Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489266
• Subject: XM_011239469.2
• Aligned Length: 1798
• Identities: 1333
• Gaps: 356

Alignment

Query    1  ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC  296
                                                         |||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC  29

Query  297  AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG  370
            .|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   30  CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG  103

Query  371  GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  177

Query  445  GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA  517
            ||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  178  GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA  250

Query  518  GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA  591
            .||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  251  AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA  324

Query  592  AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT  665
            ||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  325  AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT  398

Query  666  GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAA-------------  726
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  399  GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGTATCCTGTTTG  472

Query  727  --------------------------------------------------------------------------  726
                                                                                      
Sbjct  473  CCTCTTTTACTGCAGCCATTCACTGGGCTGGTGGCTTCAAGGATTTTTCTACAATAACCCCTAAGCCCCTTTCC  546

Query  727  TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAA  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  547  TGGAATGAGGTGACCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAA  620

Query  801  AATTATTCTTACATATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAG  874
            .||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  621  GATTATTCTCACATATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAG  694

Query  875  CCTTCTACAAGCTGGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGG  948
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  695  CCTTCTACAAGCTGGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGG  768

Query  949  TTCCGATACAGTGGCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAAT  1022
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  769  TTCCGATACAGTGGCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAAT  842

Query 1023  ACACAGAGCAGGGATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCA  1096
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  843  ACACAGAGCAGGGATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCA  916

Query 1097  GGACCCGCAGAAGAGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACA  1170
            ||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  917  GGACACGAAGAAGAGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACC  990

Query 1171  CCAGTGCGTTCCACTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCG  1244
            ||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct  991  CCAGTGCGGTCCTCTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACG  1064

Query 1245  AGTAGCTGTGATTGCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCC  1318
            .||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1065  TGTCGCTGTGATAGCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCC  1138

Query 1319  TGGAGCTGATGTTGCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCC  1392
            |||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1139  TGGAGCTGATGCTGCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCC  1212

Query 1393  AGCACCCCAACTGCTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCC  1466
            ||||||||.|||||.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1213  AGCACCCCGACTGCGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTC  1286

Query 1467  CGAGGAGGAACAGGTGAATAAGTTTGTTCTAAGTGTCCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCATGGGACTCCTCTTTG  1540
            .|||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  AGAGCAAGAACAGGTGAATAAGTTTGTTTTAAGTGTTCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCATGGGACTCCTCTTTG  1360

Query 1541  TTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTGACATTGCCTTTTTCCGTGATATCCGCCAGACC  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1361  TTTTGCTCCTCCTCCTGATCATCCTTACTGAGTCTGACCTTGACGTTGCTTTTTTCCGAGATATCCGCCAGACC  1434

Query 1615  CCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGT  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  CCCGAGTTTGAACAATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGT  1508

Query 1689  GGTGAGCCTGCTCATTGACACC  1710
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  GGTGAGCCTGCTCATTGACACC  1530