Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489252
- Subject:
- NM_001330750.1
- Aligned Length:
- 2295
- Identities:
- 1677
- Gaps:
- 618
Alignment
Query 1 ATGGCAGGATTTAAGAGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------ATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 48
Query 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 122
Query 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTCTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTCTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG 196
Query 815 TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC 270
Query 889 AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG 344
Query 963 GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC 418
Query 1037 AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC 492
Query 1111 CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC 566
Query 1185 TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG 640
Query 1259 CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG 714
Query 1333 GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG 788
Query 1407 GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG 862
Query 1481 AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT 936
Query 1555 CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC 1010
Query 1629 CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG 1084
Query 1703 ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG 1158
Query 1777 GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCAC 1232
Query 1851 CAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCATGCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 CAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCATGCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGG 1306
Query 1925 AGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGCTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 AGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGCTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATT 1380
Query 1999 GATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTC 1454
Query 2073 CACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTTCTCTGACCACATGGCAGATACCACCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 CACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTTCTCTGACCACATGGCAGATACCACCA 1528
Query 2147 CTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 CTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATC 1602
Query 2221 TCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCAT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 TCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCAT 1676
Query 2295 C 2295
|
Sbjct 1677 C 1677