCCCACCAGGAGCAGAGGGAGCTCCCA  2368

Query 1936  --------------------------------------------------------------------------  1935
                                                                                      
Sbjct 2369  GCCTAAGATACGTGCCTTATGGTGCTTCACCACCCAGCCTAGAGGGTCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTA  2442

Query 1936  -------------------AGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGA  1990
                               ||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|||||.|||||
Sbjct 2443  CCAGAGGAGACACTGATGGAGCGAGAGCACACAGACACCTTACGCCATCTGAACATGATGTTAATGTTTACTGA  2516

Query 1991  GTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGA  2064
            ||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTGTGTGCTGGACCTGACGGCAGTGAGGGGTGGGAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGA  2590

Query 2065  TCCAGGAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTG  2138
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTCAGGAGAGTGTAGTTGTGGACCAGATCAGCCAGCTAAGCAAAGATTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTG  2664

Query 2139  TACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAG  2212
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct 2665  TACATGAAGGCAGCACAGCTGCTGGCGGCTTCCCTGCATCTCGCCAAAGCTCAGGTCAAGTCTGGGAAGCTGAG  2738

Query 2213  CCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGA  2286
            ||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCCATCCATGGCTGTGAAACAAGTTGTTAAAAATCTGAATGAAAGATACAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGA  2812

Query 2287  AACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAGTCAACAGTGTGACTGCA  2360
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2813  AACTTACAGAAAAGCTGAATCGCTTCTTCTCCGATAAACAGAGATTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCA  2886

Query 2361  GAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGA  2434
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2887  GAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTGGAAATGGTTCAATCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACTGA  2960

Query 2435  AGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAG  2508
            |||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.|||||||||.|||
Sbjct 2961  AGACATCGTTTATCGCTACCACAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCTTAAGTAAGATCCTGCAGGACCCTACAG  3034

Query 2509  ATATTGAAAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACC  2582
            ||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||..||||||.|||||.
Sbjct 3035  ATGTTGAAAATGTGCATAAGTATAAATGTAGTATTGAAAGAAGATTGTCAGCACTCTGCTGTAGCACTGCAACT  3108

Query 2583  GTGG  2586
            ||| 
Sbjct 3109  GTG-  3111