Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489251
• Subject: XM_017025426.2
• Aligned Length: 3172
• Identities: 2500
• Gaps: 668

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG  74

Query   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148

Query  149  AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT  222

Query  223  CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCA---  293
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  223  CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGG  296

Query  294  ------------------------------------------------------------AGCGAAAGGGACTC  307
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  297  TAACTGTGTATGTGTGTCAGTGTTCAGTAAAGACAGTGCTGCAGCCTGTTTAATCCTAAGAGCGAAAGGGACTC  370

Query  308  TCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATC  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATC  444

Query  382  ATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT  518

Query  456  TCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGAT  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGAT  592

Query  530  CCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGA  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGA  666

Query  604  ACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCA---------------------------------  644
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  667  ACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTAAGGATGTTTTA  740

Query  645  --------------------------------------------------------------------------  644
                                                                                      
Sbjct  741  TGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCTCCTTTTGGGTT  814

Query  645  -----------------------------------GAAGCGTTTTTTAGCCATCCTTTTCTTGAGCAAGGTCCA  683
                                               |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAGAATGGACTTTGAAGCATTTTTTAGCCATCCTTTTCTTGAGCAAGGTCCA  888

Query  684  GTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCC  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCC  962

Query  758  ATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCA-------------------------------------------------  782
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  963  ATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCCAC  1036

Query  783  --------------------------------------------------------------------------  782
                                                                                      
Sbjct 1037  CATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTTGTGAC  1110

Query  783  -------------------------------------------------GTGATATGCCAATGGGGACTGCTGG  807
                                                             |||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAGTGGGGACTGCTGG  1184

Query  808  CAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAACAG  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAACAG  1258

Query  882  CACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCA  1332

Query  956  GGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCG  1406

Query 1030  GCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTCTA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTCTA  1480

Query 1104  GGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAG  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAG  1554

Query 1178  GGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTATC  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTATC  1628

Query 1252  GGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACT  1702

Query 1326  CTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCCTT  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCCTT  1776

Query 1400  GGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAAC  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAAC  1850

Query 1474  AATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTTAG  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTTAG  1924

Query 1548  CCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGC  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGC  1998

Query 1622  CTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGTAC  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGTAC  2072

Query 1696  CGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATACAG  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATACAG  2146

Query 1770  AACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAAGT  1843
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct 2147  AACGACCAATGGATA-----------------------------------------------------------  2161

Query 1844  TCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCAGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTCCT  1917
                                  ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162  ----------------------TAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTCCT  2213

Query 1918  TCGAACAAGAACAACCTC--------------------------------------------------------  1935
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct 2214  TCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTTTGTGCCATGAGTGGCCGCGTGTGCG  2287

Query 1936  --------------------------------------------------------------------------  1935
                                                                                      
Sbjct 2288  TGGGGTCCCCGCCTGGCCCAGGCTTCGGCTCTTCCCCTCCAGGAGCAGAGGCAGCTCCCAGCCTGAGATACGTG  2361

Query 1936  --------------------------------------------------------------------------  1935
                                                                                      
Sbjct 2362  CCTTACGGTGCTTCACCCCCCAGCCTAGAGGGGCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCT  2435

Query 1936  -----AGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACC  2004
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436  GATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACC  2509

Query 2005  TGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTG  2078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510  TGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTG  2583

Query 2079  GTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGC  2152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584  GTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGC  2657

Query 2153  ACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCACAGCTG  2226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658  ACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCACAGCTG  2731

Query 2227  TGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAG  2300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732  TGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAG  2805

Query 2301  CTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAGTCAACAGTGTGACTGCAGAGAAACTCATCTA  2374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806  CTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAGAGAAACTCATCTA  2879

Query 2375  TAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATC  2448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880  TAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATC  2953

Query 2449  GCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGAAAATGTG  2522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954  GCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGAAAATGTG  3027

Query 2523  CATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTGG  2586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 3028  CATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG-  3090