Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489315
• Subject: XM_024454053.1
• Aligned Length: 1390
• Identities: 1112
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGAAGACGGGACATTTTGAAATAGTCACCATGCTGCTGGCAACCATGATTCTAGTGGACATTTTCCAGGTGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGACGGGACATTTTGAAATAGTCACCATGCTGCTGGCAACCATGATTCTAGTGGACATTTTCCAGGTGAA  74

Query   75  GGCTGAAGTGTTAGACATGGCAGATAATGCATTTGATGATGAATACCTGAAATGTACGGACAGGATGGAAATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGAAGTGTTAGACATGGCAGATAATGCATTTGATGATGAATACCTGAAATGTACGGACAGGATGGAAATTA  148

Query  149  AATACGTTCCCCAACTGCTAAAGGAGGAAAAAGCAAGCCACCAGCAATTAGATACTGTGTGGGAAAATGCAAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATACGTTCCCCAACTGCTAAAGGAGGAAAAAGCAAGCCACCAGCAATTAGATACTGTGTGGGAAAATGCAAAA  222

Query  223  GCCAAATGGGCAGCCCGAAAGACTCAAATCTTTCTCCCTATGAATTTTAAGGATAACCATGGAATAGCCCTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAAATGGGCAGCCCGAAAGACTCAAATCTTTCTCCCTATGAATTTTAAGGATAACCATGGAATAGCCCTGAT  296

Query  297  GGCATATATTTCCGAAGCTCAAGAGCAAACTCCCTTTTACCATCTGTTCAGTGAAGCTGTGAAGATGGCTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCATATATTTCCGAAGCTCAAGAGCAAACTCCCTTTTACCATCTGTTCAGTGAAGCTGTGAAGATGGCTGGCC  370

Query  371  AATCTCGAGAAGATTATATCTATGGCTTCCAGTTCAAAGCTTTCCACTTTTACCTCACAAGAGCCCTGCAGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTCGAGAAGATTATATCTATGGCTTCCAGTTCAAAGCTTTCCACTTTTACCTCACAAGAGCCCTGCAGTTG  444

Query  445  CTGAGAAAACCTTGTGAGGCCAGTTCCAAAACTGTGGTATATAGAACAAGCCAGGGCACTTCATTTACATTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAGAAAACCTTGTGAGGCCAGTTCCAAAACTGTGGTATATAGAACAAGCCAGGGCACTTCATTTACATTTGG  518

Query  519  AGGGCTAAACCAAGCCAGGTTTGGCCATTTTACCTTGGCATATTCAGCCAAACCTCAGGCTGCTAATGACCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGCTAAACCAAGCCAGGTTTGGCCATTTTACCTTGGCATATTCAGCCAAACCTCAGGCTGCTAATGACCAGC  592

Query  593  TCACTGTGTTATCCATCTACACATGCCTTGGAGTTGACATTGAAAATTTTCTTGATAAAGAAAGTGAAAGAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCACTGTGTTATCCATCTACACATGCCTTGGAGTTGACATTGAAAATTTTCTTGATAAAGAAAGTGAAAGAATT  666

Query  667  ACTTTAATACCTCTGAATGAGGTTTTTCAAGTGTCACAGGAGGGGGCTGGCAATAACCTTATCCTTCAAAGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTTTAATACCTCTGAATGAGGTTTTTCAAGTGTCACAGGAGGGGGCTGGCAATAACCTTATCCTTCAAAGCAT  740

Query  741  AAACAAGACCTGCAGCCATTATGAGTGTGCATTTCTAGGTGGACTAAAAACCGAAAACTGTATTGAGAACCTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAACAAGACCTGCAGCCATTATGAGTGTGCATTTCTAGGTGGACTAAAAACCGAAAACTGTATTGAGAACCTAG  814

Query  815  AATATTTTCAACCCATCTATGTCTACAACCCTGGTGAGAAAAACCAGAAGCTTGAAGACCATAGTGAGAAAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATATTTTCAACCCATCTATGTCTACAACCCTGGTGAGAAAAACCAGAAGCTTGAAGACCATAGTGAGAAAAAC  888

Query  889  TGGAAGCTTGAAGACCATGGTGAGAAAAACCAGAAGCTTGAAGACCATGGTGTGAAAATCCTTGAACCCACCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGAAGCTTGAAGACCATGGTGAGAAAAACCAGAAGCTTGAAGACCATGGTGTGAAAATCCTTGAACCCACCCA  962

Query  963  AATACCTGGAATGAAAATTCCAGAACCTTTTCCACTACCTG--------AAGATAAAAGTCAAGGAAATATC--  1026
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |.||||.||.|.||.||||.|.|  
Sbjct  963  AATACCTGGAATGAAAATTCCAGAACCTTTTCCACTACCTGGAATAAAAATGATACAACTGAATGAAAAACCTG  1036

Query 1027  --AACA-ATCC--TACTCCAGGT-------CCAGTTCCTG--TTCCAGGTC-----CCAAAAGC----------  1071
              ||.| ||.|  ||.|...|||       |||     ||  |||.|.|||     |||.||.|          
Sbjct 1037  GTAATATATTCTTTATTGGGGGTGGAGGCACCA-----TGGATTCTAAGTCCTTTACCATAATCATTCAGTTAG  1105

Query 1072  --CATCCTTCTG--------------CATCCTTGGGC---AAACTGCTGCTTC------CACAGTTT-------  1113
              ||..|||.||              ||||  |||||   |.|||     |||      |.||||.|       
Sbjct 1106  TTCAGTCTTATGGGGTCTGGGGAAGACATC--TGGGCTGTACACT-----TTCCGATATCCCAGTCTGCAAGCC  1172

Query 1114  -----GGGA---TGGTCATCATTTTAATCAGTGT--------TTCTGCTATAAATCTCTTTGTTGCTCTG----  1167
                 ||||   ||.|.|..||||...|||||||        ..|||||||       |..|.|.|||||    
Sbjct 1173  AGACAGGGAAAGTGTTGAGAATTTCTTTCAGTGTGAGCAGCAGGCTGCTAT-------TACGGTTCTCTGGGCC  1239

Query 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167
                                                                                      
Sbjct 1240  AAACATCAAAAAAGGCACTTGATCTTAAACTGGAACAGTTGGCTTCCAGCTGGGCCTGTCTATTCCAGAATGAG  1313

Query 1168  ----------------------------------------------------------  1167
                                                                      
Sbjct 1314  GCAGGCTTCTCAGGGTGAAGGAATCTGTAGACATAGAAATAGCATCATCCAAGAACTG  1371