Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489305
• Subject: XM_017005665.1
• Aligned Length: 973
• Identities: 774
• Gaps: 176

Alignment

Query   1  ATGGAAACAGGACCTGAAGACCCTTCCAGCATGC----------CAGAGGAAAGTTCCCCCAGGCGGACCCCGC  64
                                         ||||          ||||.|.|..||||||..|..|||..|   
Sbjct   1  ------------------------------ATGCAGACTAGATTCAGAAGGATCTTCCCCTGGAAGGATGC---  41

Query  65  AGAGCATTCCCTACCAGGACCTCCCTCACCTGGTCAATGCAGACGGACAG------TAC------CTCTTCTGC  126
            ||||       ||||.||               .|||||       |||      |||      |||.|||  
Sbjct  42  -GAGC-------ACCAAGA---------------GAATGC-------CAGAATTTATACATTTTTCTCCTCT--  83

Query 127  AGGTACTGGAAACC---CACAGGCACACCCAAGGCCCTCATCTTTGTGTCCCATGG----AGCCGGAGAGCACA  193
                   ||||||   ||.|||       .|||                ..||||    ||.|||.||||   
Sbjct  84  --------GAAACCATACAAAGG-------GAGG----------------GAATGGGAGAAGGCGGGGAGC---  123

Query 194  GTGGCCGCTATGAAGAGCTGGCTCGGATGCTGATGGGGCTGGACCTGCTGGTGTTCGCCCAC-----GACCATG  262
                         ||||                        ||.||||||   ...|||||     | ||| |
Sbjct 124  --------------GAGC------------------------ACGTGCTGG---AAACCCACCTTTTG-CCA-G  154

Query 263  TTGGCCACGGACAGAGCGAAGGGGAGAGGATGGTAGTGTCTGACTTCCACGTTTTCGTCAGGGATGTGTTGCAG  336
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155  TTGGCCACGGACAGAGCGAAGGGGAGAGGATGGTAGTGTCTGACTTCCACGTTTTCGTCAGGGATGTGTTGCAG  228

Query 337  CATGTGGATTCCATGCAGAAAGACTACCCTGGGCTTCCTGTCTTCCTTCTGGGCCACTCCATGGGAGGCGCCAT  410
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229  CATGTGGATTCCATGCAGAAAGACTACCCTGGGCTTCCTGTCTTCCTTCTGGGCCACTCCATGGGAGGCGCCAT  302

Query 411  CGCCATCCTCACGGCCGCAGAGAGGCCGGGCCACTTCGCCGGCATGGTACTCATTTCGCCTCTGGTTCTTGCCA  484
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303  CGCCATCCTCACGGCCGCAGAGAGGCCGGGCCACTTCGCCGGCATGGTACTCATTTCGCCTCTGGTTCTTGCCA  376

Query 485  ATCCTGAATCTGCAACAACTTTCAAGGTCCTTGCTGCGAAAGTGCTCAACCTTGTGCTGCCAAACTTGTCCCTC  558
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377  ATCCTGAATCTGCAACAACTTTCAAGGTCCTTGCTGCGAAAGTGCTCAACCTTGTGCTGCCAAACTTGTCCCTC  450

Query 559  GGGCCCATCGACTCCAGCGTGCTCTCTCGGAATAAGACAGAGGTCGACATTTATAACTCAGACCCCCTGATCTG  632
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451  GGGCCCATCGACTCCAGCGTGCTCTCTCGGAATAAGACAGAGGTCGACATTTATAACTCAGACCCCCTGATCTG  524

Query 633  CCGGGCAGGGCTGAAGGTGTGCTTCGGCATCCAACTGCTGAATGCCGTCTCACGGGTGGAGCGCGCCCTCCCCA  706
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525  CCGGGCAGGGCTGAAGGTGTGCTTCGGCATCCAACTGCTGAATGCCGTCTCACGGGTGGAGCGCGCCCTCCCCA  598

Query 707  AGCTGACTGTGCCCTTCCTGCTGCTCCAGGGCTCTGCCGATCGCCTATGTGACAGCAAAGGGGCCTACCTGCTC  780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599  AGCTGACTGTGCCCTTCCTGCTGCTCCAGGGCTCTGCCGATCGCCTATGTGACAGCAAAGGGGCCTACCTGCTC  672

Query 781  ATGGAGTTAGCCAAGAGCCAGGACAAGACTCTCAAGATTTATGAAGGTGCCTACCATGTTCTCCACAAGGAGCT  854
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673  ATGGAGTTAGCCAAGAGCCAGGACAAGACTCTCAAGATTTATGAAGGTGCCTACCATGTTCTCCACAAGGAGCT  746

Query 855  TCCTGAAGTCACCAACTCCGTCTTCCATGAAATAAACATGTGGGTCTCTCAAAGGACAGCCACGGCAGGAACTG  928
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747  TCCTGAAGTCACCAACTCCGTCTTCCATGAAATAAACATGTGGGTCTCTCAAAGGACAGCCACGGCAGGAACTG  820

Query 929  CGTCCCCACCC  939
           |||||||||||
Sbjct 821  CGTCCCCACCC  831