Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489366
• Subject: NM_001164733.1
• Aligned Length: 1663
• Identities: 1466
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGCAGCAAGTCTTGGAAAACCTTACGGAGCTGCCCTCGTCTACTGGAGCAGAAGAAATAGACCTAATTTTCCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCAAGTTTTGGAAAACCTTACAGAGCTGCCCTCATCTACAGGAGCAGAGGAGATAGACCTAATTTTCCT  74

Query   75  CAAGGGAATTATGGAGAATCCTATTGTAAAATCACTTGCTAAGGCTCATGAGAGGCTAGAAGATTCCAAACTAG  148
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||
Sbjct   75  CAAGGGGATTATGGAGAATCCTATTGTGAAGTCACTTGCTAAGGCTCATGAGAGACTTGAAGATTCAAAGTTAG  148

Query  149  AAGCTGTCAGTGACAATAACTTGGAATTAGTCAATGAAATTCTTGAAGACATCACTCCTCTAATAAATGTGGAT  222
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|.|||||||
Sbjct  149  AAGCTGTGAGTGACAATAACTTGGAATTAGTGAATGAAATTCTTGAAGATATCACTCCTCTGATTAGTGTGGAT  222

Query  223  GAAAATGTGGCAGAATTGGTTGGTATACTCAAAGAACCTCACTTCCAGTCACTGTTGGAGGCCCATGATATTGT  296
            ||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAATGTGGCAGAGCTAGTTGGGATACTCAAGGAGCCTCACTTCCAGTCGCTCCTGGAGGCCCATGATATTGT  296

Query  297  GGCATCAAAGTGTTATGATTCACCTCCATCAAGCCCAGAAATGAATAATTCTTCTATCAATAATCAGTTATTAC  370
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||   |||.|
Sbjct  297  GGCATCAAAGTGTTATGATTCGCCTCCTTCCAGCCCAGAAATGAATATTCCTTCTCTCAATAATCA---ATTGC  367

Query  371  CAGTAGATGCCATTCGTATTCTTGGTATTCACAAAAGAGCTGGGGAACCACTGGGTGTGACATTTAGGGTTGAA  444
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||||||
Sbjct  368  CAGTAGATGCCATCCGTATTCTCGGTATTCACAAAAAAGCTGGAGAGCCATTGGGTGTAACATTTAGAGTTGAA  441

Query  445  AATAATGATCTGGTAATTGCCCGAATCCTCCATGGGGGAATGATAGATCGACAAGGTCTACTTCATGTGGGAGA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  442  AATAATGATCTGGTAATCGCCCGAATCCTTCATGGAGGAATGATAGATCGACAAGGTCTGCTTCACGTGGGAGA  515

Query  519  TATAATTAAAGAAGTCAATGGCCATGAGGTTGGAAATAATCCAAAGGAATTACAAGAATTACTGAAAAATATTA  592
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  516  TATCATTAAGGAAGTCAATGGTCATGAGGTTGGAAACAATCCAAAGGAATTACAAGAATTATTGAAAAATATTA  589

Query  593  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATCTTACCAAGTTATAGAGATACCATTACTCCTCA-------------------  647
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||                   
Sbjct  590  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATTTTACCAAGTTACAGAGATACTATTACTCCTCAGCAGAGTTACGTCAATATG  663

Query  648  -----------------------ACAGGTATTTGTGAAGTGTCATTTTGATTATAATCCATACAATGACAACCT  698
                                   .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  664  GAGAGGCACCCAGCCCACGTCCGTCAGGTATTTGTCAAGTGTCATTTTGATTATAATCCATTCAATGATAACCT  737

Query  699  AATACCTTGCAAAGAAGCAGGATTGAAGTTTTCCAAAGGAGAAATTCTTCAGATTGTAAATAGAGAAGATCCAA  772
            .|||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  738  GATACCCTGCAAAGAAGCAGGACTAAAATTTTCCAAAGGAGAAATTCTTCAGATTGTAAACAGAGAAGACCCAA  811

Query  773  ATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTAAAAGAGGGAGGAAGCGCTGGTCTCATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAG  846
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTGAAAGAGGGAGGAAGTGCTGGTCTGATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAG  885

Query  847  AGAAAGGCATTTGTTAGAAGAGACTGGGACAATTCAGGACCTTTTTGTGGAACTATAAGTAGCAAAAAAAAGAA  920
            |||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.||||||||
Sbjct  886  AGAAAGGCATTTGTTCGCCGAGACTGGGACAATTCAGGACCCTTTTGTGGAACTATAAGCAACAAGAAAAAGAA  959

Query  921  AAAGATGATGTATCTCACAACCAGAAATGCAGAATTTGATCGTCATGAAATCCAGATATATGAGGAGGTAGCCA  994
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  960  AAAGATGATGTACCTCACAACCAGGAATGCAGAGTTTGATCGTCATGAAATTCAGATCTATGAGGAAGTAGCAA  1033

Query  995  AAATGCCTCCCTTCCAGAGAAAAACATTAGTATTGATAGGAGCTCAAGGTGTAGGCCGAAGAAGCTTGAAAAAC  1068
            |||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||
Sbjct 1034  AAATGCCACCCTTCCAACGGAAAACGTTAGTTTTGATCGGAGCTCAAGGTGTGGGCAGAAGGAGCTTGAAAAAC  1107

Query 1069  AGGTTCATAGTATTGAATCCCACTAGATTTGGAACTACGGTGCCATTTACTTCACGGAAACCAAGGGAAGATGA  1142
            ||||||||||||.|||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1108  AGGTTCATAGTACTGAATCCTGCTAGATTTGGAACAACGGTGCCATTTACTTCACGGAAGCCAAGAGAAGACGA  1181

Query 1143  AAAAGATGGCCAGGCATATAAGTTTGTGTCACGATCTGAGATGGAAGCAGATATTAAAGCTGGAAAGTATTTGG  1216
            |||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1182  AAAGGATGGACAAGCATATAAATTTGTGTCCCGATCAGAGATGGAAGCAGATATTAAGGCTGGGAAGTATTTGG  1255

Query 1217  AACATGGGGAATATGAAGGAAATCTCTATGGAACCAAAATTGATTCTATTCTTGAGGTTGTCCAAACTGGACGG  1290
            |.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1256  AGCATGGGGAGTACGAAGGAAACCTGTATGGAACCAAGATCGACTCTATTCTCGAGGTTGTCCAGACTGGGCGG  1329

Query 1291  ACTTGCATTCTGGATGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTATTGAGGACATCAGAGTTTATGCCCTATGTGGTATT  1364
            |||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1330  ACTTGCATTTTGGACGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTGTTAAGGACTTCTGAATTCATGCCTTATGTGGTGTT  1403

Query 1365  TATTGCGGCTCCGGAGCTAGAGACGTTACGTGCCATGCACAAGGCTGTGGTGGATGCAGGAATCACTACCAAGC  1438
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1404  TATTGCTGCTCCAGAGCTAGAGACCTTGCGTGCCATGCACAAGGCTGTGGTGGATGCGGGAATCACCACCAAGC  1477

Query 1439  TTCTGACCGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTGCACGGATTCAGAGAGCATACAACCACTATTTT  1512
            ||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1478  TTTTGACGGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTGCCCGAATTCAGAGAGCATACAACCACTACTTT  1551

Query 1513  GATTTGATCATCATAAATGATAATCTAGACAAAGCCTTTGAAAAACTGCAAACTGCCATAGAGAAACTGAGAAT  1586
            ||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1552  GATTTGATCATCGTAAATGACAATCTAGACAAAGCCTTTGAGAAACTACAAACTGCCATTGAGAAACTGAGGAT  1625

Query 1587  GGAACCACAGTGGGTCCCAATCAGCTGGGTTTACG  1621
            |||.|||||||||||||||||.||||||||.||| 
Sbjct 1626  GGAGCCACAGTGGGTCCCAATTAGCTGGGTGTAC-  1659