Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489295
• Subject: NM_001243506.2
• Aligned Length: 1327
• Identities: 819
• Gaps: 508

Alignment

Query    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  32

Query  519  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  106

Query  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||
Sbjct  107  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAACAAGATTGTC  159

Query  667  TCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  TCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA  233

Query  741  AGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  AGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAG  307

Query  815  GCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  GCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGT  381

Query  889  GTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  GTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTC  455

Query  963  CAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  CAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGG  529

Query 1037  AAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  AAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAA  603

Query 1111  GCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  GCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC  677

Query 1185  TCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  TCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCT  751

Query 1259  ACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTCG  1327
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  752  ACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC-  819