Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489299
• Subject: NM_153126.2
• Aligned Length: 3076
• Identities: 2731
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGCATCGGAAAAAGGTGGATAACCGAATCCGGATTCTCATTGAGAATGGAGTAGCTGAGCGGCAAAGATCTCT  74
            |||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGAATCGGAAGAAGGTGGATAACCGAATTCGAATTCTCATTGAGAATGGCGTAGCTGAGCGGCAGAGGTCTCT  74

Query   75  CTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTAATACTTCATCACATGTTATCCAAAGCAACTGTGA  148
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTTATTCTTCATCATATGTTGTCCAAGGCAACTGTGA  148

Query  149  AGGCTCGGCCTTCAGTGCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGGTTTAGCAGTCACCGGAAGAAAAGAATGCGA  222
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  AGGCTCGGCCCTCAGTCCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGATTTAGCAGTCACCGGAAGAAGAGGATGCGG  222

Query  223  CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC  296
            |||||.||||||||||||||||.|||.||..|||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||..|||||||
Sbjct  223  CAGCTACAGAAGAAAATAAAGAGTGGGACCTTGAACTTAAAGCAAGATGACCCCTTTGAGCTTTTTGTAGCAGC  296

Query  297  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAATGAAACCCACAAGATTCTGGGCAATACTTTCGGCATGTGTGTCCTCC  370

Query  371  AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC  444
            |||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  AGGATTTTGAAGCGTTAACTCCGAACTTGTTGGCCAGAACTGTAGAAACAGTAGAAGGTGGTGGACTGGTGGTC  444

Query  445  ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC  518
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||||..|||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  ATCCTCCTGCGGACCATGAACTCGCTTAAGCAGCTGTACACGATGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGGAC  518

Query  519  TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  592
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGGCCCATCAGGACGTGGTGGGAAGATTTAACGAGAGGTTTATTCTCTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  592

Query  593  TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG  666
            |.||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.|||.|.|||||.|||
Sbjct  593  TGGTCATTGACGATCAGCTCGACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTGGCCAGCATTGAAGCCTTACCTCCTCAG  666

Query  667  ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC  740
            .|.||||||||||.|||..|||||.|||.||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCCCGGATGAGAATCTCAGTCCTGCTGCTCTGGAGCTGCTGGAGTTGAAAGAGAGCTTGCAGGACACTCAGCC  740

Query  741  TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT  814
            .||||||||..|||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  741  CGTGGGTGTTCTGGTGGACTGCTGCAAGACCCTGGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTCATTGAGGGGATCT  814

Query  815  CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG  888
            |.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.||||||||..||
Sbjct  815  CGGAGAAGACTCTAAGGAGTACTGTAGCCCTCACCGCTGCCCGAGGAAGGGGCAAGTCTGCGGCCCTGGGCCTG  888

Query  889  GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC  962
            ||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  889  GCTATCGCTGGAGCAGTGGCATTCGGGTATTCCAATATTTTTGTTACCTCCCCAAGCCCGGATAACCTCCACAC  962

Query  963  TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT  1036
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  963  GCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAGTATCAGGAGCATCTGGATTATGAGATTGTACAGT  1036

Query 1037  CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT  1110
            |.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CGCTGAACCCCGAGTTTAATAAAGCGGTGATCAGGGTCAATGTGTTCCGAGAGCACAGACAGACTATTCAGTAC  1110

Query 1111  ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT  1184
            ||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  ATCCACCCTGCAGATGCTGTGAAACTGGGCCAGGCTGAGCTGGTTGTGATAGATGAAGCTGCCGCTATTCCCCT  1184

Query 1185  CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG  1258
            ||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  CCCCCTGGTGAAGAGCCTGCTTGGGCCCTACCTGGTTTTCATGGCATCTACTATCAATGGCTACGAGGGCACTG  1258

Query 1259  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTCATTCAACAACTCCGTCAGCAGAGTGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1332

Query 1333  GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGCATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT  1406
            |||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GAGAACAAGACCACAACGACAGCCAGACTGGCCTCAGCTCGAACCTTGCATGAGGTTTCCCTCCAAGAGTCAAT  1406

Query 1407  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTTAATGACCTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACCC  1480

Query 1481  GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1554
            |.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCATCGTTTCCGGCTGCCCCTTGCCTGAGGCCTGTGAGCTCTACTATGTTAACAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1554

Query 1555  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAGCGGCTCATGGCTCTCTATGTGGCTTCTCATTACAAGAACTCTCCCAA  1628

Query 1629  TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCTGTGCCCCCCACCCAGA  1702
            .||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGACCTGCAGATGCTCTCAGACGCTCCTGCTCACCACCTCTTCTGCCTCCTGCCACCTGTGCCCCCCACCCAGA  1702

Query 1703  ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC  1776
            |||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1703  ATGCCCTGCCTGAAGTGCTTGCAGTTGTCCAGGTGTGCCTTGAGGGAGAGATTTCTCGTCAGTCCATTTTGAAT  1776

Query 1777  AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA  1850
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  AGCCTCTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCTGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCGGAACAGTTTCAAGATCCAGA  1850

Query 1851  CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA  1924
            ||||||.||.||.|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851  CTTTGGAGGCCTTTCTGGTGGACGGGTTGTTCGAATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGATATGGCA  1924

Query 1925  GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA  1998
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 1925  GCCGAGCGCTGCAGCTGCTGCAGATGTATTATGAAGGCAAGTTCCCTTGTCTGGAGGAAAAAGTCTTGGAGACA  1998

Query 1999  CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT  2072
            |||||.|||||.|.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1999  CCACAAGAAATCCGCACCGTGAGCAGTGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAAGTTATTACTCCCCGGAAGGATCT  2072

Query 2073  GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA  2146
            |||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||
Sbjct 2073  GCCCCCCTTGCTCCTCAAGTTGAATGAGAGGCCTGCAGAGCGCCTGGATTACCTGGGGGTTTCCTATGGGCTGA  2146

Query 2147  CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG  2220
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2147  CCCCCAGGCTTCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTCTATTTGAGACAGACCCCAAACGACCTG  2220

Query 2221  ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC  2294
            ||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||..|||||.||
Sbjct 2221  ACTGGGGAACACTCGTGCATTATGCTGAAGACGCTGGCCGATGAGGATGAGGCTGAGCAGGGAGCTTGGCTGGC  2294

Query 2295  AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC  2368
            |||.||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 2295  AGCATTTTGGAAAGATTTCCGAAGACGGTTCCTGGCCTTGCTGTCATACCAGTTCAGCACCTTCTCTCCTGCCC  2368

Query 2369  TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA  2442
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|.|..|||.||||||.|||.|||||..||||||||.|.|||||.
Sbjct 2369  TGTCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACGTAGCCAAGTCAGCCCTGCCAGCCCTAGGCCGGGAGCATCTGGAG  2442

Query 2443  GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT  2516
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2443  GCACTTTTCCTTCCCTATGACCTGAAGCGTCTAGAGATGTACTCTCGGAACATGGTCGATTACCACCTCATCAT  2516

Query 2517  GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT  2590
            |||..|.|||||.|||||.||.|||.|.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||.||||
Sbjct 2517  GGATCTTATCCCAGCCATTTCCCGCTTGTACTTCCTGAACCAGCTAGGAGACCTGTCCCTGTCGGCTGCCCAGT  2590

Query 2591  CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG  2664
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2591  CGGCTCTTCTCTTGGGAATTGGCCTACAGCACAAGTCTGTGGATCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCA  2664

Query 2665  GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC  2738
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 2665  GGCCAGTTGATGGGGCTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTGTTCAATGATGTGCAGGAAAAGGC  2738

Query 2739  CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG  2812
            .||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 2739  TATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGTGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACTATGAAGACCCTGAGTGATGACCTGG  2812

Query 2813  ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA  2886
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||..|||||||||||||.||
Sbjct 2813  ATGAAGCAGCAAAGGAATTCCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTCGGGAAGCTGAAGGACATGGACCTCTCTCAA  2886

Query 2887  TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG  2960
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||.|||||.||..|.||
Sbjct 2887  TATGTAATTCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAGCAAAGCAGGGCAGAATGCCTCCATTGTTAG  2960

Query 2961  CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG  3034
            ..||||||||||||||||||||||..|.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2961  TTTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAACTGGAAACAAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAAGAGAG  3034

Query 3035  AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAAG  3076
            |   .||.||||.|||.|||||||||||||||||.|||||. 
Sbjct 3035  A---TAACAACAGAAAGGATATGAAACTGAAGCGAAAGAAG-  3072