Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489251
- Subject:
- XM_006533508.3
- Aligned Length:
- 3155
- Identities:
- 2326
- Gaps:
- 571
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG 74
||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGTGGTGGGCGACTTCGAGTACTGCAAGCGGGACCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCTGTGGTCTTCCG 74
Query 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTGGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
Query 149 AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT 222
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAATTCTGCTTGGAAAGGAAATAAAAATCTTAAAGGAGCTTCAGCATGAAAACATCGTAGCGCTCTATGATGTT 222
Query 223 CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGC 296
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAATTGCCCAACTCTGTCTTTCTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTGGCAGATTATTTGCAAGC 296
Query 297 GAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACA 370
.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAAGGAACTCTGAGTGAAGATACTATCAGAGTGTTTCTCCATCAGATTGCGGCAGCCATGCGAATCCTGCACA 370
Query 371 GCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGT 444
|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.||.||.|.|
Sbjct 371 GCAAAGGGATAATCCACAGGGATCTCAAACCACAGAATATCCTGTTGTCTTATGCCAATCGAAGGAAGTCGAAT 444
Query 445 GTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAAC 518
||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||
Sbjct 445 GTCAGTGGTATTCGTATTAAAATAGCTGATTTTGGTTTCGCACGGTACCTACATAGTAACACAATGGCAGCGAC 518
Query 519 ACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGT 592
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 519 ACTGTGTGGATCCCCAATGTACATGGCTCCCGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCAGATTTAT 592
Query 593 GGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCA---------------------- 644
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGAGCATAGGAACAGTGATCTATCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCTAATAGTCCTCAGGACCTA 666
Query 645 -------------------------------------------------------------------------- 644
Sbjct 667 AGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTACTTGGCTAATCT 740
Query 645 ----------------------------------------------GAAGCGTTTTTTAGCCATCCTTTTCTTG 672
|||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAATCAAAAGGATAGAATGGACTTTGAAGCATTTTTCAGCCATCCTTTCCTTG 814
Query 673 AGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGT 746
||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..|||||.|||||||||||||.
Sbjct 815 AGCAAGTTCCAGTTAAAAAATCTTGCCCAGTCCCAGTGCCTGTGTATTCTGGCCCTGTCCCTGGAAGCTCCTGC 888
Query 747 GGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCA-------------------------------------- 782
.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 889 AGCAGCTCACCATCTTGTCGCTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTT 962
Query 783 -------------------------------------------------------------------------- 782
Sbjct 963 ATCCTCCCCACCGTTGGGTCCTCCCAACTATCTACAGGTGTCCAAAGACTCTGCGAGTAATAGTAGCAAGAACT 1036
Query 783 ------------------------------------------------------------GTGATATGCCAATG 796
.|||.|||||||||
Sbjct 1037 CTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTTCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATATGACATGCCAATG 1110
Query 797 GGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCA 870
||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGACTACGGCCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTTATGTGTGGAGGGCAGTGTCAACCTACTGTGTCACCTCA 1184
Query 871 CAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTA 944
||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct 1185 CAGCGAAACAGCCCCAATTCCAGTTCCTACTCAAGTAAGGAATTATCAGCGCATAGAACAGAATCTTATATCCA 1258
Query 945 CTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATG 1018
||||||||||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259 CTGCCAGCTCTGGCACAAACCCACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTAGTACGAAGGTCTAATACCAGCCCCATG 1332
Query 1019 GGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCAC 1092
||||||||||||...||.||.||||||||.|||||||.||||||||..|||||||..||||||||.|||||.||
Sbjct 1333 GGCTTCCTCCGGGTTGGGTCCTGCTCCCCTGTACCAGGAGACACAGTGCAGACAGGAGGACGAAGACTCTCTAC 1406
Query 1093 TGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTG 1166
|||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGCTCTTCCAGGCCTTACTCACCATCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAACAGTTTAGTCAGTGCTGCTGTG 1480
Query 1167 GGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAG 1240
|.|||||||||||||||||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|.||||||
Sbjct 1481 GACATCCTCAGGGCCATGAAGCCAGGAGTAGGCACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAGACCCAGGCACCACAG 1554
Query 1241 TCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAG 1314
||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCACTCTTACTGGGTGCTAGACTGCAGAGTGCACCCACCCTCACCGATATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAG 1628
Query 1315 AAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGC 1388
|||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629 AAAGCAGCACTCTGACCCTGTGTGTCCGTCCCATGCTGGAGCTGGGTATAGTTACTCACCTCAGCCTAGTCGGC 1702
Query 1389 CTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACT 1462
|||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGCAGCCTTGGGACCTCTCCCACCAAGCACACGGGGTCCTCTCCACGGAATTCTGACTGGTTCTTTAAAACT 1776
Query 1463 CCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTC 1536
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 CCTTTACCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACTACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACACAAGCATCTTC 1850
Query 1537 CAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAAT 1610
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1851 TAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAAGCCAGTCCAAAGATGGGAATGACCCTCGTGAGT 1924
Query 1611 GTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCG---AGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGC 1681
||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||..|.| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTTCCCACTGCCTCTCAGTACAAGGAAGCGAGAGGCATCGATCTGAGCAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGC 1998
Query 1682 AGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGA 1755
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||.|.|||.||.||.||||.|||||||||||.||
Sbjct 1999 AGATCTGTCAGTACTGGGAAGTTATCAGAACAACAAGTAAAGGCACCTTTAGGTGGACACCAGGGCAGCACGGA 2072
Query 1756 CAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAG 1829
.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|.||||||...||.||||
Sbjct 2073 TAGTTTAAACACAGAACGACCAATGGATGTAGCTCCTGCAGGAGCCTGTGGTGTTATGCTGGCATTGCCAGCAG 2146
Query 1830 GTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCAGCAGCCCCCACTTGT 1903
|.|||||||||||..|||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 2147 GAACAGCAGCAAGCGCCAGAGCTGTCCTCTTCACCGTGGGGTCTCCTCCACACAGTGCCACAGCCCCCACTTGT 2220
Query 1904 ACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTC------------------------------------------ 1935
||.||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2221 ACTCATATGGTCCTTCGAACAAGAACCACCTCAGTGGGGTCCAGCAGCTCAGGAGGTTCCTTGTGTTCTGCAAG 2294
Query 1936 -------------------------------------------------------------------------- 1935
Sbjct 2295 TGGCCGAGTATGTGTGGGCTCCCCTCCTGGACCAGGGTTGGGCTCTTCCCCACCAGGAGCAGAGGGAGCTCCCA 2368
Query 1936 -------------------------------------------------------------------------- 1935
Sbjct 2369 GCCTAAGATACGTGCCTTATGGTGCTTCACCACCCAGCCTAGAGGGTCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTA 2442
Query 1936 -------------------AGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGA 1990
||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|||||.|||||
Sbjct 2443 CCAGAGGAGACACTGATGGAGCGAGAGCACACAGACACCTTACGCCATCTGAACATGATGTTAATGTTTACTGA 2516
Query 1991 GTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGA 2064
||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GTGTGTGCTGGACCTGACGGCAGTGAGGGGTGGGAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGA 2590
Query 2065 TCCAGGAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTG 2138
|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTCAGGAGAGTGTAGTTGTGGACCAGATCAGCCAGCTAAGCAAAGATTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTG 2664
Query 2139 TACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAG 2212
||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct 2665 TACATGAAGGCAGCACAGCTGCTGGCGGCTTCCCTGCATCTCGCCAAAGCTCAGGTCAAGTCTGGGAAGCTGAG 2738
Query 2213 CCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGA 2286
||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCCATCCATGGCTGTGAAACAAGTTGTTAAAAATCTGAATGAAAGATACAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGA 2812
Query 2287 AACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAGTCAACAGTGTGACTGCA 2360
||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2813 AACTTACAGAAAAGCTGAATCGCTTCTTCTCCGATAAACAGAGATTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCA 2886
Query 2361 GAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGA 2434
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2887 GAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTGGAAATGGTTCAATCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACTGA 2960
Query 2435 AGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAG 2508
|||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.|||||||||.|||
Sbjct 2961 AGACATCGTTTATCGCTACCACAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCTTAAGTAAGATCCTGCAGGACCCTACAG 3034
Query 2509 ATATTGAAAATGTGCATAAAT----------------ATAAATGTAGTATTG------AGAG--AAG------- 2551
||.||||||||||||||||.| |||..||.|.|.||| |||| |||
Sbjct 3035 ATGTTGAAAATGTGCATAAGTCATTAAGCTCCTGGTCATATCTGAACTGTTGCTGGAAAGAGGAAAGAAAGTGT 3108
Query 2552 ----ACTGTCGGCGC-TCT----GCC---ATAGCACCGCAACCGTGG 2586
|.||| |..| ||| ||| ||||..|.|.||||.|||
Sbjct 3109 ATTCATTGT--GTTCATCTTGGGGCCAAGATAGAGCAGGAACCATGG 3153