Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489295
• Subject: XM_006497164.3
• Aligned Length: 1327
• Identities: 1216
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTC  74

Query   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGTCTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGA  148

Query  149  ATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTC  222
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  ATGGCCATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTACCCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTC  222

Query  223  AGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTC  296
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGAGGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTC  296

Query  297  GATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAG  370
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CATGCCCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCGCCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAG  370

Query  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAACATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAG  444

Query  445  ATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCACAAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCGCTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGA  518

Query  519  AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT  592
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGTCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCAT  592

Query  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTC  666
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||                     ||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGAACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAACAAGATTGTC  645

Query  667  TCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA  740
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  TCGCATTTGTTGGTGGCTGAACCAGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA  719

Query  741  AGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAG  814
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  720  AGCCCTCACCACACTCTGTGACTTGGCTGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCAAAACATATTCCAG  793

Query  815  GCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGT  888
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.
Sbjct  794  GCTTCTCCACACTGTCCCTGGCAGACCAGATGAGCCTCCTCCAGAGTGCATGGATGGAGATTCTGATCCTCGGC  867

Query  889  GTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTC  962
            ||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  868  GTTGTGTACCGATCGCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGATGAAGACCAGTC  941

Query  963  CAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGG  1036
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  942  TAAATTAGCAGGCCTTCTTGACCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTGAAGAAGTACAAGAGCATGAAGCTAG  1015

Query 1037  AAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAA  1110
            |.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1016  AGAAGGAAGAATTCGTCACCCTCAAAGCAATAGCTCTTGCTAATTCAGATTCCATGCATATAGAAGATGTGGAA  1089

Query 1111  GCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC  1184
            ||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  GCTGTGCAGAAACTTCAGGATGTGTTACATGAGGCCCTGCAGGATTACGAGGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC  1163

Query 1185  TCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCT  1258
            |||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1164  TCGCCGTGCAGGCAAGATGCTGATGACGCTGCCGCTGCTGAGGCAGACCTCCACCAAGGCAGTCCAGCACTTCT  1237

Query 1259  ACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTCG  1327
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||| 
Sbjct 1238  ACAACATCAAACTCGAAGGCAAAGTGCCCATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGCTGGAGGCCAAGGTC-  1305